Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR1706
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr5:43726861-43727085 [-]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR3180720
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - AGGGACGUGUAAGUUUAGAUUAAU - 24
Stem-loop(if miRNA) --A        G  U  -   G          -       GAAUUAAUU       U      UUU     UU U    UUAG   U     GUUA         ----A     -AA    U
   AGUUUAGG UU AC UGU UUUUAGGUAU UAGGGUC         UUAAUGU UAUGGU   AGGGG  A GUUA    GGA UAGAA    UGAUUAAUG     UAAAA   UAAA U
   |||||||| || || ||| |||||||||| |||||||         ||||||| ||||||   |||||  | ||||    ||| |||||    |||||||||     |||||   |||| U
   UUAGAUUU AA UG GCA GGGAUUUAUA AUCUUAG         AAUUAUA AUAUUA   UCCCU  U UAAU    UUU AUCUU    AUUAAUUAC     GUUUU   AUUU A
UAA        G  -  U   -          U       ---------       U      --U     GU U    -UAA   U     -AGA         GAAUG     GGG    U
Stem-loop sequence AAGUUUAGGGUUUACUGUGUUUUAGGUAUUAGGGUCGAAUUAAUUUUAAUGUUUAUGGUUUUAGGGGUUAUGUUAUUAGGGAUUAGAAGUUAUGAUUAAUGAUAAAAAAUAAAUUUAUUUUAGGGUUUUGGUAAGCAUUAAUUAAGAUUCUAUUUUAAUUAAUUUUGUCCCUUAUUAUAUAUAUUAAGAUUCUAUAUAUUUAGGGACGUGUAAGUUUAGAUUAAU