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BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR2119
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr13:84589715-84589904 [-]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029587
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 167 - AUACGUACCAGAAGAUGCGUAGAU - 190
Stem-loop(if miRNA) --A      - C                      C   --    A A   A         A     C   C   -A   CAA  AGC     -U   A
   UACGUA C AGAAGAUGCGUAGAUAAUUAAU GAU  AGUC C CAC AUGUGAAUC AACUA CAA CAA  GUA   CU   UCAAG  GAU U
   |||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||| ||||||||| ||||| ||| |||  |||   ||   |||||  ||| C
   AUGUAU G UCUUUUGUGUAUCUAUUAAUUA CUA  UCAG G GUG UACGCUUAG UUGGU GUU GUU  CAU   GA   AGUUC  CUG A
CUC      C A                      A   CC    C C   C         C     A   A   GC   -CG  -AA     CU   U
Stem-loop sequence AUACGUACCAGAAGAUGCGUAGAUAAUUAAUCGAUAGUCACACACAAUGUGAAUCAAACUACCAACCAAAGUACAACUAGCUCAAGUGAUAUCAUGUCUCCUUGAAAAGGCUACCGUUGAUUGAUGGUUCGAUUCGCAUCGUGCGCGACUCCAUCAAUUAAUUAUCUAUGUGUUUUCUAGCUAUGUACUC