Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR2197
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr3:95657619-95657812 [+]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029587
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - CUCUGUAGUGGCAGAGAGCAGAUC - 24
Stem-loop(if miRNA) --      A  G       -  -     GAAG  AA        G G     AUA  G       -  -     GAAG  AACA      G G       A
  CUCUGU GU GCAGAGA GC AGAUC    AU  UAGAUUUG C UCUCU   GU GCAGAGA GC AGAUC    AU    GAUUUG C UCUCUGU G
  |||||| || ||||||| || |||||    ||  |||||||| | |||||   || ||||||| || |||||    ||    |||||| | |||||||
  GAGGCG CG UGUCUCU CG UUUAG    UA  AUCUAGAU G AGAGG   CG UGUCUCU CG UUUAG    UA    CUAGAC G AGAGGCA C
GA      G  A       G  G     ACAA  GA        - -     CAG  A       G  G     ACGA  GAAG      - -       G
Stem-loop sequence CUCUGUAGUGGCAGAGAGCAGAUCGAAGAUAAUAGAUUUGGCGUCUCUAUAGUGGCAGAGAGCAGAUCGAAGAUAACAGAUUUGGCGUCUCUGUAGCGACGGAGAGCAGAUCGAAGAUAGCAGAUUUGGCGUCUCUGUAGCGACGGAGAGUAGAUCUAAGAUAACAGAUUUGGCGUCUCUGUAGCGGCGGAGAG