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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_034948
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position C:120434-121456[-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type intronic
Splice junction sequence TCTTGGCCTCATACGGCTCCTCGGGGGCCATAAATAAATCTAAGGACCAGATTATAATTTAGATGGATATGATGTGTTCTAAAATGGATTAAATATATCTCGATTAATTCGAAAGATAAATATATATTCCGTTTTTTAACTGATTCGTCTAGAAGAAACGGAATAGTAAAAATAAACGTTTCTGTTTCAACGAATCGCAC
Tissues whole_plant
Exon boundary No-Yes
Splicing signals GG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TCTTGGCCTCATACGGCTCCTCGGGGGCCATAAATAAATCTAAGGACCAGATTATAATTTAGATGGATATGATGTGTTCTAAAATGGATTAAATATATCTGGGGTCCCGAATTATACCAATGGAATTCTGTCTGCTCAAATTCTAAGAATAAAAAACGCGCTTCGGAATTCATCTCACCCCTTTACAAATTTGAATTTCTATTTGTTGAGTAATAACTTAACCCTTTAATAAAAAACTCCTAAAAAAAAAAAGTATTTAAGCCCATCGTGGTTTTCGATTACGAAAAATAATTAGACATCCTATTTTTTTATTATTCATGACAGAAATTCGATTTTATTTTCGAAATATATGAAAAAAAAAAGAGCCTTGTTTCGTTCCTATTCTTCTTTCTTTTTTAGAAAAAAGTTGGTAGACTTATAAAAAATAAAGGATTATTTCGTTTCTGATAGTCATTACATTTGTCGGTGGATAGGAGCATACTCTGAATCGGAATCTTGGGGAGTACTGTCTGATCATTTCTACTAATTTAAAGCCCCAATTAACCTTCTTTTTTTTATCTTATGTTAGGCCTAAATATCCTTTTCAATTTGGTTAATCTCTATTACAAATTCTTTGTGTATTTTGGTGTTTCTAACCATCCACTCACTTTTACCTAATTGCCGCTCACTTTGTAATACATGTATGTTAATCTATATAACTGATAGTGAAAACGTCATCCGGTTACCGGTTAATATATTTAACCCGCTTCAAGTCAGGATGACTAATCAACCAACCTTGGGGTAAAGTGATTCTTACACTTATGTTTATTTCCGTTTAACCTTTGTACATAGGAAATGAGACTCATTTTTCGTTTTACTGCAAATTTCAGAGCAGTTTTTTTTTCACTCATATATAACTATCAAATTCCTTTTATTAATTATTTCGATTAATTCGAAAGATAAATATATATTCCGTTTTTTAACTGATTCGTCTAGAAGAAACGGAATAGTAAAAATAAACGTTTCTGTTTCAACGAATCGCAC