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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038154
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 8:28372398-28374073[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method SMALT and Segemehl
Type exonic
Splice junction sequence CCAAAGAAAACTTCCTATTTTGATTGATGCCGAACGGAAGAGGGATGGATTGGACGAGCTTCTCAATTTCGCATCTTATGTTGTATGCTCTGCAAAATTTTGCTTCTGAGGCAGAGGAAATAGATGTAGAGAGTCTTCTGGAATCACTAGAGAAGAAAGAAGTTTTGAGTTCAAGCATGCCAAAATGCATCGCCTCCAAG
Tissues leaf
Exon boundary No-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CCAAAGAAAACTTCCTATTTTGATTGATGCCGAACGGAAGAGGGATGGATTGGACGAGCTTCTCAATTTCGCATCTTATGTTGTATGCTCTGCAAAATTTCCTCAGGTAACTAATTCTATTGCATAAGGGTTTAACCATTAAGCCCTGTCTGTATTCAGCAAGAAAAGTTCGCTTTAATGTGCATTATTTTTCTCCTGAAAAGTTATCTTAAGCTATTTTTCTCGTTTAAAACTGGTAAGTGTGTACGTTTGGCATTGCCTTGTGTCATCCGACTAATCACGATTAGTCATGATTAATCGTTCTGATCGGCATCAGTAGCTTGATTATGCACTCCGACACGATTAGCTTGATCAGAAAACTAGTTGTCCGACTAATCACCGACCAAACGCGATTACTCGTCCGGTTATGCTATGGACGACTAGTAAGAAGCTACCAAGCCATGCTTGATGCTTGGATTCCTTGCTTTCTTAACACTTTACACACATTTATTATAGTATGTTTGCATGGCATAGTACTAAATCACAGATTTACTACCATATATAGAAAAAAATCGTTATAATGTAGAGTTATACTTAACTACTTATACTATACACATTCTGGGTACCAGGACGACTAGACACCGACTAGCAATCGACTAACCGGACCTGATCAACGACTAATCGCGATTAGTCGTCTGATTGTTGCCCTTACAAAACTAACTTTAACTTACTATTTGAAAACAGGCTAGTCAAGAATTTGTATCTTCACTTTATTTCCCCATGATTCTGGCCTTAGTTCTTTTGGAACATGAAGGGACACTTAATGTCACTACCATGGTTCCAATGAATGGTGATGGCATGTAAAGTTTTGTGTTCAGAGGCTGAGTTTGATATTACGGGAAACTGTGTCTTGGTATCTCAGATTGCTACTTTCTAGTATTTCTTAATGACGTTTTTTTAATGTGAATAATGCAGGCTTGGACAGGAGCCTCATCAACACCGGTTGCTTTGGTGTCCATGCTTTTAAGATTGCCTAATATCAAGTTTATTATTGTAACCCTTGGAGAAAAGGGATGCTTGATGCTTGAAAGAAGCACAACAGGTGAGTTTACCGTACTGCTGCATGCCAATTCTAGCGAAGCTTTATAGAAAAAACATGGACTGTCATGTAGGAAATCACTGTATGAACAGAGCCCAGCAACATGGTGCACTGGTCTCACCATCCGCATAACCAGAAAATTAGAGATATGAGGTTTACTTATTTATTGAGTGCTAAACGATAATATCAGAGGTAGATATTAGAAAGGGTCATTAGGAAGTTATTTAAAGGAGACTTGGCATCTTCTGAATTAGCAAGCAAGAGATTATTCTGGTATTTCCCTTTATCTCCGTGCCCCTTCCATTCTCTAGCTGCGCTGTCACAACAGTTCTTGGCCGAGGAAGCCCAGGTCCTAACCAACTACCAAGCATAGTTATCCATTGTGCTCGATTGGGAGACATGACATGGACACCTGAGATATCCATTTTACTTGAAAAGAATTTATGTTTCTCTCCGTTATTTTTACAGAAAACTATAACATGCTGCTCAACTTGCAGATGCTTCTGAGGCAGAGGAAATAGATGTAGAGAGTCTTCTGGAATCACTAGAGAAGAAAGAAGTTTTGAGTTCAAGCATGCCAAAATGCATCGCCTCCAAG