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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038005
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 8:27772659-27791928[NA]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type intergenic
Splice junction sequence GATTCTTGACAACCTCCCGCTAGTTGTGCCTATTGCAAGGACAGATAGGGATGCTCTTGTTTTTCAGGGTGGATATCATGTTGGTGTTAAGGGCCAATATGAGAGCCCAAGATGTGTCAGATCGTCTGCAAAGCAACCATTAGCGATAAACAAGCAAAGGAGCTAAAGGAAAAGATAGAGGATGAGTACCGGGTGAACAT
Tissues root/seed
Exon boundary No-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GATTCTTGACAACCTCCCGCTAGTTGTGCCTATTGCAAGGACAGATAGGGATGCTCTTGTTTTTCAGGGTGGATATCATGTTGGTGTTAAGGGCCAATATGCTGGAGTAAGTATCTGTGCTCAGCTTACCATTTTTTGTTTGGAAGGTGAGTAATGATCTTACAAAAATATATTTTGCAGAGCAAGGATGAGAAGTACTTTATTCATAACCACCTGGCATTTTTAGTGAAGTATCACAAGGATGAAAATTCAGATCTCTCTAGAATTGTTGGGTTCGAGGTCAAACCATTTAGGTTCGTTCACTTAACCTTTTCATGTTTGTTTCATACAACGTCTTTGACATATTGGGCAAATTTTTTATTAGTCCCTCATGTGCATTTACTAAATTCCCTGACTCAGTGTTAAACACCAATTCGAAGAGAAATGGAATGATGCAAACACTCGTTTGAGCACATGTGATCCCCATGCCAACAAAATAGTAATAAACTCAGATACTCCTCAAGAGGTTGAAGCTGGGAAGGATATCATATTCACATATGATGTTGGCTTTGAGGTGATATTTTCATGACATCTCTTCTTTTCTTTTGTACTGTGACTCTGTTCCTTCACAGCTGTTCTTCGAGTGTTATCTTTATTTAAACAATCTCTTTTGGTTTTCTTGGCTGGGTCTTGTAGGAAAGTGATATCAAGTGGGCTTCTCGCTGGGACACCTATCTGCTTATGACAGATGATCAAATTCACTGGTTCTCTATTGTGAACTCTCTCATGATCGTGCTTTTCTTATCTGGAATGGTGGCCATGATCATGCTCCGCACTCTATATAGAGATATCTCCAGGTACAATCAACTTGAGACTGAAGAAGAAGCCCAGGAGGAAACTGGTTGGAAGCTTGTTCATGGAGATGTGTTCCGCCCACCAACTAACTCTGACTTACTCTGTGTCTATGTTGGCACTGGTGTCCAGTTCTTTGGTATGCTGCTGGTTACCATGATGTTTGCTGTCTTGGGTTTCCTTTCTCCATCAAACCGTGGAGGATTGATGACTGCGATGCTGCTCATTTGGGTCTTGATGGGGCTGTTTGCTGGATATGCTTCTTCCCGACTCTATAAGATGTTTAAAGGATCAGAATGGAAGAGCATCACCTTGAAGACTGCTTTCCTGTTTCCGGGAATTGCTTTTGGTATTTTCTTCGTCTTGAATGCTCTTATATGGGGGGAGAAATCATCAGGTGCTGTCCCTTTCTCCACAATGTTTGCCTTGGTGCTTCTTTGGTTCGGTATCTCGGTTCCACTTGTCTTTGTTGGGAGCTATCTTGGTTTCAAGAAACCTGCCATTGAGGCTCCAGTGAAGACCAACAAAATCCCGAGACAGGTCCCAGAGCAGGCTTGGTACATGAACCCTGCCTTCACCATTCTTATTGGCGGGATTCTTCCATTCGGAGCAGTTTTCATTGAGCTATTTTTCATCCTCACTTCAATCTGGCTTCACCAGTTCTACTACATCTTCGGCTTCCTTTTCCTCGTGTTCATTATCCTCATCATCACTTGTGCGGAGATTGCAATCGTGCTGTGCTACTTCCAGCTCTGCAGTGAGGATTACATGTGGTGGTGGAGGTCCTATCTTACTTCAGGATCATCTGCCATCTATCTCTTCCTGTATGCTGGGTTCTACTTCTTCACCAAGCTGCAGATTACTAAACTGGTGTCAGGCATTCTGTTCTTCGGCTACATGCTTCTGGCCTCATTCTCTTTCTTCGTGCTCACTGGCACAATTGGTTTCTGTGCCTGCTTGTGGTTCACGAGATTGATTTACTCATCTGTGAAGATTGACTAGGCGCAGAGTTGCTATACATCCGGCTTCCAATAGTTCTGTATGATTATTGTGGAGAATTGTGAGACGAGGATCAGAATCCACTTTGTATTTTGCCGATTTTCAAGAAAATTTATATCGTAGTTCTTAGTTTATAAACCACTGATGTTCATTCACTATAAATGAGATGATACATCTTTGATATGAGGTTATATAAGGCTAATTACGATTGTTAATTTCATATGGCAGAGCATATTTCTCAATTCTTATGGACCACTGTATACATTCATTTTATTATATACAGTTGCCGAATACTACTGTTTTCTGCATAACGTGCTTGGTAGTAATTGGTACTATCACCAGCAGCTGCTTTGCTCCGGTTTTTCTTTGGGTGAGTTGAAAAGTTGCCATATTGCTGTGTGACGTACGTGTAATCAGTCAGTCAGTTATTGCGGTCCAACCACGTATGTCGTGACCAGAGAAAACCAGTGCAGAAGGCACCGAAGCTTAGCTGCTCCTCCGCCGCCGTCCGCCGGCCAACTCGTCGTTGTCATATATGAGTGAGGCTTAGTGCTTCTCCCTCCTCAACGTCGCCGCCGGCCGACTCGCCGTCGTACCGTGAGGCTTTATTGGCTCCGATGAGGCAGCGGTTGATGCTACTGTTCATCCACGAATTCGGCATCGGATATAAAAGGGCATCCAAAACCTTAAAATAATCAAATTCAAGCTGTTCCCAGAAAAATCAAAATCTCAACACCTGATATCCAAAAACCTCCCATATGCCTCAAATGTTACCATAGACGACACGAGTTTGATATTGACGGCTAGCTACTAGATAAACTTGATAGCAGAAGAAAACACAACATGCCATGTTGCCATCCATTTGAACCAATCATATGATCTCTCTTGTTTTCTCAATCCTCATTTTGATTTATTAGTTTTACATAGTAGACAAATAAAGAGTAAATTGTCCCGGTATATCTGTGATGGTATTTTCAAACTCGTTGACGGATAAAACTAATGATACGGGGCGGGGGGGGGGGGGGAGGGGGATTCTATAGTGTTATTCTTATTTTGATTTTCCATGCATGCATCATCCCGATCACTACTCCAATAATGTCAAAACTGCCAATGTATTAATTTCCTCCATATCTTCTATACTCTCTACTTCTCATCAGTACTGCCACTACTAGAACAACGATTTTTGCATGTAGCCAAAACGAAACAGCAGTTGGACGTGGTGGTGGTGGTCATCATTGCAGGGAGGATTGATGCCGCCATTGCCACCGAGAAGCCGATCCGGAAGCCGGCTTTCCATGGACGCCGCTTCTACCACCACCTCCAGTGCCAACATTGTCACCAAGACCACCACGAGGAAGACGACCACAAACAGCGCGAGGAGGGTGCGCCCTTGCCACCATGACGAGGAGGAGGCCAAGACGAACCATCGCCAGATCCGCCGCCTCCGCCGCCCTCATTGCTAGATCCACCACCCTCGTCGGAGAACCGTGCGCCACGGCCGGGGGAGCACCACCGCTGCTCCCTTCCCCGCCAACACTACCGAGCCCCGCCGTTGCTGCCGTTCGGGTGAGGAAAGAGGAGCTTGAGAGAGGAAAAGGGAGGGAGTTAGGGACTTAGAAAAAACTGGTGTTTCAGTTTCCTTTTGCGTCTATTTAAATGCCACAACCAAATTTCACCATATGGCTTAAGAGGCCCGCCTGCAAAAATAAGGGTATTATTGCAGGCGGCCCTTTTAAGCCATCTGCTTGCAAAAATGGGAATAGGATATTCCCAGGCGGTCGGCCATTGGACTCCTCTCCACACAACAACTACACAGCCAGGCAATCATAGTCGAAAATAAGATCTTCCTGTGAAAATATATGTGTTCATTGTAGAAAATCGTTTTTCTAGTAGTATGCCACCCATCATCAGCCGCAAGGAGAGAGAGATGAAGCAATGAGCAATGGCTGATCTTCTTGCAATGCTAGCTATCTACTGTGGCTATGAACAAGAAGGCAGACATATGGAAACAAACCTAGCTATAAAAAAAACAGGGAGAAAAAGATGCCTACTAAATTTGGGCATAAATTAAATAAAAAAATCATTTACACTCTTTGAATGGAAAATATGAATAGGATCACATTTTTCCCAATACTTTTGTAGAGGAAGCTAGCAGGTCCTAGTCCTTGAACACTAAAATACATTATGTAATGACAAATTTAATTAGTTTATCATAAATAAAAGAAAATGTTATTAGGGATGGAACTCTGCTAATTAAGGGTTGTTCGAGTTCAGGCTGCTCCTTAAGATCATCTCGGTGCGGTTTTATGGATTGGCGAAGCATGGTAAAAGAAGATTCAAAAAGCTTACTTTTCTACATTTTTTTTGAAAAAAAATACCTTTGTTTTGTTTTGTTGTTTCTTAGTTAAGATATTTGAAAACTAACGATTTTTGTAAGTTTTGTCTATGTATAGTATATCTATTTATGGTAGAAGGTCTGGGTTCTCTATCTATTATATTGAGACAGAGAGAGGGAGAGAACAAACAAGTGCAGTGCTTTCCTTCCCTCTTTTCTTCATTGGCCCGGTTCTTAGCATAAAACCGGCTATTGTTTGGTGAAGACAAGCGCTCACGAGCCGGCCTCCTTGGTCCTCCCCATCCTTGGTTGTATTGCATTGGAGGCATATGATTGAACATTGGCGGTGTTGCCCCCCATGGCATGTAGTAAGGAAAAGGATAACCCGGCGACGGCATTGGATAAGGCCCCCATGACATGTCTTGAGGACGATGATATGTTGGTGATTCCGACCGTCTTGGTGAATGACCAAATCACTCCCTAGGAGGTGATCTTGGTCTTTTCCCTTTATTGCCAGCTTTCTCACCACCTTGCTTCTCATACTTGTCCAAAAGCATATCGAAGGTCACCTTAGTCTTCTTAGGAGCTTTAGAACTCGAAGCTTCATTCCTATTCTCCTTCCACACGCCAACCTCCGGATTCTTTGGCACCATCATCTTTGGCCTAGTCTCCCCAATGACCACTCATTTCCCCTTAGTAGATGTAACGCACCGATTTTCTTTCGGGATTAAAAATCAATTAATAATGCATTTTCTAGAAATTAAATAAAAGTTAAAGCAATTTAATCAAGTGAAATAGTGAGGGAATTAAAAATTTTCTTTAAAAAATCATTAGC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