ncRNA ID | novel_gar_miR2119 |
Species | Gossypium arboreum |
Class | miRNA |
Genome position | Chr13:84589715-84589904 [-] |
Reference genome | Gossypium_arboreum_v1.0 |
Source | SRR1029587 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 167 - AUACGUACCAGAAGAUGCGUAGAU - 190 |
Stem-loop(if miRNA) |
--A      - C                      C   --    A A   A         A     C   C   -A   CAA  AGC     -U   A    UACGUA C AGAAGAUGCGUAGAUAAUUAAU GAU  AGUC C CAC AUGUGAAUC AACUA CAA CAA  GUA   CU   UCAAG  GAU U    |||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||| ||||||||| ||||| ||| |||  |||   ||   |||||  ||| C    AUGUAU G UCUUUUGUGUAUCUAUUAAUUA CUA  UCAG G GUG UACGCUUAG UUGGU GUU GUU  CAU   GA   AGUUC  CUG A CUC      C A                      A   CC    C C   C         C     A   A   GC   -CG  -AA     CU   U |
Stem-loop sequence | AUACGUACCAGAAGAUGCGUAGAUAAUUAAUCGAUAGUCACACACAAUGUGAAUCAAACUACCAACCAAAGUACAACUAGCUCAAGUGAUAUCAUGUCUCCUUGAAAAGGCUACCGUUGAUUGAUGGUUCGAUUCGCAUCGUGCGCGACUCCAUCAAUUAAUUAUCUAUGUGUUUUCUAGCUAUGUACUC |