Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038168
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 8:28394933-28398638[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CCTCCGTTGAAAGCATCACATCTGAAGCTGGTAGCATCTTCAAAACCACTATTGATGGTCTAAGCGATTCTGCTACAGGGCTTACAGGTTTCACGAAATAAAGCCAAACTAACACTACAATAGCCTCTTCTGAGATACTTGTTAGAAAGAGTTTGGCATGGATTACAGGGATCATTCTTCTTGTCTCTACTCTCATTGGG
Tissues pistil
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CCTCCGTTGAAAGCATCACATCTGAAGCTGGTAGCATCTTCAAAACCACTATTGATGGTCTAAGCGATTCTGCTACAGGGCTTACAGGTTTCACGAAATATCTGGCAACTTCTTATCTTGGAAGCGCGCACATCTATACTTTTTTGGAACATGCCATTTTGTTATTGTAATTCATTTATCACATGCCTTGCAGATAAGGATGATCTAGTTATTGTTCATTCAGATGAATCTCCAGCTGTTGATTCAGGTTCTGAGTATTTTGATAGTGATCTCACTGACTTGGTAAGTTCGTCTTTCTTTAGGGAGGAAGTGGCATTATGCATAGCATTTATGGCGAACAAATTTTGCAGGCAAACTGGCTTGGTGGGTCCTATGAGAAGGTTGATGGCAAATTGATCATTCCCTTGGAGAGTGGAGAAAGTCTTACTTTGCTTATTACAAAGGTCAGCACCGTTTTATCCATTGCACAAATACACAAAATAGGTTCTCTTTGTTCATTTGCACATCTATGCATCTTGGATGCATGTGTTTTCTTTTTTTATGTCGCATACAACAGTCCTCAAAAGAAGGCAAAATTTCTCTGCTGATTATTACTACACTATCCTCAAAACATGCCAGTAAACTAGCACTTGATTATTACTACACTATCCTCTCTGCTGATTCATGTAAATGACAACCATTTCCCCTCTTGAATGTATTTCTTTTATGTTAAAGGCAAAATTTGTTACAGTGTCATGACCCGAGGCCATGACGCGATAACTACTGCCGAGAGGATAGCGGACGGCATTCTCTCCTGGAGAAGTGATGTAGATTTAGATTGGGGAGAAGAACATTAGGGGAATAGATTAGACTAATTGATATTCATCGCTTAACTCGAGATAATCCATCCTTTATATAGAGATGATATGACTCGGCCCTTATAAGAAACTAACTCAAACTAACTCTATCTAATCTTATCCTATCTCTGAACCAACTGATACAGTACTCGTGGTACTGTTCATCCGCTAGGACTTGGGCTCGTGGGCCTTGGCCTCTCAGCCCAATGCCCATGACACTACACCCCTCTTTTTGAGCAGCTCGTCCTGGAGCTGCAATGTGGTTCTCCTGACTTAAACAAAACCTAAAACAACTAAAATCCAAACCTTTTACATCTTGGCTGGATTTGTTATTATAAACTGAAAACAAATCTAATAACATTATGGAATGACTGGTCGTGATGGCATCATCAAACCTTGGTGGGCCCCATCCAAAAGCTGTCAAACAAAGGAGGATTTCATGCCTTGTCCCAAGCTTGGAAGCATAATTAATCTGATTTGAATAGGAGCTAGGAAATAGCCTTGACCAGCTCAAATGCACATGACGGCTGTAAGATCCTTCTTCCTCAAACTCAGCCCAGTGTGGATAAAGTTTCTTCCCAGGAAAAGGCCAATGCAACTTCTCACCGTTGGCATTGCCCCCCACGCCGCCAAGCAGTTCACTGCGTGCGTAGCTTCCTGCACTTGCGAAAACGACGCGCACTCCGTGCCAACAAATCGCGAGAATTGCAGTGCAACTAACTCAAACTAAGTCTATCTAATCTTATCCTATCTCCTAACCAACTGCTACAGTACCCGTGGTACTGTTCATCCTCTAGGACTTGAGCTTGTGGGCCTCGGCCTCCCAGGCCCAATGCCCATGACATACAGGACATTCGGAAGTTTGTGGTATTTGCTGCCAGACACCTAAAAAACGTGACACGGCTGTAGGACACCCCAAAAACTTGGTAATTTGCTGGGGGACACCGCCGCTGTTATTTTATCATTTACGAGCCAAATGAAGGGAGAAACCATGTGAAAAGGCGATTTTGACCCTTGGGACAGCAGGTTGTAACACAACTTGGTGTGGTTCAAACCAAACCCAGGACACATTCCCTCCCCTAAACCTATAAAATTGGTGGCAGCAGGAACGGCGTTGATGGTGGCGGCCATTATAAGCTGTTGCCACAAGGGCAACCTCATCTGTTGTAAATGTTTCTCGCGCCATTTGGCTTGGAAATGATAAAATAATATCCGCTGTGTCCCTCAGTAAATTACCAGGTTTTTGGTGTGTCCTATGGTCGTGTCACATTTTTGGGGTGTACAGTAGCAAAGATGGCAAACTACGAGTATCATGTAGCAAATTTTGCCTATGTTAAAATTGGATTAGGTGGTATTGTAATTTATTACTCTTTTTTGTCGGTTGAGATTGCTCACCGTGCCTCAGAACAATAATTTATTACTTGAAGTGGGCTGTAATAGTGTGTATCAATTCACTCGAAAACTATAAGAACTTAATTTGAATATTTTTTGGTGATAAATATAAAACTTGCATGTAAATTTAAGTGTGGTACTCTTACCCTACCATGACGTTATTTATTTCCTCTTGCTCATGTATTATCTGTTAATGTCAACCAGTATGCTTTCTCATCCTTTCGAAACATGTACTACTTGAACTATTTCCTCTAATAACACTTTCTCTTCTTCATCTCCCCTAAATACTTGTGGACAATCAGAATAAGAATTATTTCATCTAATAACACTTTCTCTCTACTTTATCTTCCCTAAATACTTGTGCACGATCAAAACAATCCTTATATAAATAACTGAGGGAGTACATGACCGCATTTGCATTTATGACATCTCAAGGCCCAAATTTCATTATAACTTGCATTTCTTTACAGGAAGCAGACATGGAATTTGCATCCAGCTTGATCTCCCTTCGTAAAACTATAAAAAGGGGTATTCAGGTTCATGAAGATTTCTCAGGAGGTGTCATGAGCCCTGCAGAGTTATTAGTATGCCACTTCAAAGGCATTAAGGTAAATTGTAAACATATTTTTTTAGCTAGCAGTTTGAAGATATAACTGATTTCTACAAACGTGTACTAATAACCTTGACACCTTTCCACCTAAATCCTACCTATCTGAACCCTTTTATCCTTGGTCCATCAAATGATTCTACGGTAGCATGATTAACTTGTTAATTTGACGGGTTCATGTAGGCTTTGGAAGAAGAATATGGTTCCACAGAAATTGTTAAGCAGGGAACTGATGTAGTCCGGACAGCTGTCACCAAAGCATTTGATTTACTACGTGGAGCATATAATGGTAAAGTTGACAAAAATTTCTTCAGTTCTGTTATGCATGCGTACATGCATTATCCCTTGAAGTTTGTTCAAGTTAAATTCTCCTGCGGTACTCAGGAACAAAGGAAAAAAGTGTTCTCATTTGTTCTTATTTGGAGGGATGGACTAAGAGCTGTAACATTAGCTAGCTGCTTAAAGTTATATTTGGTTATGTTTATGTTTTGGAATTGTCCATAGAGAAGTGGATATTGGCCCCTCCTCACTGGCAAATCAGTTGAACAATCTAGACCTGCCTCCGTCTCTCTCTGAAGGATTATTGTATTGTAGTTGTTACTTTTGCTATTATATAATCTTTACATTTGCAGAGCTTTGGCTTTGGTTTTAACAGCTTCGATGTTCTGATACAGGAAAAATTGTTGGGTTAGTAATATCCACAAAGGAGGCTTCACCATCCTTAGTGGGTCCAGCATCTTCACTGCACATTTCGAGATGGCTAAAAGAGACAAGCCAAACTAACACTACAATAGCCTCTTCTGAGATACTTGTTAGAAAGAGTTTGGCATGGATTACAGGGATCATTCTTCTTGTCTCTACTCTCATTGGG