Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038464
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:1806424-1809962[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence TCGAATCGATTGCATCCTTGGATGTAAGCACGTCATCTGAGAAGGTTCCACCAACTCCACACCGAATACCCCCAAGTCCATCTAGATTCGCACAATCTCCCGACGTCTTCTCCTTTGGCATACTGCTTGTGGAAATTCTCTCTGCTCGCCGACCGGTAGAACTGAAGCGGGCTGCTGAAGAGAGAATAACTATCAGATGG
Tissues pistil
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TCGAATCGATTGCATCCTTGGATGTAAGCACGTCATCTGAGAAGGTTCCACCAACTCCACACCGAATACCCCCAAGTCCATCTAGATTCGCACAATCTCCACAAATTGCTCGAGTTGGATCTGTGAACTTAACTGTGCAGCAGATTCTGAGGGCTACTCAGAATTTCTCACCTTCATTTAAGTTAGGTGAAGGAGGATTTGGGACAGTCTACAGAGCTGTATTGCCAGATGGCCAGGTGGTTGCAGTAAAGAGAGCCAAAAAGGTAATTCCATCAGCTCACTCAATCTGTGATTTTACCTTCTTTTTTTTTTTTTTACCTCTAATCAATTTGTTGATTCATCATCAATCATGTTGATTGTAATGTATTATCCCAGTTTGATTTAGATTATGAATGGATTATTGCGCAGATTATCTACTCGATTATAGTGATAAATTAAATATTTTAAGAAATAAATTTAACAAATGGTTTGAAATAAGTGGTCTAGGCAATGCGGTAGAAGAATTTTAAAGAAACTGTGTTTTCCGAAGCGTGGAGCAAATGATCTGGTGAATAAGCTGAAAAGAACAGGGCCAATGCGTAAAGTACACTAGCGGCCCTCTTACAGTGTCAGTCATGCCACTAAACTTTTAAATTGCAGATTTAGGTTCTTAAACTTGTTTATCATAACTCTCTAGAGAGCGATGTGATATGCCAACTTAGAGCCGACATGGTGTGTGGGAACACATAAGCTATGTGTGAGCTTGGTATAGATGGGATATATGCATATATTCCCTTCTACACTGCTCATGTCATCTTGTATGTCACGTCAGCTCCAAGTTAGCATGCCACATAGGCTCTTGAAGAGGGTATGGGCACATTTGGACTCATGATGGTACGTTAAACAACTATAAAGGCCTAAATCTGCAATTTGAAAGTGTAGGGACCTGGATGACACTATTCGGCAAGTTTAAGGACCACTGGTACACGTTGCTCCTTTTATATCACTATGTTGGGGTTAATTAGAATATCTATGGGTGAATACACTGCTCTTAGGATTTGGATTAAGTTACTCCCTCAGGTAAAAAATGATGTTTGATTTTTTTTTTCGTGGTCCTCAAGGTGCCTTACCCATAATTTTATATGAGAATAAATTTATATAATATTGTAAGTGTTTACACCCAAATTTGGCACCTAGGTTCAAATTAAGGAATTATTGCCAAGATTTGGAAAAATTGCCGGTTTCCTCCACAGGGCCGGTCAGACCGCCGTATGTTGGCCGGTCAGACCGTTGCTTGAGGGCCGGTCTGACCGGCGGTGCGTGCCGCCGGTCAGACCGGCTGAGTCCGAGCCCGAGTCTGTTTTTCGTCGGGTCTCGGGTTTCCTTGCTCGGGAAGGCATGTTTCGGGTTTCCATTGGTTTCTACCCCGAGTTGGACGTGGAGGACTTGTAGGAGGCAAGACCAACCCCTATCTAAGGGACAAGGCCGGTTTGATCGAGATATTTCTCTTCCTCAAACACAATCGAATCGTTCTTTTATCTTTACTTTAGCCATGTTTTCTACTTTACTCTAGTTTTAGTTCATCTTTGTCGATTTGCGCCGTAAATCGTCTGCCGTCGCTCGAGAGTGCAATTACCCCTTTGTAGGTTTGTCCCGTAAACCTTCCGTTTGCCCACGAGACGGGCAGTTATCCTCATATCGATCTAAATCAGCTTAGAGGCTGATTTTGATCTCTAAATCGGCTCCGCTGGCCGGTTTAGCTTTTTTTTCTACAAAACCCATCTTGATTTGTCTTTTGGCTAGATTGGGGTGGTTGGCGATTCCATATCACCGCAAGGCGTTTAGGTGTCCCGATCGTGATTGTCTTCTTGTCAAAAAAAAGTTGCCAACAATAAGTTTATGATGTTATGAAATTACATTTCAGGATAAATCTACGTACCATTTTTATGTTTTCAAACTTAGTACTTTATTAGAAGTCGCTGATAGTCAGATCCTATCCAAAACATCAAGTATTTATGACCAGACGAAGTATTTGGTTTACTGCCTGCTAATGGGTTTGACTATTTTTTGTGCACAGGATCAATTCGCAGGTCCCAGAGATGAGTTTAGCAATGAAGTAGAATTGCTTGCTAAGATTGACCACCGGAATTTGGTGAGGTTGCTGGGATTTACTGATAAGGGACATGAACGTATCATTATCACTGAGTATGTTCCAAATGGCACTCTGAGGGAGCATCTTGATGGTACATTGCACTTTCTGATTTATTCTCTTCATTGCCATTTGTGTGTTTCCAAATTTCCATATTAATAAATATTTCTGCATTCTGCAGGCCAATATGGAAGAACCCTGGATTTTAATCAGCGTCTCGAAATCGCAATTGATGTTGCACATGCACTGACTTATCTTCATCTATATGCTGGTAAGCCATCTCTGTTTTTCCTTGGATCAATATTGATGTGATGCGCTCATCTATACCTTCTATAGAGATGTGCCTGCCAGCACAACTCTAATGCCCATCGGACTACTAAATCACCAGCACCATTAAGTTCCTTGTGTAGTGAGCATTCCTTTTTGGCCATCTCGAGTTCTCTCCACAGTGCGGGTCGATCATCATGCCCTGTGTAGCAAAGAAGATGACCTATTCTCTCTCCCTTTATTTATTTCTATCACATGCAATCTGAATATGCAAGGAAATTTATTTTTATGAATTTTGCGAAGTCCATACACATTTTCTACCACATCAGATGCCGAAGTGGCAAACCACCTTGAAGACCCCTCTAAAGGAGTTATTTAAATGTTTTTGCATAGATCAGAAGTTTCCTGGGATGGTTTATAGTTTAGAGGATCTATTAGACTTTTTCCTTGTTAATTTGGTTGCATAATTTCTATTTTGAAATAACACTAGTGCCAATTTTCTATATTTGTATTTGAGTAAATTTCAGAAAGCTACAACTATTTTGTCAAAACTATCAGTATGGTTTAGCTAAGCATTTCAGAGAACTGCAACAATAGCATACGATTTTATCAAAAAGCTGTAACTTTATATCTCTACAATTTTGGCCCCACCTATCATACACATGACGTACACATGCTTTATGCAAATCGGGCCCACATGCCATACACACATAAGGGAGAAAATTTCATATTGATGAAATCATTTGCTATTGCTGCGGTTTTATGAAATTCACACTTTTTATTTTGATGAAGTTTGATTTTAATAATACTGTATTGCTATCTGATAATTTCTCCGATGTGAACAGAGAAGACAATAATTCATCGGGATGTGAAGTCATCAAACATCCTGCTGACAGAGAGCTACCGGGCCAAGGTGTCTGACTTTGGATTTGCAAGAAGTGGCCCCAGTGACACAGAAAAGACACACATCTCAACAAAAGTAAAAGGAACCGCTGGCTACCTTGATCCTGAGTATCTGAGAACATACCAGTTGACTCCTAAGAGCGACGTCTTCTCCTTTGGCATACTGCTTGTGGAAATTCTCTCTGCTCGCCGACCGGTAGAACTGAAGCGGGCTGCTGAAGAGAGAATAACTATCAGATGG