Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR1543
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr4:39527171-39527252 [-]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029586
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - AUUGGUCCGAUUGAUUGGUUCGAU - 24
Stem-loop(if miRNA) --         UG   A   G U  UCU     UUUGU  U
  CGAAUUAAU  GUC GAU A UU   UUGGA     AC U
  |||||||||  ||| ||| | ||   |||||     ||
  GCUUGGUUA  UAG CUG U AA   AAUCU     UG U
UA         GU   C   G U  UUU     UUGAU  G
Stem-loop sequence CGAAUUAAUUGGUCAGAUGAUUUUCUUUGGAUUUGUACUUUGGUUAGUUUCUAAUUUAAUUGGUCCGAUUGAUUGGUUCGAU