Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR1800
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr6:80349642-80349698 [+]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR3180721
Length 22
Mature sequence(if miRNA) 1 - UCAUGGGACUUCAAGUAGCUAU - 22
Stem-loop(if miRNA) --     GG     A   AG  AUA  A G
  UCAUG  ACUUC AGU  CU   GA C A
  |||||  ||||| |||  ||   || |
  GGUAU  UGAAG UUA  GA   CU G A
GA     -A     G   CU  --G  A A
Stem-loop sequence UCAUGGGACUUCAAGUAGCUAUAGAACGAAAGAUCGAGUCAUUGGAAGUAUAUGGAG