ncRNA ID | novel_gar_miR1706 |
Species | Gossypium arboreum |
Class | miRNA |
Genome position | Chr5:43726861-43727085 [-] |
Reference genome | Gossypium_arboreum_v1.0 |
Source | SRR3180720 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - AGGGACGUGUAAGUUUAGAUUAAU - 24 |
Stem-loop(if miRNA) |
--A        G  U  -   G          -       GAAUUAAUU       U      UUU     UU U    UUAG   U     GUUA         ----A     -AA    U    AGUUUAGG UU AC UGU UUUUAGGUAU UAGGGUC         UUAAUGU UAUGGU   AGGGG  A GUUA    GGA UAGAA    UGAUUAAUG     UAAAA   UAAA U    |||||||| || || ||| |||||||||| |||||||         ||||||| ||||||   |||||  | ||||    ||| |||||    |||||||||     |||||   |||| U    UUAGAUUU AA UG GCA GGGAUUUAUA AUCUUAG         AAUUAUA AUAUUA   UCCCU  U UAAU    UUU AUCUU    AUUAAUUAC     GUUUU   AUUU A UAA        G  -  U   -          U       ---------       U      --U     GU U    -UAA   U     -AGA         GAAUG     GGG    U |
Stem-loop sequence | AAGUUUAGGGUUUACUGUGUUUUAGGUAUUAGGGUCGAAUUAAUUUUAAUGUUUAUGGUUUUAGGGGUUAUGUUAUUAGGGAUUAGAAGUUAUGAUUAAUGAUAAAAAAUAAAUUUAUUUUAGGGUUUUGGUAAGCAUUAAUUAAGAUUCUAUUUUAAUUAAUUUUGUCCCUUAUUAUAUAUAUUAAGAUUCUAUAUAUUUAGGGACGUGUAAGUUUAGAUUAAU |