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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_036757
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 8:14740998-14745135[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method SMALT and Segemehl
Type exonic
Splice junction sequence GTTCCTTTGGTTCATTATTGCCAGCAACTTGCATCAACCCTCTCTAGCCATGAGACATGCTTCACCCAAACAGCCGATTCGCTGTTCTTTATGCATGAAGGAACAAGGGGAGTACAACAGCAACTGATGTTTTTGTGAGTTTAAGGACCAGAAGCATCCTCCACTTATTTGCTGCCACTGGAAGTTCTTTGGGCCTAAAG
Tissues panicle
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTTCCTTTGGTTCATTATTGCCAGCAACTTGCATCAACCCTCTCTAGCCATGAGACATGCTTCACCCAAACAGCCGATTCGCTGTTCTTTATGCATGAAGGGTTGCAACAGGCCCGCGCTCCCATTTTTGATGTTCCATCTGCTATAGAAGTCCTACACACAGGGAGTTATAGGAGAGTGCCAAAATGTGTTGAGGAAATTGGTACTCAGAACACACTTTTTCAAGATGAACAAAAGCCTACTTTGAAGAAATTAAGCACCCTTGTACGGGCTAAGTTACTTGAAATCTCACTTCCTAAGGAAATATCTGAGGTTTCGGTGACTGATGGAATAGCCAATGTTCAGGTAGATGGAGAATTTAAAGTTCTTATTACATTAGGTTACCGTGGGCATTTCTCACTATGGAGGATATTGCACATGGAGTTACTTGTTGGTGAGAAGGCTGGGCCAATTAAGCTTGAAGAGACAAGGAGATATGCTCTTGGTGATGATATTGAACGGAGAATGGCTGTGGCTGACAATCCTTTCATGATTTTGTATACAATACTCCATGAACTATGTATTTCACTTGTTATGGATACTGTAATTAGACAGACAAATGTTCTACGACAGGGCAGGTGGAAAGATGCGATAAAATCTGAACTTATCTCAGATATCGGCACAGGACAAGGTGGAAGTAATGCTGTAATGCAGCTTGGTCAAGATGGGGAGCTTGATTCAAGTGGGTCTAGGATACCTGGTCTGAAAATTAATTACTGGCTAGAGGAAAAAAACAATGCTTCAGCTGAATCAGATTCATCTCCATATATTAAAATTGAGGCAGGGCAAGATATGCAGATAAAGTGTCAGCACAGCTCTTTCGTATTGGATCCATTTACAGATAAAGAAGCTGATCTTTCTATTGATCTGAGTTGCATTGATGTTGAAGCTCTAATTTTGAAAGCAATTGCTTGCAATAGGCACACACGTCTTCTGGAAATTCAAAGGGAATTGATGAAAAATGTTCAGATGTCACAATCATCCACTGAGGTTATCCTGAAGCGAGAAGTTCATGGAGAGGGCTTTCAGAAGGTACCTTGTGGGCTGTTCTAATTAAGGGTATTACTGCAGCCACCTTGTGTTTTTGATATTTGATGCACTGACTATATTCATAAATTGTGTAGAGAGTACATAGAAGAGACTCCAATGATTGTTGTACAAATGAAATGCTTCAAGTTAGGGCATATGGACAATCATATATTGACCTTGGAATAAATATCAGGTTTGTTAATTGTTTATTTATTTCTTCTCCATGTTTATACTTTATATCTTAATTTTTCTTGACCTTACATCCGCATGATGTTATATAATTTTGTTTTATTTCGTGTACTCTGTTAATGTAGCTTAACCGTGACTTTATTGTTTCTCTAGCAATACATTAGTAAAAGTTCCAAACATTCTACATTATGAAAGTATTGTAATCTTGGTAAGTGTGTTGACACAGTCTCCATATGGTAAATCAAGATACCTGTATTGTCATAAATATATTAACGGCCATAGTTTAAAATAATTGACAACAACATAAGATAAATACCATGGCATCATGAGGTTCTATTTGCACATCTTGATACATCGTGAACTCTTACAGATTAGAGCGGGTACAATAATTGGCGACAATAGTTCCATGTAGAAATTTTGGATGACATGGAAGAGAGAGGGAAAGAGAGAGGAAACCAGCGGGCGACTAATTTGTCGCCCGGCTCCACGCGTTGCCGATGTCGTGGGCCCCGTAGATGGAGGAGCAACCCAACGCCTCCTGTATCCGCCATGGCTGCTCCTCTCGCCTGCGTTCGCTGGGCCAACGCCCTCGCCACCCCGACCGTCGCCGTTGCCTTGTGTCCACCAAATCGCTGCTCGCCGTCCATCGTGGCTGACGCTGTCTCTCGCGTCTGTCGTATTGTGGTCCTCGACCACCCTAGCCTTCATCGTCTCCTGCGTCTACCGGACCATGGCCGTCATCCTCCCTGACCTCCGCTTGTGTGCCGCTCATACATCCCAGCCTCTGACGGTGTCCATCGCGGCCGGCGCCCCAACAAGCGAGGTCCAATCTTTCCTCCGCCACCATCCACCCCTGCAGCCAGCTAGCCACTGCCCTTGCGCTCTGTTGGTCGCTGACTTCACCGATTAATCAAGAAGAAAAGTGAAAGGGGAAGAAGACCAGAAGGAATGGGAGGAAGATATCTGTAGAAGACCTTGTTCCTGGAGCCATTGAAAAGGAAAGAGAAAGAACACTGGAAGGAAAGGAAGTGGGAGGAAGAAAGAGAGAACATGGTGGGCCCCACAAAAATAATAAAGTTATGTTGCAGTAAATATAACATTTCTCTATTGTATATATTAGCTATAGTGTTAACTATATATGACATGTCTAATAATTGGAGCCAGTAGTTGGCTGTGTTAAAAAACCGTGCTTAACCTTAAATCCTTAATCTTCTCTCCTTGCCATGGATGTGGCTAATTGACGGCAGGAGGCAGCCGACAAGTGTGGCTGTGTGGGAGGTTGATGCTGGTACAGGAGACGACCAGCAGGCAGGAGGAGTGCTGAAGGTTGAGCACGGTTGTCAGTGCTGGCGAGGAGGCCACCGATGAGTGCAGAAGGTGACGGCGAGTAAGAGGCAGTGAGTGAGTGTGGGAGGTTGACGCTGGGAGTGGGCGGTGGCTGGCTTCTGTCTCCATTGCTGTTAGCCATCGACGCGTAGAAAAATCAGTTGGTCATCGGAAAATGCTACTAGTCGACTGGGCTTCACAGCAATGCTTGCTCCGCCACTGTGGCTGGCATGAATAGGAGGTCGACACCATTGGGTGGGAGATGGGTATAACCGTATAAGAAGGGGAAGGGAGCAAAGGTGTTTGATGGCAAGATGCATCAGTCGGGCTTAAATGGCAGTACAAGGGGAATGGAAGAGGAGAAAGAAACAGGGAAAAATGTGGCGTAGTATTATAGATGGGAAGTTTTGGTCCAATCTGTGGTGTGAATTGGTCCCTCAGAATTTTGTGGAATTCTTTGAAATTGGCAAATCATTGTTCTATGGATGAAACGATCTTCTTTTCTCTTCCCTTAATTTCCTACCTCGTATCTTCTCTCCCTTTGCCAAACCATAGGCTCCCCTTGCAAGAAGCTGAATTTCATTGCTGGCAACCTCCTCTTCCTTCCTCAGTTCCTCTCTCCTCTCCTCCTGTCCCCTTTCCCTTCTCTCTCGCCCTCATCCTTATAAAGCCCTAGTACCTCTTCTTGATATGCTGTATATGTGGGTGCTCTTATTGTCTCCAGCCACTGGTCATCTCCTCCCTCAAGATCTCCTTCGTTTATCAAGCCACAATCTGCCCATGAGGGCTGTGGAAGGATACAACGGCAAACTTTTGACAGTGATAGAAATGGAGGACCATCAACAGTGGTTAGGGTGCATCTCATCTCGATTTGCCTTTCTTCCAAACCTCCATCCCCATCAAGCACACACACATGAGATGGAGCCTTCTGGTGATTGCTGCCTGCCAATTAGGTGTGTAGGTAACGCCATTACAGTTATGGTTAAATACCTTAACAATGTGTCATGGTAAGTGGTAACGATGTCAATGTGGATATCAGTATGACTTTTAAGGAGCATATATGACTTGATTTGTAGTGAAAGGTCTATTTTCCTGCTGTCCTGCAAGGTGCAGTGATGACTTCTTTTTATTCCAATTTCTACCGATATTAGGAGGGAGTCATATGCGGTTAAGAGTTCCCTTCAATAGGTGTAGCATGCATCAATGTGTTCATTTTTTCACAAAAATAGAGAGCACATTAATCTGTAGGCATAAGCCATTTTGGGCACGATATTATGAAGGTGGGAATAATAAGATATTTTGTGAACTGTATCTAATCCCTATATTTATTCCATGGTCAGTTTCCTTTCCAAATCATGTAGCTTTTTTGTTTCTACATAGGAATGGTCGCTTTCTCCTCCAGTCACTGGGGAATATATTGCCACCTTCAGCAGTGTTAGACTCAGAGGAAGCTCTGAACAAGGGGAGTACAACAGCAACTGATGTTTTTGTGAGTTTAAGGACCAGAAGCATCCTCCACTTATTTGCTGCCACTGGAAGTTCTTTGGGCCTAAAG