ncRNA ID | novel_gar_miR1540 |
Species | Gossypium arboreum |
Class | miRNA |
Genome position | Chr8:74181444-74181645 [+] |
Reference genome | Gossypium_arboreum_v1.0 |
Source | SRR3180720 |
Length | 21 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - UAGACUCAUAAUUCAGCAAAG - 21 |
Stem-loop(if miRNA) |
--   AC                 C    CUA  UU    CU   -UUAA   UCAA     AU  GA  AAC         C   U AA     CCA    UA   UAG  UCAUAAUUCAGCAAAGU GACA   AU  GGCU  CAA     GGA    CAUUU  UA  UG   AAACUAGAU GAU G  AUUGA   UGAU  A   |||  ||||||||||||||||| ||||   ||  ||||  |||     |||    |||||  ||  ||   ||||||||| ||| |  |||||   ||||   AUC  AGUAUUAGGUCGUUUCA CUGU   UA  UCGA  GUU     CCU    GUAGA  AU  AC   UUUGAUCUA UUA C  UGAUU   AUUA  U UA   CC                 A    -AA  UU    -U   CGUAA   -UUC     AU  AC  AAU         U   C CA     --A    UC |
Stem-loop sequence | UAGACUCAUAAUUCAGCAAAGUCGACACUAAUUUGGCUCUCAAUUAAGGAUCAACAUUUAUUAGAUGAACAAACUAGAUCGAUUGAAAUUGACCAUGAUUAAUCUAUUAAUUAGUACCCAUUUAUCUAGUUUUAACACAUAUAAGAUGCUUUCCAAUGCUUGUAGCUUUAUAAUGUCAACUUUGCUGGAUUAUGACCCUAAU |