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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038448
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:1644035-1646363[NA]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type intergenic
Splice junction sequence GCTGTTGCACTGAAGATTGAACTAGAGAGAGAGCATGTACGTGGTACAAATGTGCTAAAGAATATGAACAATCGTGTGAAACAACTCCAGAAACAAATTCAACATTTGGGGGACAGAGAGTTCGGAACCTCTTGAAGTCAATAGAAAGACAGGAAAGAAGATTCAACATCCCGCCTCTTGGTCCTATAGGAGTTCATGTG
Tissues root
Exon boundary No-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GCTGTTGCACTGAAGATTGAACTAGAGAGAGAGCATGTACGTGGTACAAATGTGCTAAAGAATATGAACAATCGTGTGAAACAACTCCAGAAACAAATTCATGATTTCCGGGAGCAGTATATTCAATACACGCAGGTTACATTTTTGGCGTTTCTTTATATGCTTCAATTTCCATGCTGGTGGGGAAGTCGTTTAACCTCCTTACCAACTTATTTTACATATTCTAGGACTGGCTCTGCTGTCATTCTCATTTTTTAATTGAATGTAGTATTCATGGTTAATTTCTGAAATATGTTTGAAGACAATTTGTTAAATAAATTTTCCAGCAGACAATAGGAATCAATAAAAGTAGTTCATCTGTGTACAAATTCCAATTAAAAGGTCAATGCAAAGCACAATCTTTTCTGTATTGCATCATATCCTGGCACGCAGGTTATGTATCTTATTGACAATTGTGACTAGTCACTAGTCGTAAGGTGACAAAGAGGGTATTTGTATGCAATTTTATTTACCTCTTAAAAGAAAGTCTTTGATTTTTCATTTTTTTTACGGTTATTATAAAAAACGAAATAATCAGTAAAACTGCATACTACCTGTTCTTTAACATATGCTTCCAAGTGCCATGCCTCTTTATTATTTCTGTACTACCTCCTTCCAAAATATAACAACTTCTAGCTATGTATCTGGACAAGCGCATATTTTGGGACGGAGGGATTAGTATTTTGGCTGTACATTTTCCAGTTTTCCTATCGTATCTGAACCATTTCTTTGTTAAACTAAAGGATGAATCATCTAAAGCTGAGAACGACAAGTGTGAAATACAGAAGGAGATAAATTCTCTTCATTCAAATGTTACAAGGTAACTCAGTTATCCTTATACTTTAGCAATCCTACCATTTCCTGGTTGTGTGATTTTGCATAATGTGCCATTTAGGTTAAAAGAGGAAGAAAGAGGGTTGCATGAAACACAAATGGGCATTGTAAAATCCATCCAAAACATGGAAACAGAGGTATTTGTCATCCAATGTGGTTACCTCTTACCTCTTACTAGCTGGTGGTAATGTACCCTAAACAAGGTTTATTCATCTCATCTTACCTCACTATCTGGTGGTTATGTTCTCTGAGTAATGCGCTCTGTTGTATAGCCAGAAAGTCTGCTTTCCTCTCTGATATATTAAGCTCTTGAAATATTAACAATCTTGACACTATTACCTCATCTATATTATACTATGATTAAATCTGATTTCATTATTACTTAATGGCCTCTATTATCTTTTGGCCTTGTGAATATATACCTTGGATAATGGTATATGGAATATCTTTAACGGTGCGTTCTGATGTGAGTTTGGCTTTTGCAACTCCCTCGTTGCCTATGAACACACTTCGCAAACTGCTAAACAATGTGTTTTTTGAAAACAAAATTATATAGAAGTTTCCTTAAAAAAAATCAAATAAACCCATTTTGCAAGTTTGCAATAATTAATAACACTCAATTAATCATGTGCTAATGGCTTGCCTCAGTTTGCGTGCCACGGAAAATCCCACTTGAAACGCACTACCGAACTCAGCCTAAGTCATACTACTTCTCAGTCATTTGTTGTACTTCTTTTTAGTGCTAATTAGTGTTGTTGAGAAGCTACTCGTAGAGTAGGATGCACATAACAAAACCTCTTTTTGTATATGACATTGTCTTATTTACACGATTGTGACATGGCCCATAAGAAATGTTGATTTCTTTTTTCTAAATGTTTTTTACGGTGATAACTTTAATGTTGTGCGATAGTACATTTACATGAGAGCACTATCTTGTGAGCTGTTAAACCTGCAAGCTCATTCAGTTTCAAGCTCATTGGGCTTTGGTTTGTATCAACTACCTTTTGAAGCTGTCTCCCTTTAATGTTTGTGTGAAGAATCATCGTTTATAAAGTTAGAATTATGTGCACCATATGAAGTTCACAAGGAATTCCATGTTTTTCTGTATTTTGACCAACTTTTGTCTTTGGACCATGTTGGTCTTTGTCTACAATATTTTCCAATATGTGTTATTTTGCAGATAGTTGAAAACAGAAAGAAGATTACTCAATTTAAAGCTCACATTCGTGATCTTCAACAACGTCAATCTGATAAGGTCCTTTCTGATTATAACCCTGTTTCCCAAGCATAATTTTTAGTTGTAGATATTTTGTTAGCACCTTATTTATATGCTACTGGTGCTATACCTCAGGTATCAACATTTGGGGGACAGAGAGTTCGGAACCTCTTGAAGTCAATAGAAAGACAGGAAAGAAGATTCAACATCCCGCCTCTTGGTCCTATAGGAGTTCATGTG