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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_037988
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 8:27715900-27728413[+/+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence GTTTCATTACATGGCATTAGCTGACGACAGGCAGAGAATAATGCCGATGCCTGAAGACCGAGTGCCGCCCCGGGGACAGCAATTAGCATACCCTGAAGCTGCTCAGGATTCTATACTTACGGAATCTATGAGCATCAGGAAGGGTGGCCTGGTTTTAGCATGGTAGAGACCAGGGTGGCCTTCAAGCTTCGGAAAGACAA
Tissues root/seed, pistil
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTTTCATTACATGGCATTAGCTGACGACAGGCAGAGAATAATGCCGATGCCTGAAGACCGAGTGCCGCCCCGGGGACAGCAATTAGCATACCCTGAAGCTGTCCTTCTTGTGGACCCAATAAATCCTGACCTAAGAGGAGAGGTAAGTTGACAAATATAGGATTTTTTTTATCTATGATAAACGTATTATATCATGAAGAATCTAAACACTGTTACTGGTAAATTGTCAAGGTTGATGATAAATACCAATACTCCTGTGAAGACCAGTATAACAATGTCCATGGATGGATATCATTCGATCCTCCAATTGGCTTCTGGCAGATCACTCCGAGTGACGAGTTCCGAACAGGAGGTCCCGTCAAGCAGAACTTGACCTCTCATGTTGGGCCAACTATGCTGGCTGTAAGTTCAGACATTGTATTATATTGAAATAAAAAGTTCAGATTATTAAGTTCAGACATTCTTCTGAAACCCTTTTTTTAAAATATGTTTTTCAGATGTTTCTTAGCGGTCATTATGCTGGGGATGACCTTACACCCAAGTTCTTGACTGGTGAATACTGGAAAAAGGTCCATGGGCCTGTCTTCATGTACCTTAACTCCAGTTGGGATGGAAGTGACCCAACTCTACTCTGGGAGGATGCAAAAGTTCAGGTGAAAAATTGGATGCATATTTCGTCTCTAATTTGATATCTTTCTTTTATTCACAAAAGTTCAGGTGATAACATTCAGGTTGATTCTTATTGACAGTACAAGTGTTATGAACACGGCACAAGTAACTTGTAATTTAACTCTCTCTTTCTCCTTTTGAAATCAGATGATGATTGAGAAAGAGAGCTGGCCGTACTGTTTTGCACTGTCAGATGATTTTCAGAAGACTGAGCAAAGAGGTTGTATCTCTGGTAGATTACTCGTCCGAGACAGGTAGTAATTAATGACATCTTTTTCCAGTTTTATACAACAGTAGTAACTAAAAGAAGTTTGATTCAGTCCAGATGTAATTTAGTTCGCGATACATCTATTACTAATGAATTCATCATGTGTTATTTAGGTATTTAGATGATGCAGATCTTTATGCTACATCAGCTTATGTAGGCTTAGCTCTACCAGGAGATGTTGGATCCTGGCAAAGAGAGTGCAAGGTGATGCATGCTATATACACACTTATTCTTTTAGAACAAGCTTGAATACATGTTAGACTATGAAGTATATTATCAATCACATATTCCAACACCGTGACCCGGCAAAAAAAAATATATATTCCAACACTGTAGGGATACCAATTCTGGTGTAGGGCAGAAGATGATGGAAGCTTTTGCATAAGAAACATTGTAGCTGGAGACTACAACCTTTATGCATGGGTTCCAGGATTTATAGGGGACTACAAACTGGATGCTAAGCTAACCATATCTTCAGGTCAGTATCTACCTGACATTTATTCCTCTTGCAGCTTCCAATGAGATATCCTGATATGTTCAGCACTCCTGTTCAGGGGATGACATTTATCTGGGTGACCTTGTGTATGAACCACCAAGAGACGGTCCCACGATGTGGGAGATCGGAATACCTGATCGATCCGCCTCTGAATTCTTTGTTCCAGACCCTAATCCCAACTATGTGAATAGGTTGTATATCAACCATCCTGACAGGTGATGCAGACTGGCTACCAACAGACTTCTCAAACATGTAGTAACCAAGTGATCATCATTTCTTATCATATAGTGTTCTTATCGTTCGTTACAGATTTAGGCAGTATGGACTTTGGGAAAGATATGCAGAGCTGTATCCAGACGGTGATCTGGTATACACAATTGGCCAGAGCGACTATACCACCGATTGGTTCTTTGCTCAAGTAAACAGGTGATGTTTTCATCTCATTTGAATACAACTGATTGCGCAGAGTTACATGATCTGCTTCTAACATCTGTGTCCACTGCAGAAGAACTGATCAGAGCACCTACCAGCCAACCACATGGCAAATAAAGTTCAATCTTGACAGTGTCAGTCCTAACAGCACATACAAATTCAGAGTGGCTCTTGCATCATCCGCAAATGCCGAGTTGCAGGTTATTTCAGAAAAAAAAAACACAAAAATACTTAGATTGGCCAATGTCCATTCCTATTTCATTATTTGTTATCATCATTCAAGAAGTTGATCCTAAATACACAAAATGCTTGTATTTTCAGGTTCGTTTCAACGATCAGGACAGAACTGCTCCTCACTTCACAACTGGGTTGATTGGGAAAGACAACACGATTGCGAGGCACGGGATCCATGGGCTGTACTGGCTGTTCAACATCGATGTGAGTGGAGCTTGGCTTGTTCAAGGGATGAACACCATCTACCTGAAGCAGCCCAGGAACCAGAGTCCATTTCAGGGACTGATGTATGACTACCTGAGAATGGAAGGTCCTTCTGGCAGCTAAGGCCAGTCTTTAGCTAGTTTAACCAGCCTCACCTGTATGGCTAGTATAGCTGTACTATGCCTAGGTATGCAGTACGATTATGACCCAGATATTCCCATCCACTAATATTCTATTTAGTGTGCTTTAAAGTTTAATCTTATTTTACCAAAAAAAATCCTGGGTTTTGTCTAACCCCGGATTTAGCTTATCTGATTTAGGTTAGCTGGTAAAGATGTAAGCTGCCGAAATTTCGCAGAGCATCAGAATTCAGAAAACGATTAGATATACTCTAAATCGGTGATATGTATTGGAAAAAGAAATAACATTTCCCTGCTGTTTTAACTCTAGTGTAACAATTTGAAATAATCTAAATTGGTGCCATGCTCTTGTTTCTCAGAATTAAGGTTTGCAGCAAACAGCTTTCACTGGAGAAGTTGCCAGATGGTGGCAAGACACATTCTTCACTCAAAAGTCAAAAGCTCCAACAAGCTGTTAGTTAATTAGGTCAAATCGGTTGCCAACCCCACTAACTATTAGCAAAGAAATCAATTCTTGAAGCAGTAGCTATCTTTGGCACCTTCCTTTTGCTGCAGGTCTCCCCTCTCAACAAGTCAAGCCCCTGAAGCTTTTGATCCCTTCACCTCGTACTCGCAGCAGCAGCAGGCTGTACTGACTACTGACCAACCACCAGTTTCGGCGCCATTGCTGTCCTCCTCCTTGGCTTGAACTCAACTCATCGATCAACTCCAGTGCAGGCACATGCCAATTGCTTTCCAAACCAAGGGATAACCAGTCATCTAAGCAAAGCTGATGATGGATTGATCAATCAGTGGATTGCCAGCTGCTTGCGGAGTTGGAGGATGTGGTGGTGCTTGATTAGGGCATGGAAAACCAAGGGATAACCACTCATCTAATCAAAGCTGATGGATGGATTGATCAATCAGTGCATTGTCAGCTGCTTGTGGAGTTTTGGAGGATGTGGTGGTGCTTGATTAGGGGGAGTGGATTTTGATCTCTCGAGAGGGATGTCCCCTCGTTGTTTGTATGTCACTCAAATGGTTATGAAAAAGCTCTAAAAAAATTGAGAAGATGTATTAACATGTGATATTACTCCATGAACATGCTAGTTCAAATTCAACTTCTACATCTCGCAACGAAAAACAAATTTGACTGTGAATATACGTTAACTAGCTGTAGTTTAATTATTTTTTTTTGTTGCGAGATGTAGAAGTTGAATTTGAACTTGCATGTTTGTGGAGTGATATATCACATGTTGCATTTTTTTTAATTTTTTTTCATAACTATTTGAATGATATGCAAACAACGAGGGGATATCCCCTTGAATGATCAAAATAGTTTCCCCAGGATTAGGGCATGGAAAACCAAGGGATAACCACTCATCTAAGCAAAGCTGATGGATGGATTGATCAATCAGTGGATTGCCACTTGCCAGCTGCTTGTGGAGTTGGAGGATGTGGTACGGTGGTCACTCCTACGGAACACATTTTTGCATACTGGCAAAACTGATTTTCGCATGCGGTTGCTCTAGCCGCATGTGTGAAAAGGTTTGCGAAAATCGGTATTTTTGCATGTGGCCAGCGCAATCTCATGCGAAAATACGATTTTCGCACGGGCACTTAAGCCGACCACATGCAAAAAAAAATAATCGCCCCGCCGCCGCCTGAGATCGTCGCAGCCGCCGCCACCGCTCCTGTCGTCGCCGTCGCCGTCACCAGCCGCCGGTAGAACCGTCCCGCCCGGATCCGCCGCCTGAGACCGCCGCCGCCACCACCGCCATCATCTGTGCCGGATCCTCCGGTCGAGACCGCCGTCGCGATCTCCGCCACGCTCCAGATCCGCCGCCCACCGTCGTCATCGCCGTCACATCCACCGCCCCCACCGCACGAGGTAGGATCCTGTAGCTGGATCTGCCTTCGTCGTCCGGATCTGCCGCTCGCCGTCATTGTCGTTGAGGGTGCCGTCGGATCCGCCACCCGCCATCGTTGTCGTCATCGGCACTGTTGGATCCGCCCCCCACCTCCCTCCGTCGTCGCCGGTGCCAGATCCATGTGGGGAGGGCCTGCTCCCGGTCGCCGCCGTCGTTGCCGGTGCTAGATCCACGCGAGCCCGCTCCTCCTCCGGCCATCAAGCCCGCCGCCGCCACCCACCCCACTCCACACCGCTCTCGGAGTCTCGGTTGCTCTTGCCGTCGAGGTGACAAGGAGAGAGAGAGAGAGGATTGAGAGGAGAGGAGGAGAAGATAAGTATCGACGTTTGAGGTCTCGACTACGGTATTTGCATGGTGTGGAGATCGTCGGTGTACCAGGGTATATGCGAGACTGAAGTGAAAGAAATGGAGACAAGGATTTTTATACAGGTAATAACCCTACTCCTATTGACCAAAGCCGGTGTTGCTCTTTATTCATCTGGATCACACAAGTACAATATTTGGGATAACCTATCTAGCTGTCATCGACTTGGCGGCATAGATAACCAACATGTAGTCGACGACAAGATAGTCTTCCTCCTCGAGTACGAACTCATCGAGATCAGAGATGGCGCTAGATCCCTTTTGTCGGCCTCCGCAGGCACCAT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