Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_036942
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 8:18244407-18247352[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence TCTGTGGCAGGATGCGCAGAGTAGGGTTTACCTGATTAAAGAGCTCGACAGGCGAACCGGCCAGGTTGGTGCCTTCAGATCTACCCTCTTCTACTATATCACATATGCACATGATGATGTTAGTGTAGGATCATGGTTAATTGGTCTTGCTGTGAAGCATGTAAATGAAGCAAAACTATGTTGTTCATCCTGGCCCTCAG
Tissues root
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TCTGTGGCAGGATGCGCAGAGTAGGGTTTACCTGATTAAAGAGCTCGACAGGCGAACCGGCCAGGTTGGTGCCTTCAGATCTACCCTCTTCTACTATATCAATTACAACTAGCTAGCTTCAATTGAGAGTAAAGAATAACAGGAACTTCTTTGTTGTGCAAAATTCAGGGCCATTCGACGATATCGGTGGATGATACCTTGAAGGTTGTCGCATGCAGGTAATTCTGATCTCTACTGTATGACTACAATATAGTAAAACTGAGATGTTGTTGCAAAATTTGTTCTTTCTTTTCCCCAATTATTTTTGGCTCTATGTTGATTCGGGTGCTCTAAATTTGCGCGGCTTGTTTAGTTTGAGACTTCAGAGTTGTAGTGAATGCTCTGTGCTAATTGCTGAACATCTGAACATCATTATGTTTTAGGCAGCAAGGAAAGAGGCTGGCCTCACTTGAGATGGAGCTGGCTGCAGCAAAGCATGAAGGTTTCGTGGGGAAATATACCTATGAGACAAATGGAACTAACTCTAGAAAGAGGCCACTGATTGTTATTGGAATAATGACAAGCTTTGGGAGGAAAAACTACCGTGATGCTGTCAGGAAGTCATGGCTTCCGACAGGTACCATTTCGTACTTGCGTTCCTCACTACCTGTGGCACTTTTATATCCTATAATTATAAATAAATTAATACGGTCACCTTTACCCTTGATATTTGGTGGTCATAATTGACTTTCGAAGTCCTTAAAAGTTACTACTTTTTTTTATCATGGGGCATGGGTTTTTTCCTCAAACGTACAAGAGAATGGCGCGCGTCATTAAGAAGAGAAGAGGTATACAAGGGGAGGAAAATAATCCCATTATAAGGGGCAGAAAGTACAATGCATGGGGCATGGGTTTTTGTAGCTGTCTATTTATAATATTAATCACTAGAATGTTCGGCACTCTAGTTCATAATCTGGACTCATAGGTGGCTGAATGAACATGGAGAATAAAATGTATTTCTGTTGCTGCATAATAAAGTGGCACCTTTTTTTTTTGTTGACGGTTATCAGTTGATGTAAATAAAAATGAGTTGGCTTCATTTCATTGTTTTTCCGTCTTACTGTTGCATTAAAATGATGTCTGTTTTTTGGGTGATTTTAATTTTCTTCTCTGTACAGGTTCAATGCTGAAGAAACTAGAAGAAGAAAAAGGCATTGTAGTGCGCTTCATAGTTGGAAGAAGGTACCACAGGACTCCTTGCTAATAGAATGACTATATGAGGTCTAGATATCTGATAGTTCCTTATCCATGTAGTGTGAACCGAGGAGATGCTTCAGACAGGGAGATTGATGAAGAAAATAGAAGTACAAAAGATTTCATGATCTTGGTAAGCCTGATTGATCAATCAAACATGTGGTAGTACATATTTACAACATTGAATGTGTATATAAAATATTTTTCATCATAATTGTTCACCTTATTCATGTTGATTACATGTTGCTTGAAAACCAGATAAACGATGTGTGTGCATACTTGATTATATACGCCTTCTAGTACAACAACATCTGCCTTTAATCCCAAGCAAGTTGGGTAGGCTTATTGTGTATGCTTTTTTAGTATATGTTAAAAAAATCGTGCGCTGTGACTTGTAACAATGAGACTCCATGTTCATATTTTCAGATTACTCGTTTGGCCTGTTGATTTACTTCAGTTTTTTACTATTAAATGACATTGCAGGATGATCATACAGAGTCTGAAGAGGAGAGTCCTAAAAAGACAAAAAGTTTCTTTGCTAATGCTGCAGAGTCATTTGATGCTGAATTCTATGCTAAGGTCAATGATGATATATACATAAATGTTGGTACGTAGCATCTCTTCATATCATAGCTGTACTTATCCAATTTGGTATAGTTTTGTTTGATCAATGGTGCTTCTTTCTGTTCAAAATATTTGACACAGTATGGATGTGCATGAGATATTGTACTAGTGGCAGAAGTTAAGAAATGGTTGACCAGTATGCATCCTTCAATACAAAAGTGACAACTAATTTTGGTTAAAGGGAGTTTTAGCCATCCGCATATGGTGTTTCTATTAGCCCTTTTGTTATTGCTGACAGTGTTCCAACGTATTTTGTTGTTATGTGATCATGATGATAATGAATTTGGGGGGTTGGAGCACGGTTTCAATTAGCTGTGGTGCATGCCTCAATCTTGTGATCCTCACTGACCTGAATAAAAGGTCAATGTACACGTTCTAGGATGCTGGATGGCAATGGCTGTATAGGTGCTATAATTTTGAAATGTTGCACAAACTATTAATAACATTGAACAATTTGGGTTTGTGCAGACACTTTGAGTGCAATGCTCAAAGAACACTGGGACAAGCCTCGTGTCTACATTGGCTGTATGAAATCCGGCGAGGTCTTCTCTGAATCGTGAGTGCTTTCAGCAATTCTTTCTGGGGATATTGGTGCTGTATTTTTCCTTTGCACATTTTTCTAACAGCTTCCCCAAAAACAGAACTCATAAGTGGTATGAACCAGAATGGTGGAAATTTGGTGATGGGAAAACGTAAGTAATTTACATTAGGAAAACATTTATTGCGCATTTGCTAGTTGGGACATTTAAAAAAATTACTATTTTGGCTTATCTATTTCAATTTATCAACTAATAGGTACTTCCGCCATGCTTCTGGTGAAATGTTTGTCATCTCAAAGGCTGTAGCTCAATTCATCTCTATAAACAGGTAAGCAATGTATGTAGTTTGTACTTTCAACAAGGGTCTAATAGGTGGAAACAAAGAGAAGTTTCAGTAAGTACTTTTGGTGATGTATCTTTGACACTTCTGTATGTAGGTCTGTTCTCCGGACATATGCACATGATGATGTTAGTGTAGGATCATGGTTAATTGGTCTTGCTGTGAAGCATGTAAATGAAGCAAAACTATGTTGTTCATCCTGGCCCTCAG