ncRNA ID | novel_gar_miR2197 |
Species | Gossypium arboreum |
Class | miRNA |
Genome position | Chr3:95657619-95657812 [+] |
Reference genome | Gossypium_arboreum_v1.0 |
Source | SRR1029587 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - CUCUGUAGUGGCAGAGAGCAGAUC - 24 |
Stem-loop(if miRNA) |
--      A  G       -  -     GAAG  AA        G G     AUA  G       -  -     GAAG  AACA      G G       A   CUCUGU GU GCAGAGA GC AGAUC    AU  UAGAUUUG C UCUCU   GU GCAGAGA GC AGAUC    AU    GAUUUG C UCUCUGU G   |||||| || ||||||| || |||||    ||  |||||||| | |||||   || ||||||| || |||||    ||    |||||| | |||||||   GAGGCG CG UGUCUCU CG UUUAG    UA  AUCUAGAU G AGAGG   CG UGUCUCU CG UUUAG    UA    CUAGAC G AGAGGCA C GA      G  A       G  G     ACAA  GA        - -     CAG  A       G  G     ACGA  GAAG      - -       G |
Stem-loop sequence | CUCUGUAGUGGCAGAGAGCAGAUCGAAGAUAAUAGAUUUGGCGUCUCUAUAGUGGCAGAGAGCAGAUCGAAGAUAACAGAUUUGGCGUCUCUGUAGCGACGGAGAGCAGAUCGAAGAUAGCAGAUUUGGCGUCUCUGUAGCGACGGAGAGUAGAUCUAAGAUAACAGAUUUGGCGUCUCUGUAGCGGCGGAGAG |