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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_037992
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 8:27718086-27730909[+/+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence GTTCGTTTCAACGATCAGGACAGAACTGCTCCTCACTTCACAACTGGGTTGATTGGGAAAGACAACACGATTGCGAGGCACGGGATCCATGGGCTGTACTAACCACATGGCAAATAAAGTTCAATCTTGACAGTGTCAGTCCTAACAGCACATACAAATTCAGAGTGGCTCTTGCATCATCCGCAAATGCCGAGTTGCAG
Tissues root/anther
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTTCGTTTCAACGATCAGGACAGAACTGCTCCTCACTTCACAACTGGGTTGATTGGGAAAGACAACACGATTGCGAGGCACGGGATCCATGGGCTGTACTGGCTGTTCAACATCGATGTGAGTGGAGCTTGGCTTGTTCAAGGGATGAACACCATCTACCTGAAGCAGCCCAGGAACCAGAGTCCATTTCAGGGACTGATGTATGACTACCTGAGAATGGAAGGTCCTTCTGGCAGCTAAGGCCAGTCTTTAGCTAGTTTAACCAGCCTCACCTGTATGGCTAGTATAGCTGTACTATGCCTAGGTATGCAGTACGATTATGACCCAGATATTCCCATCCACTAATATTCTATTTAGTGTGCTTTAAAGTTTAATCTTATTTTACCAAAAAAAATCCTGGGTTTTGTCTAACCCCGGATTTAGCTTATCTGATTTAGGTTAGCTGGTAAAGATGTAAGCTGCCGAAATTTCGCAGAGCATCAGAATTCAGAAAACGATTAGATATACTCTAAATCGGTGATATGTATTGGAAAAAGAAATAACATTTCCCTGCTGTTTTAACTCTAGTGTAACAATTTGAAATAATCTAAATTGGTGCCATGCTCTTGTTTCTCAGAATTAAGGTTTGCAGCAAACAGCTTTCACTGGAGAAGTTGCCAGATGGTGGCAAGACACATTCTTCACTCAAAAGTCAAAAGCTCCAACAAGCTGTTAGTTAATTAGGTCAAATCGGTTGCCAACCCCACTAACTATTAGCAAAGAAATCAATTCTTGAAGCAGTAGCTATCTTTGGCACCTTCCTTTTGCTGCAGGTCTCCCCTCTCAACAAGTCAAGCCCCTGAAGCTTTTGATCCCTTCACCTCGTACTCGCAGCAGCAGCAGGCTGTACTGACTACTGACCAACCACCAGTTTCGGCGCCATTGCTGTCCTCCTCCTTGGCTTGAACTCAACTCATCGATCAACTCCAGTGCAGGCACATGCCAATTGCTTTCCAAACCAAGGGATAACCAGTCATCTAAGCAAAGCTGATGATGGATTGATCAATCAGTGGATTGCCAGCTGCTTGCGGAGTTGGAGGATGTGGTGGTGCTTGATTAGGGCATGGAAAACCAAGGGATAACCACTCATCTAATCAAAGCTGATGGATGGATTGATCAATCAGTGCATTGTCAGCTGCTTGTGGAGTTTTGGAGGATGTGGTGGTGCTTGATTAGGGGGAGTGGATTTTGATCTCTCGAGAGGGATGTCCCCTCGTTGTTTGTATGTCACTCAAATGGTTATGAAAAAGCTCTAAAAAAATTGAGAAGATGTATTAACATGTGATATTACTCCATGAACATGCTAGTTCAAATTCAACTTCTACATCTCGCAACGAAAAACAAATTTGACTGTGAATATACGTTAACTAGCTGTAGTTTAATTATTTTTTTTTGTTGCGAGATGTAGAAGTTGAATTTGAACTTGCATGTTTGTGGAGTGATATATCACATGTTGCATTTTTTTTAATTTTTTTTCATAACTATTTGAATGATATGCAAACAACGAGGGGATATCCCCTTGAATGATCAAAATAGTTTCCCCAGGATTAGGGCATGGAAAACCAAGGGATAACCACTCATCTAAGCAAAGCTGATGGATGGATTGATCAATCAGTGGATTGCCACTTGCCAGCTGCTTGTGGAGTTGGAGGATGTGGTACGGTGGTCACTCCTACGGAACACATTTTTGCATACTGGCAAAACTGATTTTCGCATGCGGTTGCTCTAGCCGCATGTGTGAAAAGGTTTGCGAAAATCGGTATTTTTGCATGTGGCCAGCGCAATCTCATGCGAAAATACGATTTTCGCACGGGCACTTAAGCCGACCACATGCAAAAAAAAATAATCGCCCCGCCGCCGCCTGAGATCGTCGCAGCCGCCGCCACCGCTCCTGTCGTCGCCGTCGCCGTCACCAGCCGCCGGTAGAACCGTCCCGCCCGGATCCGCCGCCTGAGACCGCCGCCGCCACCACCGCCATCATCTGTGCCGGATCCTCCGGTCGAGACCGCCGTCGCGATCTCCGCCACGCTCCAGATCCGCCGCCCACCGTCGTCATCGCCGTCACATCCACCGCCCCCACCGCACGAGGTAGGATCCTGTAGCTGGATCTGCCTTCGTCGTCCGGATCTGCCGCTCGCCGTCATTGTCGTTGAGGGTGCCGTCGGATCCGCCACCCGCCATCGTTGTCGTCATCGGCACTGTTGGATCCGCCCCCCACCTCCCTCCGTCGTCGCCGGTGCCAGATCCATGTGGGGAGGGCCTGCTCCCGGTCGCCGCCGTCGTTGCCGGTGCTAGATCCACGCGAGCCCGCTCCTCCTCCGGCCATCAAGCCCGCCGCCGCCACCCACCCCACTCCACACCGCTCTCGGAGTCTCGGTTGCTCTTGCCGTCGAGGTGACAAGGAGAGAGAGAGAGAGGATTGAGAGGAGAGGAGGAGAAGATAAGTATCGACGTTTGAGGTCTCGACTACGGTATTTGCATGGTGTGGAGATCGTCGGTGTACCAGGGTATATGCGAGACTGAAGTGAAAGAAATGGAGACAAGGATTTTTATACAGGTAATAACCCTACTCCTATTGACCAAAGCCGGTGTTGCTCTTTATTCATCTGGATCACACAAGTACAATATTTGGGATAACCTATCTAGCTGTCATCGACTTGGCGGCATAGATAACCAACATGTAGTCGACGACAAGATAGTCTTCCTCCTCGAGTACGAACTCATCGAGATCAGAGATGGCGCTAGATCCCTTTTGTCGGCCTCCGCAGGCACCATATTGGGTCTGTCTAGGCTTATCTCTGATGTCGATGTCTGCCGGCGTGTTGGTTTGTGTGTCGATCTATCGTGTCCTCTCTCCCCTAGTGTCAGGGTTATGGATACCACATACATAATAGTAGTCGACTAAATCTCGGCAGGACCCACCACATACCATGTCTTATACGGGAACAATCTTCGGATATAGGAGGAGTTCTACATAAGGAAGGATGAATAGAGTTCTACATGAAAATGACAAGGACTACTCGGATTGTATCCATATTGGTTTCCCTAGTTCTACTTGGACAAGGGGACACCTATGGGTATAAATACAAGGCCCCCTAGGAGGAAAGGGGACACGAACAACATAGACGCCACAAAGCCACATGCCAATATAAGCCTACATACGCCAAGACAAGCTGGCAGATATCGATATCAGAGATAAGCCTAGGCAAATCCCATATGGTACCTACGGGAACCAAAGAGAGGAATCTAGCGCTATCTCTGATCTCATCGGGCACGGATTCGAGGAGGAAGACTACCCTGTTGTCGACTACGTGATGATACTTCAGTCCGCCAAGTCGACAACAGTTAGATAGGCTACCCCAAATATTGTACTGGTGTGATTATGGTGAATAAGAGCAACGACCGGCTTCGGCTAATAGGAGTAGGGTTATTACCTGACAATTCAGGGGCCCGAACCTGTATAAAAATCATCGTCTCCATCTCTTTTACCTCAATCTCGCATATATCCTAGTACTAACGATCCCCATACCATGCAAATACCGGAATCGCGGCATCAAACGTCGACACCTAGGGTGTCTTGTATTTATACCCATAGATGTCCCATTGTCCACGTAGGAATAGAGAGACCAATATGGATACAATCCGCGTAATCCTTATCGTTTCCATATAGAACTCTACTCGTCCTTCCTTATCCGGAACTCCTTCTATATATGAGGCATGATTCTGTATAGGACTTGGTATATGGTGGGCCCCGCCGAGCTTAGTCGATTTCTATTGGGTATGTGGTATCCAGAACCATGACAATAAGGTTGGGTGAAAAATTTTAAACCGGTGGACAGAGAAGGAGAAGGCTAATTAGACTTCAAGTCCAATCCTTAAGAGGCTCGCATGCAAAAATCGATTTTCGCATGCGGGTCTCTTAAGTGGCCTGCATGTAAAAATGAGGAACTTAAGCATCTGCAAAAATCAATTTTTGCATGCGGCTCTTTAAACTTCGAGTCAAATTTTATCATACATTCGTACTAAATGAACTCATATAAAAAAGTTGTCAAAAACAAAGTTGTATAACTTATTGAGATCTACCAATTTTTTTTGGTTATTTCTCCATCGAGTTTGATTAAACTATATAAATTTTAAATTTTAAAATATAAGAAATTTAAATAATTTTTTCGGTAGTAAATGATTTCAAATGGAAAAATTGTTAATAACAAAGTTGTATATATATATATATTGTACTGGTTATATATATATATATATGTATACATACATACATACATGGCAACATATCATATGCACACAGACCCTCACGTGTACACACGTGCACACCAACTAAAAAATGTCACTAAAAAATCTAGAAAAAATTATACACATACTTTCAATTGTAGTACACCTAGGGTTAAAATTTTAACGTCAAATTCATTATATTTTAGCCGTAACAAAAAAAAAAACAAAAAATCTGACAGTTTTAAGGTTGTAATTTTGTCAGAATTTTATCTTTTTTGTTATTCTCTATGTAGAATGAATTTGAAGATGCGACTTTGTACGTAGATGTAATACTATTGAAAGTACATGTATGAATTTTCCTAGAATTTTTTGTGATAATTTTTACTTGGTGTACACGGTGTGTACACGCGAAGGCCTGTGTGCATAGGATACGCTCCCTACATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACATATGTATATGTATATGTATATATATATATGTATACATATATATACATATACATATATATATACATGTATATATATATATATATACGTATATATATAGATATACGTATATATATAGATATACGTATATATATACGTATATATATACGTATATATACGTATATATATAGATATACGTATATATATATACGTATATATACGTATATATATGTATACGTATATATACGTATATAT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