Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR1687
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr3:91266326-91266419 [+]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR3180720
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 71 - AUCUGUAUCUGUAUCUGACUGUGC - 94
Stem-loop(if miRNA) --G   -A     G     -      ---UG     C  AAACU  A  UAU
   UAG  GGAUG GGGUA GGAUUC     CAUAU UA     GA UC   U
   |||  ||||| ||||| ||||||     ||||| ||     || ||
   GUC  UCUAU UCUAU UCUAGG     GUAUA AU     CU AG   A
CGU   AG     G     G      UCAAA     A  -----  A  UCU
Stem-loop sequence GUAGAGGAUGGGGGUAGGAUUCUGCAUAUCUAAAACUGAAUCUAUUAUCUGAAUCUAAAUAUGAAACUGGAUCUGUAUCUGUAUCUGACUGUGC