Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_033734
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position C:74343-77754[-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CCAGATATAAAGATGGCGACTAGGGTTGCTGTTTCCATTATTATAGAATTGAAAGACCACACCGGATCTATGCTAAGATCATTTATTTACAACGGAATGGACTTTAGGTCTTTTTTAATTCAATTTATTCAATTGTAAAATAAACGACGTGGGTATCTAGGGAGGTATCTAGGGAGTAGTCATTTCCAAATGAATTCTCC
Tissues leaf
Exon boundary No-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CCAGATATAAAGATGGCGACTAGGGTTGCTGTTTCCATTATTATAGAATTGAAAGACCACACCGGATCTATGCTAAGATCATTTATTTACAACGGAATGGTATACAAAGTCAACAGATCGTAATGAATACAAAATAAGATTTATGGCTACACAAACTGTTGAAGATAGTTCTAGATCTGGTCCAAGAAGCACTACTGTAGGGAAGTTATTGAAACCATTGAATTCCGAATATGGTAAAGTAGCTCCCGGATGGGGAACGACCCCTTTGATGGGTGTTGCAATGGCTCTATTTGCGGTATTCCTATCTATTATTTTGGAGATTTATAATTCTTCTGTTCTACTGGATGGAATTTCAGTGAATTAGACTGAGAAGAATCTTGAAGTTCTAGCTTTTAGCTCGATACAAAAAAGTAAAGTATGCAGGTCTAACAATTTTAGCCTATTCTCCTTTGGTAGTTCGACCGCGAAATTTTTTTCTGCATTGTATATTTCCGGAATATGAGTGTGTGACTTGTTAGAATTGACCCTATGGATAGTACAGAGAATGGGGTCTGTCATCTTTATCAAGATGGTTTTACTTCGTCGGATATTCATTCGAGTATCTGGAGCACGAAATAGATCAAATAGATCACAAAGTATTCGAACTATGATTCATACTTAAATACTCAAACCTCGTAGCCGGACTTCTTTCCGTTCTATCTTATAAACTTTAATAAATCAAAAAAATTTTCTGCTTTTAAACTCTTATTTGGATCAAAGGACAAACGCTTCTTTGTATTTTATGTTTTTAGTCATTATAGCTTTTTTTTTATTGAATAAGTGATGATCCAATGGTTCTCACTCAGTGAACTTTGGACTTTGAAGGTTTCATTAAATTATCGTGGTTCTCGTATGAATCTGAGGTTTCAATTGATTAGTTAAGTAGGGTCTTAACAAGAGAATTCCTATCAATAATAAAGAAAACAAGAAGAAATCCCTGTCCCCGTTCCATACAAATACCAAATAAAAAAAGACAATAAAGATAGGTAATCTAGAAGATTCAAGAGGCCTGTAACGATCAACACAACATAAAGACGAATGAGCTTACTTGATTTTTTGGCATTTAACCACAAAGACGAGCTTTCGCATTTTGACTCTTTCATATCTTTAAATAATAAAAAATAATATTGAATGAGAGACAAGTTTAAAACTTTATATTCCATATCTGTTTCAATCAGTATTTGGGTCTTTTTTTGTTTGAGCTGTACGAGATGAAATTCTCATATACAGTTCTTGGAGGGGGAGTAACCTTGGTTTACCTATCTCAATAAAGTTTATGATTGGTTCGAAGAACGTCTTGAGATTCAGGCGATTGCAGATGATATAACTAGTAAATATGTTCCTCCGCATGTCAACATATTTTATTGTCTAGGCGGAATTACCCTTACTTGTTTTTTAGTACAAGTAGCTACGGGATTTGCTATGACTTTTTATTACCGTCCAACCGTTACTGAAGCTTTTGCTTCTGTTCAATATATAATGACTGAAGCTAACTTTGGTTGGTTAATCCGATCAGTTCATCGATGGTCGGCAAGTATGATGGTCCTAATGATGATCCTGCACGTATTTCGTGTATACCTCACCGGTGGTTTTAAAAAACCTCGCGAATTAACTTGGGTTACTGGTGTGGTTCTGGGTGTATTGACCGCATCTTTTGGTGTAACAGGTTATTCTTTACCTTGGGATCAAATTGGTTATTGGGCGGTCAAAATTGTAACAGGTGTACCTGACGCTATTCCGGTAATAGGATCACCTCTTGTAGAATTATTACGCGGAAGTGCTAGTGTTGGACAATCCACTTTGACTCGTTTTTATAGTTTACACACTTTTGTATTACCTCTTCTTACGGCCGTCTTTATGTTAATGCATTTCCTAATGATACGTAAGCAAGGTATTTCTGGTCCCTTATAAATAATATAGATTCTAGGTATTTGTACTTACTTATTACTTGGTGAAGGAACGATAGTATTTTATTGCTATAAATATGGATTATTAAAAAAATAAAACATGTATTTGGATATTTCCCTTCAACTCCACAATATTTTATTATTTTTTTGACATAAAAAGTTGAAGGGAATTCTATGAAGAGATAATGGATTATGGGAGTGTGTGACTTGAACTATTGATCGGGCCGTGCAGAAATATTACTTTATCTGCTACATTGGAATTCACAACCAAATGTGTCTTTGTTCCAACCACTGTGTAAGCCCCATACAGGGGATAGGCTGGTTCACTTGAAGAGAATCTTTTCTATGATCGTACCCGACGCTGTCGTGGATGAGTGGGCTCCGTAAAATCCAGTAGATTAAGGGATGGAACAAAATCCTGATTATGTTTTTAGTTATTTTGGACTAAAAAAAAAAAAGAAAATAATTATTAATAGTAATAGTATGTAAATGCATTCATTTTCTCTGCATCGACTCGATTTATGATACTATCGGAGTGAATACAGGATCTAATGAAGAGTAGAGGGTAGACTCCATTAGTAACAAGTAAATCCTTTGTATTTGAAAAATCTCGATATAATTGTTGAGATTAAGGACGAATTTATAAGGTATGAGACGACCCAGAAAGCACTTAATCATGATAAACTTTTTAAGCTTACGTGGGTGTTGAGCATTTACCTGTAAGAATGGAATTTCTTGAATCTTTAGTTGCAATAACTTTGGAATCGGATAATTAATTTTTACATATTAAATTATATTTTTTGTATGTATTCATTTAGTTTGGTTAATTCTTGCTCGAGCCGGATGATAAAAAATTATCATGTCCGGTTCCCTCGGGGGATGGATCCATAAGAATTCACCTATCCCAATAACAAAAAAACCAGATTTGAATGATCCTGTATTACGAGCTAAATTAGCTAAAGGTATGGGTCACAATTATTACGGGGAACCCGCATGGCCCAACGACCTTTTATATATTTTTCCAGTAGTTATTCTTGGTACCATTGCCTGTAACGTAGGCTTAGCGGTTTTAGAACCATCAATGATTGGTGAACCTGCGGATCCTTTTGCAACTCCTTTGGAAATATTACCTGAATGGTATTTCTTTCCTGTATTTCAAATACTTCGTACAGTGCCTAACAAATTATTGGGTGTTCTTTTAATGGTTTCAGTACCAGCGGGATTATTAACCGTACCCTTTTTGGAAAATGTTAATAAGTTTCAAAATCCATTTCGTCGTCCAGTAGCGACAACCGTCTTTTTGATTGGCACCGCGGCGGCCCTGTGGTTAGGTATTGGAGCAACATTACCGATTGATAAATCTCTAACTTTAGGTCTTTTTTAATTCAATTTATTCAATTGTAAAATAAACGACGTGGGTATCTAGGGAGGTATCTAGGGAGTAGTCATTTCCAAATGAATTCTCC