Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR1432
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr4:8449319-8449425 [-]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR3180719
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 1 - UUUGCAUGAACUAGGAGACGU - 21
Stem-loop(if miRNA) --GG  G          G U    C   -A      -   UA   -A  A  AAA
    CU CUAGUUCAUG A GCCC UGG  UGCGUA CUU  GCC  GC UU   C
    || |||||||||| | |||| |||  |||||| |||  |||  || ||
    GA GAUCAAGUAC U UGGG AUC  ACGCGU GGA  CGG  CG AA   A
UGCA  G          G U    A   GA      A   GC   AC  A  GCU
Stem-loop sequence GGCUGCUAGUUCAUGGAUGCCCCUGGAUGCGUACUUUAGCCAGCAUUAAACAUCGAAAGCCAGGCCGAGGAUGCGCAAGCUAAGGGUUUGCAUGAACUAGGAGACGU