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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_037278
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 8:22220234-22226141[+/-]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type exonic
Splice junction sequence ACCTATTTAACGCCAAGGAACTTAATCCTTTGCAAAGAACAGTGAGTCTAGATTCTTTTCCACAGAAAGGACACTACATTTTAGTGATGAAGTATGCTGCGGATATCATAAAGCTTACCCCTTCTTTGCCATCATCCAGTTTGATTTTCTTAAGTGCTGCTCTTTCTCCAGTTATAATATCCATAGCCTCGAATACTTCA
Tissues root
Exon boundary No-Yes
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence ACCTATTTAACGCCAAGGAACTTAATCCTTTGCAAAGAACAGTGAGTCTAGATTCTTTTCCACAGAAAGGACACTACATTTTAGTGATGAAGTATGCTGCGCAAAGAGCATCATGTGCGGAAATCCTCTGCAGAATAAATAAAAGCAGAAAGGTATTAGATTGTTTCCACGTTCAAGACCCACAGTAAAAAAACCTTAAGAATATTCTTCTATAGAGAGTACAATTGATTCTCTAAATCATAGTATAAAAAACTGATACAAAATTGATATTAGCTGGCTCCATTCATATTGAATTCCAGATATATCCGATTTCAGAAATTTAAATTTTATTTATACTAGAATGATGTGCACATGTATCCCAAAGGTGCACATTAATTATTGTCCAGTTCAAACAAATGCATATATGATTTACATCAGATCAACAAACAACCTCGACCTGCATAGGGTGTTTTACAAAGGTTTCCTACATTTAACACACATGTCTACACAAATCCACTCACAACTATCTTCTGAAGTGAAGAGGTGAAGTTGAGTGTGGAGTGCACAATCCCCGCTTACTCCTTTGAGCAGCATAGATATAGCATAGCAATTAAACATAGAACCTTCCCTGAATGTGTTTAAAATGTAACAACTATTTATGTTTACGATACCAATAGGGTTAAGTACGTTTTACCCCTCCTCAACTATCACAAAAGTTCGATTTACCCCCTCAACTATGAAACCAGACAACACGCACCCCTCAACTATTAAATCCAGACACTTAACCCCTTTGTGCTGGTAGTTTTGGCCAGGTTGTCTGAGGTGGCACCTCCACTTGGCGATGACATGGCAGCACATTAAAATATCCCATCTGTCCCTCTGCTTCTCCCCTTCTCTCCCCGTGAAAATTCCCTACTCAAATCAAATCCCTAACCGTAGGCTGTAGCTACTCAAATCAAATCCCTAACCACGAGCAGCCACCAGAAGGCCGCTCTGCCTTCTTCAACCGGGAAGATTGACAAAATTAAAGTGGTGGTCAGGGAAAGGTCAGAACATCACCTCACCATCAGGACCATAAGGGAAGACTTATGGTTATGGCTAATGTCAGACTTGTGGGATGATGATCTTTTGATTTTGCTTGTGGCTAATGTTAGACTTATGGCTAAGTGACTTATGCATGTAATGCAAGACACGGTATATTATGGTTATGTTAATGTCAGCCTTATTGTTATGTTAATGGCAACCTTGTCAAATTCAGTTCTGCAAATTACACCTTTATGTGCTTTTTTTCTTCAAACAATAGGACAGTCGCAAATTGATGGATTGTTCAGCCACATGGAGATGACATGTCGGACAGCATGGTCTAAACCATCTAAAATAGGGCGCAGGGGATTAAGTGTCCAGATTCAACAATTGAGGGGTGTATCTTGTCTGGCTTTGTAGTTAAGGGGGGCAACTCAAACTTTTGCAATGGTTGACCGGGGGGGGGGGGGGGGGGTAAGTTTAGAACTAATCGTTATCAATGGATATCTTGAGTTCTATAAATTAGTCCAAATCTTTACATAAACATATAGTAGTTTACATCTTAAATGGTATAAGTGGCCTAAATTGAGATGGCTCTCATGCCTCAACATCATATGAATTCTTGTACACTGAAACATAAGAAAGGGTAACATACCTCAGTAGGATTAAGAATCAACATGCGATCAATTAAATCCACTGCATGAGAGTCAAAGCTGTAGAAGAAAGTTTTTAGCCACATTACTCCATTATTCTTAATCTTAATAGAAAAACAGTAACTACTGTTGATAAACGGATGAGAAGTGATAGCAGGTGGACTACTTGTGAAAAATATCTCTCAGACGTCGTTTCGTTGGGGTTGTAGGACGAATAGTCTTGTACAATGGAAGTTTGGATACTCCTGGCCAGTTTTCCTCATTTGGAAATCCACAGAGTTCAAATATTTTTGATAGCTGCTCTTGCTAAAACAACATACGAGCTTCTGTCAGAGTTTTATATGGAAATAAAATACAAAATGAAGATTGTAAATATCATGCAGTAATATATCTGAATCCAAAAGAAAGACCATTGTGTTGACATGCTTAGTGCTTATGAGGGGGAGGGGTCGTTCTTGGAGCCAAGAAAAAAATGCAAAAAAGAAATTTGGCATAATGTCATTTCACTATGAGGAAACGTAACAAAAAGGGCAATCAGGATCAATAGTTGCTCAATTTCAAAATATAAAAGAATATAATGTGTGCACGTGATATATTTGTGGAATGGCATTTTTCCAAAGAAACATATCTATCCTTCATATATCTTTCTGATCATATGTTTCAAGTGTACTATATACCATAGATTACAACTTTTGAAATGGAGAAGAGGAGTAAAAGTAGAACTTAACTGAAAAAAATTTGGACAGATAAGAAACGTCACGGTGAAGGTAAAATCTAATCCCTGCGCGCGCGCGAATTAGTCTTACGGCGAGATGCCTGCTACAGCCGTCCAACGATGTGAGTCTCATGTAGTACATCTACTAATCTATTTAAATTTTTTGATGGCTTATATATTTCAAACCATGTATTATTTTTAAGATCTGTTTTAACCATTAAACTCCACTCAAAATATATGATAAAATGAGTACAATATTAAATATATTGAAATATTTAAAAGTAATTTAGTTAAACAGTAGAAGTAACTAAGCTCTGCAATGGAAGCAACTTTTTATAGAATGCATTAGAAGTAATTACATATATGTGTTAAAAGAAATATCTTCATAGTAAAGTGTGGATTCACAAGTAAATACATAACTTTTTTATTTGAGGTAAACCATATGTTTGTGTATATATCTATAGATTATTGTTTTCGATGAAAGCAATTTATTTTATATAGGAAGTAACTCTTCATATTATTAAAAGTTGCTACACTCATAGAGGAAAGTAACTGAAAAAATAGAACTAACCTTTTACGGTGTTAGAAATAACTGCACTGCTAGAGAGAAGCAACTCTTCATGGTATTTAAAGTAACTATATTGGTATAGGGAAGTAACTCTTCATAATATTTAAAGTAACAACACTGCTACAAAAGTAAATAATTTGAATATATTCAATATTGGACTCAGTTTTGTCATATATGTTCAGTAGATTACGATGGTTCAATTGGATCTTAAAAACAATATACGGTTTAAAAGATATAAGCCACCAAAGAATTTAAAAGTACTAGACTCTGTTAGCATGTGACTGCATAGTACTAAAAGTGAAAGTGCATTATGACATGTCTTTTTTCCAACAAAGCTGGACCTGAGGAAAAGATGCAACGCTTCTATTTTTGGTAAGTGCGTTGTGTCACTGCTTACGATTCCCTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTGGAAAAACATGTGCGGGAGATTGCTGTAGCCCGTGGGTTTCTATTTTTGGACGGTCGCTCATTAGCGCTAAAGCACTACTACGCGCCACATAGTCGCGTCCAAAAAATCATCATGCTATAGACAAAAAAAGGTTCAGTTTGTACATGAAACCATAAGTTGTAATATTAGGCGTTCAACATGCATTATCGAGTATTAGAAAACATCAAAAGTACAAGGTAATTCATTGATCTTATCCCCTAGTCCCAATCTCAATAATAGCAATAATAGAAATAGGAAAACAAGGAAAAGTAAAAGGAATGTATCATACCTCAGTTCTGCCAGGAAATAATGGTTTCCTCAATAAAAATTCTGCAAATATGCAACCAACAGACCATATATCCACTGCTTCAGCATAATTTGTGGCACCGAGGAGCAACTCTGGGGGTCTAAGAGCAGTTTGTAGAATGAAGGAAATTGATATCAGCAAAAGGAGATAGGAAAAAAATACAACACAAGTAAACATGTTGGGGTTGGACAAGATGATATATAATAGCATAAGTCCTTAATTCTTTATTCGACTTACCGGTACCAGAGAGTAATAACATGATTTGTGAAACTTCCGTCTCTAGTGAATGGCCTTGCAAGGCCAAAATCAGCGAGCTTTAACAGCTTACCACCACCACTTATTAGAAGATTAGCCCCTATAAATGGTAACAAGTAATCTGAGGGTCGAATAAAAATGATCATAGATATAAAAGTTGAAGATACATTCAAACAGAACAAACCTTTGATATCACGATGAAGTACATTGTTGACATGGCAGTAGTGCAATCCTTTTAACAACTGCTCCATATAATACTACAGAAATGAAAATAGACAACAATGAATAGGCTGTTCTTAAGGAGTACAATCAACTTGTATCCTGCTTGGTGAAGCACTGAAGCTTAATTTGTTTACAACAGCTTGCATAAAACTATACAAGAGAAACTGAGCGAGAGAAGAATCTTTTGTTTTGGTAAGCTTACCGTTCAATGTTAATTGTTACAGCAAGTTAAATCATATTTCTGCAGCAAGTATGTATTAGTGGAAATTTTATTCTGTTGGAACCTGCAGGTACCACGCTAACCATGTGAATTGTTGCATGCAATATTTTATCCTATCCGATAGGCATCAAGGCACAAGACAACATCCCTACCACTATCCCAACCTCCCTCGTCCTTGATACCATCACAAATACTTATTTGTCCTTCACATACTCCTTGCTGCAACCCTCAGCCCTCCTTGGTCACTGTTGCCAGACCTGGTTTCCCAATTCCCATAAATGTCACCATGGTCCACAAACCACAGATGGCCTCTCACTCTATCCATCCCTGGCATGCAGCAGTAGTGTGGAAACACTTGAAACCAGGCCAAGTTAGTTGTTTGAGGCTACTGATGAAGGAGGTGACAGGATCCATGTCCAGGAAAAATAAAAGCAGGTATTGATCCACCCCCCCTATGGTGAATTCTTGGAGAACTTGAACCAATTTTGGAAGTTTTGTGATTTACTAGTTTAAATCTCTCAATTCTCAGGATGAAAGCAGAAAATTCCTAATCCAAGACAATAGCTCCTTTAATCTTTAGCTCAAAATTCCATAGTCCACTTTGAAAGTACGAGA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