Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR2032
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr12:119450722-119450914 [-]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029587
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - AGGGACACAGGCGUGUGCUUGGCC - 24
Stem-loop(if miRNA) --UA   -     G  G        -AA  -     GA G            A    GG     -   CUG   G    A   -U    ----    GA  A GU
    GAG ACACG CC UGUGUCCC   CU GUGUA  A ACACGGCCUAGA CACG  CGUGU GUC   GCC UGUG CCC  AAAU    GCAU  UG U  U
    ||| ||||| || ||||||||   || |||||  | |||||||||||| ||||  ||||| |||   ||| |||| |||  ||||    ||||  || |
    UUC UGUGC GG ACACAGGG   GA CACAU  U UGUGCUGGAUCU GUGC  GCACA CAG   CGG GCAC GGG  UUUG    CGUA  AC A  A
CCGG   G     -  -        ACC  G     GA G            -    AG     A   ---   -    -   UU    AGCU    AG  A AU
Stem-loop sequence UAGAGACACGGCCGUGUGUCCCAACUGUGUAGAAGACACGGCCUAGAACACGGGCGUGUGUCCUGGCCGUGUGACCCUAAAUGCAUGAUGAUGUUAUAAACAGAAUGCUCGAGUUUUUGGGCACGGGCGACAACACGGACGUGUCUAGGUCGUGUGUAGUACACGAGCCAGGGACACAGGCGUGUGCUUGGCC