Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038397
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:882800-885581[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type exonic
Splice junction sequence GCTCCATCTACTGATGTAGCAGTTCAAGAGTTGAGTCATACAACCGCCGAAGTTAGTGAAATAGTCTTTTTCTTGCTCGGTGCAATGACCATTGTTGAGAGATATCTGCAAATGCTGGGGGTGCATGGACACCAATTGGTGATGTGACGACCACTATGTTGTGGATTCATGGTCAGATTACAACGTTGAACACAATGCAG
Tissues root
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GCTCCATCTACTGATGTAGCAGTTCAAGAGTTGAGTCATACAACCGCCGAAGTTAGTGAAATAGTCTTTTTCTTGCTCGGTGCAATGACCATTGTTGAGATTGTTGATGCACATCAAGGATTTAAGCTAGTGACTGACAATATATCTACTCGAAATCCAAGAACTCTTCTCTGGGTGGTGAGTTTTTTGTTTTTTACATATGCTTTGATCATTGAATATTCTGTTATATTGGTAGATTGTATACGCTATAATTCTCAATGACATAATTTCAATGGATGGGTTCCTGTTGTTGATGCCGTGTTACCAAAATGGCCTAGAACCACACTCTTTCTGAGGTTAAGAACAGATCTTTGTGCAGCTGAGTCTATAAGTTTTATTATCCTTCCCCTCCCTTTTTGACAGGAGATCTGATTTATCCTTCTAATTCCTTCCAATCGCCACTCAGGCCATGATATGTAGCAAAACCAAATAAATTCTGCTGTCTATATGTGATATCAGCAAATGCAAGAGTTTGTTCTGTGGATAAATAATTTTGACCATATTCATAGACAAATTCCAGTCTATACCCACAAAATGCAAGAATGAATTGGATTACATTTTTATTTAGAAATAAAATCTTGACAAACATCCCTGAGATGTAAATTTCTCGAGTACATGCTGAATTAATGTGGCATATGAATTACTATGCTTCCTAGAATAAACTGTTAGTTCAATACTGGCAATATCATAAGCTTGTATCCTCTTTAGAACAAGGAGGTCAAGTATTTGATGTTAAAATTTTATCCACTGAGAATTCTGATTTTGGAAGAGGAGAAATATTTCCTTGAAATCCAAAACTGGTTTGATATATTAATCTATTCTTATTTTTGTCCATGCACATTTTACTTCTCTTGTTCTGAGTAACTTCTTTCATTATTTTTTATATGATAGATCATTTATTTCCTACTATTTCCTTATAGGCAACTTCTAATCATGCCTTCATCTCTAGCTACATAATTTATTTGGTAAATAAAGGAAATATTTGATTTCATAAGCTAATCAATATTAAACCTTGGATTAATATATTCTTATTTCTGTTATTTTCATCATGTTGCTTTGTAACACAAGGATTTTTCTGTTTTCCAGATAGGGTTTGTAACTTTCTTCTTGAGTTCTATCCTTGACAATTTGACTTCCACTATTGTGATGGTTTCATTGCTTCGGAAACTAGTACCTCCATCAGAGTACAGAAAGTACGAATTTCCATAATCTCTTATATCACTTTTGTACATGCTCTGGTAATTTTTCTCTATTGTTTTGTACGGATTTGATTTTCAGTGGTCAAATACTTGCATGCTAAATAAATTCAATTATTTTATGTTTGCTCTGTTTACAGGATTAGTTTCAAAATATTGTGTTGGCATCTTTGCATAGTTGTTTTTTCCATAAAAAAATTTTTATTCACTACAGGTTTAGCATTTTGACATTTCATTGCTTGATTTTGCTTAATTGCTGTACGACCCACAGTTTGATCTTCTTACTCGTGCTATGCACATGTCTTTGCTGAAGCTTTGTCGAACGAAATGTATTACACAAATGCTTGAAAATGATTTATATGTTGATAATATGTGGTTTGGTTGCAGTATATGTAGGCTGGTCCAGTTAAATATGAGTTACAGATGCTTTTAAGGAAATATATTATACTAAACACAATTTAATAACTTACAGTATTTCTTCACATGTCTCAAGAAATTTTCTTTATGATGATCGTCCCACCTTATTGCACAGAGCCACAGTATACCAAAGAGTTCAAGTTAGTAGGGGAAGTATGTACTGCAGTTGATCATCTGGTTCAAGGGTGCAAGCACCGCAGGATTGGGATGAGAATTATGATTTGAGGTCAGATCTCATCTTATGTTTGGGCAGGATTTAGGGATAGCAGGGATGGTTATGGGATTTGGGATATAAGGTTAGATCTCATCTACTATTTGGATAGGGGAATTGAGAAAATGATGGAGAGCTACGATCACCCCTATAATACCTAGGCCTAGCTCACTTCTGCTATCCCTATGTCCCTATGCCTTGACACCTCCCTGGTTTAGGCAAGAAATCTGCTTGAAAAGCTCCCCCCCCCCCAAAAAAAAATAAATAAAAATGATGAGATAGTTTGAAATGTATGGAGAAGTTAAGATTAAAATCATATATGGTGGGACAAGAATTGAATAGGCAGTTAATCGGCTGACCTGCCAACCTCGAGAAATAAGAGCGAACCTTTTCCTTCCTCTTACCATGTAACGTTCCCTTTCGAACATGATTTTTTTTTCCTGGATTCCTCTGTGCACTGAATTAATTTTTGCAAAATTCTACATTCCAAATTATGGTTCAAATGTAACAGAAATAAGAGGCTCATAGTTGTAGCCAACATTCCATTTCTATTTCTCGAAGTTAGCTGTTGTTAGGCCAGTCCATTACGTCCTTCTTGGTTTGTTTGAGGAATATTTTGTGCCAATTTGAGGTGAACCTGGTGTGTCTTGCATACCTGCACCAAGTGGGATTTTTTTACACTAGGCATTTTGACATTTAGCTTTTAATGTACACGACATCATAAGTTACAAGAAATTGTTTGGAAGAATGTCTTGCATCCTGACCTCCTGAGTTTTCCCTATTGTTTTATTGGGACAGATTGTTAGGCGCTGTTGTTGTGATATCTGCAAATGCTGGGGGTGCATGGACACCAATTGGTGATGTGACGACCACTATGTTGTGGATTCATGGTCAGATTACAACGTTGAACACAATGCAG