Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR2037
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr1:104999286-104999479 [-]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029587
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 171 - CUCUGUAGCGGCGGAGAGCAGAUU - 194
Stem-loop(if miRNA) --      A  G       --       GAAG   AUA      G G       A  --G     GA  -     GAAG  AACA      G G       A
  CUCUGU GC GCGGAGA  GCAGAUU    AUA   GAUUUG C UCUCUGU GC   GUGGA  GC AGAUC    AU    GAUUUG C UCUCUGU G
  |||||| || |||||||  |||||||    |||   |||||| | ||||||| ||   |||||  || |||||    ||    |||||| | |||||||
  GAGGCG UG UGUCUCU  UGUUUAG    UAU   CUAGAC G AGAGGCG UG   UAUCU  CG UUUAG    UA    CUAGAC G AGAGGCG C
GA      G  A       GC       ACAA   AAA      - -       G  AUG     -G  G     ACAA  GAAG      - -       G
Stem-loop sequence CUCUGUAGCGGCGGAGAGCAGAUUGAAGAUAAUAGAUUUGGCGUCUCUGUAGCGGUGGAGAGCAGAUCGAAGAUAACAGAUUUGGCGUCUCUGUAGCGGCGGAGAGCAGAUCGAAGAUAACAGAUUUGGCGUCUAUGUAGUGGCGGAGAGCAGAUCAAAUAUAACAGAUUUGUCGUCUCUGUAGUGGCGGAGAG