Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038384
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:438802-441178[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence GTTTCAGCAAAAGATCAATTAATGCCTGGTGATATCCTCTTTCTGCCTGTTAATCTCAAAGAATCTTCGGTTGCTGAGAAGACTAAGAAATTTGATAACAGATGGTAAGTCTGAGCGTCTGACTATTAGGGCCAGTTCAAATGCTGCTTCTGTTCAGGATGCTTTGACAGAGTACAGAGTGATTGAATCTTGCCCCCAAG
Tissues shoot, root
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTTTCAGCAAAAGATCAATTAATGCCTGGTGATATCCTCTTTCTGCCTGTTAATCTCAAAGAATCTTCGGTTGCTGAGAAGACTAAGAAATTTGATAACAGGAATGAGATTAATTTTCTGCGTGGCCTTGAGATTTACAAGGTGTTAGTTTATTAGACTTTTCAAAAGTACTTTAATTGTTTTGGATGGTAAATGATCCCCTTTGGTGTTTTAAAACTTTCAGGATGAAGCCATCATCGTGGTCAACAAACCCCCTGGAATGCCGGTTCAGGTAGGTATCTTTGTATACGTGTATTCCACTAAATTTTTCAGTGCCTAGTTTTGAACTTTTTTCCTCTCTGTTCTGAAGGGCGGTGTTGGCATTAAAAACAGTATAGATGTATTGGCCTCCATGTTTGAAGAAAATTCTTCTGAAGCACCTCGTTTGGTGAGTTCACTACTTTCTGTTTGTGAGACACATGGTTCCTAGAACTCAGTATATGCGTGTTTGGTTTGTGTACTCGGGGTTCTACCCCTTCTTTCTTCTTCTTAATATAATGGTACGTGGATCTCCTGCGTATTCAAGGAAAAAAAAAGAACTTAGTCACTTGTAGTGCACATTTTAAACATGGAAATTGTCGTGCAGACCTCCTATACCACATTCATTTGAAAAAGAGTAATTTCATAAAACTGCAAGTATTTTGGCAAAACTTTCAAGTTGCTGCACCTTTTACAAGGCAAGTACACTTTTCTCCAATGATAGCTTCCGATTTTATCATGTAAACTAAGATTACATGTGGTCTTGACTCTTCAGAAGTAGCATAGTCTCCTAATTATTCAAGCACTCATTTTACTCTTGGTGCCTCAGCAACAGCAAGTTAGTGCTGTATTGGCTGAATTATAAGATTGTTTGTGCTGATGTGCTTCACCAGGTTCATAGGCTTGATAGAGATTGTAGCGGCATCCTTGTTCTGGGTAGAAATCAACTTAGCACTTCAATGTTGCATGCAATATTTCGTGAGAAAACTGCTGATGCTTTAGCTGATGTAAGTTCAATTTACAGTCTGTTTATAATAATTATGTTCAATATTTGCACATTTTTATGACCTGATACCCTACAAGGCTATTATCTACATACTTATACCGTGATCATGTGTTTTATGTCAAGGGTACTCAACATGTACTGCAAAGAAAATATGTTGCTCTTGTAATTGGAACACCTAGACATCCCAAGGGTTTATTGTCAGCTCCACTTGCAAAGGTTTGTTAGAATATGCATTATAGTTCACTTCCGTTCTATTTATCACCAGTCTTTATAGTTAAGAAAGGTACACACTTCAGGTGCAAGAGATGCACAAAAAAATCTCTTGAGATACAATGCCATAAAGTAGTATATACTATCTGGAACTTAATGCGGCAAATGTGTTTAGCTGGACCAGCATTTTTTTATAAGCAATAAACTAATTGATACCACCAGCAACCGGCCAAGCTACTGAACTCTTTTAAGTGATGGCTTGACAAAATCGCATGCCTGTCTAATGGATATTGAGAAAGTTTGGTGATCACATATTGTGATTACATACATTTCATGGAGATTTGAATTTCAAAGGTATGAAAATCATCAAAACCTTGGGCAACCCTTGTTGAAGCTGGCAATTTCCACCTTGTTACAAGCAAAGTTTCTATGGAATTTGACTAATAGAGCATTAATAACACAAATTTTCATGCAGACTTGTTCTGTTTTAGACTGGCTAATAGCCGCTGCAGAATCACTTACTGATAGTCTTGGATTCCCAACGAACAATGATACTTAGCCAAACTACAATATGATGATGACTGTATGAGTATCTGTATCATATGCATATCATATATATATGACGATACTCTGATCTCAGATCCCATGATCACTCATTTAGATATCTAGTAAAAGCTCAAACAAAAAGAGATCAACCCACCACTTATACTCCTACCAATGTCTTATATTTACTACCATGACATTTTATGTAATCTTATTATCTAATTCTGTCGTAATATCTCTCCACATCTTTCTTACTGCCAAATACATATATATACTCAGTGAATCTGTTATCTCCACGTATTGGTGCAACATAGCCAGTGAAAAATGATCACATATGATTTTGTTCTATTTTTATGAGAACGCGCTGTTATTTTCATTCCAATGTAGTCTCTTCATCTACTATGTCTTTCCAGCTCAGCACAGTTAATCTCATTTTCAGATATAGTTTCTCCATTCATACTTCATTGGGATGTTCTTCTTTTTTGTAGATTCTATTACAAGATGGTAAGTCTGAGCGTCTGACTATTAGGGCCAGTTCAAATGCTGCTTCTGTTCAGGATGCTTTGACAGAGTACAGAGTGATTGAATCTTGCCCCCAAG