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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_034915
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position C:114320-133793[NA]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type intergenic
Splice junction sequence AGCATCTCGGTTCGAGTCCGAGTAGCGGCATAAGATCTTCTAAAAGAGATATTATAAGTTTTATAATCAAAATAATACCCGACTTTTTTCTAAAATCGGGTTTCACGGTTTAGGCTGCTCCCATTTCGCTCGCCGCTACTACGGGAATCGCTTTTGCTTTCTTTTCCTCTGGCTACTAAGATGTTTCAGTTCGCCAGGTT
Tissues seed
Exon boundary No-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence AGCATCTCGGTTCGAGTCCGAGTAGCGGCATAAGATCTTCTAAAAGAGATATTATAAGTTTTATAATCAAAATAATACCCGACTTTTTTCTAAAATCGGGTAAAACCTAGTATTAATTTATTAATTTTTAACAAATTTTTTATGATTTTTTCAATTTTAGAGCATATATTAACTCATATATCTTTTTCGGTCGTTTCAATTGTGCTGACAATTTATTTTTTAACTTTATTAGTTAATTTAGATGAAATCATAGGATTTTTTGATTCATCAGATAAAGGAATCATAATTACGTTTTTTGGTATAACAGGATTATTATTAACTCGTTGGATTTATTCAGGACATTTTCCATTAAGTAATTTATATGAATCATTAATTTTTCTTTCGTGGGCTTTTTCAATTATTCATATGGTTTCCTATTTTAATAAAAAACAACAAAATAAGTTAAACACAATAACTGCGCCAAGTGTTATTTTTATTCAGGGTTTTGCTACTTCAGGTCTTTTAAACAAAATGCCTCAGTCTGCAATATTAGTACCAGCTCTCCAGTCCCAGTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGATATTAGGCTATGGCGCTCTGTTATGCGGATCATTATTATCAATAGCTCTTCTAGTGATTACATTTCGCAAAGTCGGACCTACTTTTTGGAAAAAGAATATAAAAAAAAATTTTTTATTAAATGAATTATTTTCTTTTGATGTACTTTACTACATAAATGAAAGAAATTCTATTTTACTACAACAAAACATTAATTTTAGTTTTTCTAGAAATTATTATAGGTATCAACTGATTCAACAATTAGATTTTTGGAGTTTTCGTATTATTAGTCTTGGATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTGTCTGGGCTAATGAGACATGGGGTTCATATTGGAACTGGGACCCAAAAGAAACTTGGGCATTTATTACTTGGACTATATTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGTTAGGGGTATAAATTCTGCAATTGTGGCTTTGATCGGTTTTATTTTAATTTGGATATGCTATTTTGGCGTCAATCTTTTAGGAATAGGTTTACATAGTTATGGTTCATTTACATCGAATTAAAGTAACAAATAAGAAGGAATCGAAATCTAAATAAAAAAATAAAAAAATAGCATCTATATCTAACTTCATATAAGTTAAGAAATCTCATTTAGTTTTAGTAGTAAATCATAAAGAACCTTTTGAATCAAGTAGTACAATGATTCAAAAGGTTCTCACAATACAAAGACCAAAGACTTCTGATTACAATTCACTTTAATGCTTTTTTTTTTCCTGAAAACTATCCATAAAAATAATTAGATAAAATGGATTCGACCTTGTCACTTGCTAATGAGAGCACAAAATCAGGATAAATCCCAATACCAATTATGGGTAAAAGAATAGAGATTGAAAGAAATAACTCTCGGGGTCCAGAATCAAAAAAAGAAAAGTTTTTGATATTAATTAACTTGTATCCATAGAACATTTGGCGTAACATAGATAATAAATATATAGGAGTTAATATCATTCCAATTGCCATTACAAAAATAATGAAAATTTTGGAAATTAAGAAATATTTTTGGCTGGTAATTATTCCAAAAAAAACAATGAATTCTGCAATAAAACCACTCATGCCCGGCAATGCAAGGGAAGCCATCGATAAAATAGTGAACATTGTAAATATTTTTGGAATGGAGATAGCCATTCCACCCATTTCATCAAGATAAACAAGCCTAATTCTATCATAACTCGTTCCTGCCAAGAAAAAAAGTGCAGCGCCAATAAATCCATGAGAAATTATTTGTAAAATAGCTCCATTAAGTCCAGGATCCGTTATAGAACTAATACCTATAATTATAAAACCCATATGAGATACAGAAGAATAGGCTATTCTCTTTTTTAAATTACGTTGACCGGGAGATGTTGAAGCTGCATAAATTATTTGGATTGTACCGACTACCAACAACCAAGGAGAAAACATAGAATGAGCGTGGGGTAATAATTCCATATTGATTCGAACCAACCCATAGGCTCCCATTTTTAATAAGATTCCAGCGAGAAGCATACAGGTACTGTAATGTGCCTCACCGTGGGTGTCAGGTAACCAAGTATGTAAAGGTATAATCGGTGATTTGACGGCAAAAGCAATAAGAAATCCAATATAAAATAGTATTTCAAGTGTAACAGGATAGGATTTATTAGCTAAGAGTTCTAAATTTAATGTTGGTTCGTTCGAACCATATAAACTTATACCTAAAACTCCTATTAATAAAAAAATAGAACTTCCTGCCGTGTACAAAATAAATTTTGTAGCCGAATACAGACGTTTCTTTCCACCCCACATGGATAAAAGTAGATAAACGGGAATTAATTCTAATTCCCACATGATGAAAAAAAGTAGAAGATCCCGAGAAGAAAATGATCCTATTTGACCGCTGTACATTGCTAACATCAGGAAATGAAAAAATCGGGAATCCCGAGTAACTGGAAAAGCCGCTAAAGTGGCTAAAGTAGTAATAAATCCCGTCAGTAAAATAGTTCCTATAGAAAGTCCATCTATTCCCATTCTCCAGTAAAAATCAAAAAAATCGATCCATTTATAATCTTCGGACAGTTGAATTAATGGATCGTCCATTTTAAAATTATAACAAAAAGCGTAGGTCGTTAGAAGAAGTTCTAAGATGCAAATGCATATAGTATACCATTTATTGACTTTATTTCCCCTATGCGGGAGAAATAACATTAATGAACCAGCAGATATTGGAAAAACAACAATTATTGTTAACCAAGGAAAATCATTCGTGGTAAAGACAAGATACACCAGGTCCAAAGAACGCGTACTCAAAAAAAATATATAAATAAAAAATTTTTAACTTTTTTGAGTACGAGTACTTGTCAATAAAAAAAATAAAATGTATTCCAAATTTATTCAAATGAGGTTTTCGGTAACGTATCAATAAGCTAGACCCATACTTCGAGTTGTTTCATGCCATAAATAAACTCGAACGCTCAAAAAATCCGTTGGACAGGCGGATTCACATCTCTTACAACCAACACAGTCCTCGGTTCTTGGAGCAGAAGCTATTTGCTTAGCTTTACATCCATCCCAAGGTATCATTTCTAATACGTCTGTAGGGCATGCTCGGACACATTGAGTACATCCTATACAAGTATCATAAATTTTTACTGAATGTGACATAGGATCGATAGTTTTTTGAATGTCATAAATTTTCAATCTAGTAAACTTCTAACTGAATGGTATATTAAAATACTAGATGAAGCAATGATTTCCTTTAATAGAATTTTTGTAATGAATTTTGGCTCAATTCATAAAAAATGGGGCTAAAATACTTTGATTTCTTAGATTTTTACAAATAGAATCTCGTAGGTCATAACTTATCATATATGCAAATTTCAATCTATAATTTTTTTAGTTATGTTACTTATTTAATAAGGTCGATTGGTTTATGCGAATTGATTTTCTGTTACGATAAATTGACGAGACTATAGCTAATCCAATAGCTGCTTCAGCGGCTGCAATTGCTATAACAAAAATGCAGAAAATTTCCCCTTTTAGTTGGGAATTATCAAAAAAATCAGAAAATGTTACGAAATTCATATTAACTGCATTGAGTATAAGTTCAAGACACATAAGAGCCCTAACCATATTTCGACTTGTGATCAATCCATAAAGACCAATCAAAAATAAATAGGCACTCAAAACAAGTACATGTTCGAGTATCATTCAGCAACTCCTTATCAATTTTGATTCATTTCAATATGAAAAATAATTCACCGGATTCCATCAACTAGAATATAACAAAAAAGTACGAATAAAAAAAATATTTAGGTAAAAAAAATTTTCAAATATATATCAAATACAAATATATATCAAATATAAAAATTGATCCTTAAAATATGAAATAGTATTCAATCAAATTTAATTGAATGAACGGAAAAAATCATAACATACACAAAGTTTTCTTTGGTCTTTAATAATTTAGAACATTTTTTATTGACGAGCCACAGAAATTGCACCTATCAAAGCAACTAAAAGAATTATTGAAATGAGTTCAAATGGCAGAAAAAAATCTGTTGATAAATGAATTCCTATTTGTTGACTATTACTTATTAAATCTTGCTCTAGAATCTGGTTTAATTTTGTAGTCCAAATAACCCCGTACCATGACGTATCGAGAATAGTAGACATTAATAAAAAAAGAATAGTTGTACAAACCAACGAAGTAATCCCATTCCCAATGGTCCACAGATTGAAATCTGTGGAATATTCTGAATCATTCATGAACATCACAGCAAATATGATTAAAACATTTATGGCCCCCACATAAATAAGGAGTTGTGCAGCAGCTACAAAATGGGAATTTGATAGAATATACAATAAAGATATACAAACAAGAACAAATCCTAAGGAAAAGGCTGAAAATATTGGGTTGGGAAGTAATACCACTCCCAGACCCCCTACTAGAAGACCGGATCCCAGAAAAACTAAAAGAAAATCATGTATTGGTCCAGGCAAATCCATTATATTATTAAAATAAGAAAAAATCGAAATCCTTTTCATGACCTTATTAATTTAACCAGGAAATTTGTTTTTTATATGTTTCTAAATAGAGTGAAATTAGAATCTAATGGATATGAATTGATGTAGATACAATTATTAGTATTAGGCTGTTTTCTCTTTTTTTTTTTCTAAAGTGTATTTTCAACCTATCAATTTCAAGAAAGTAATTACGAATATATTATATTAAAAGAATGTGCCTTAATACTTAATATTATTATTATTATATAAATACAATACAAGTTTTTAATTAAATTCTTTATATAAATATAATTCAACAACTTGGAATTCTTTTTTTAATCAAATTAAAGGGTTTACCCCATTTTTTGTTTGAGGTGAATTCCAAATTGTTCGAATAGTGTAATCGTCAATTACT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