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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_033609
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position C:67403-70118[-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CTTCTATTTTTTTTGTTCTTGTTCTTTCTGGATCCTAAAATTAAAATAGAAGATTGAGGTGAATCATAAATCCAAAGGAGGTTTCATGGCCAAGGGTAAACTTTGTACATAAACCCTTGTGATGGTTTCGCGAAGTTTAAGTAATTCTTCCGCTTCCAAGATAAATTCTCCCGTTTGTGCCTCATAAAACGAACTAGCGG
Tissues whole_plant
Exon boundary No-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTTCTATTTTTTTTGTTCTTGTTCTTTCTGGATCCTAAAATTAAAATAGAAGATTGAGGTGAATCATAAATCCAAAGGAGGTTTCATGGCCAAGGGTAAAGATGTTCGAGTAACAATTATTTTGGAATGTACCAGTTGTGTTCGAAATGATATTAAGAAAGAAGCCGCGGGAATTTCCAGATATATTACTCAAAAGAATCGGCATAACACCCCTAGTCGATTGGAATTGAGAAAATTCTGTCCCTATTGTTATAAACATACAATTCACGGGGAAATCAAGAAATAGATCAAATTGAGTGCTTGTATGTCAACTTTTATTTTAAGAACAGGAATAATGCTAGTATCTATATATTATTACATATATATAAATATAAACAAATAAATCAATAGAAAGAAATCTAATCCGATATTCTTAATTCTATATAGAAATTCTATCCTATATAGAAATAGAAATCGTTTTTATTTTGATCCGATCAAAATAGGATTTTAGAGATAAGGAATAAAAATAAAAATTATGAATAAATCTAAGCGACTTTTTACTAAATCCAAGCGATCTTTTCGTAGGCGTTTGCCCCCGATCCAATCGGGGGATCGAATTGATTATAGAAACATGAGTTTAATTAGTCGATTTATTAGTGAACAAGGAAAAATATTATCTAGACGGGTGAATAGAGTGACTTTAAAACAACAACGATTAATCACTATTGCTATAAAACAAGCTCGTATTTTATCTTTGTTACCTTTTCTTAATAATCAGAAACAATTTGAAAGAAGTGAGTCGACTCCTAGAACTACTAGTCTTAGAACCAGAAAAAAATAGACTTATTTTTCAATTGAATAACAATTCCAATCTGAAGGAATTAAAAAAGAGATTAATGTTTTGTTCAAAAAATCCAATCAAGAATAAAAATTTGATTGTTACGTCTGTGTCTATTATAAAAAAAAAAAGAAAAGAATCGTCGAAAAGCATAACTCGTTTTTTCGAAACTATATACTCTCGTTTTGTTTTGACGACTTTTTTTTTAATACTAATTTCTACTCTACCTTCCCCGAGCTCATTCTCCTTAGAACTCTATTTCAAATATTTTCGTGGATTTCTTCCAATCCCCTTATTTTTTTATGTCATTCGAAATTGTATAAAGACAACTCCTATTTAATAGAGCTATTTGTGCAAGTATTTTCCGATTAAGAAGTAATTGCTTCTTGTATAGATTGTGTATGAATTCATTATAACTATAGAATACCCCCATTTCGTGAATTACGGCATTTATTCGAGTGATCCATAAACGGCGAAAATCTCTTTTTCTTTTACCCCTATCCCGATGAGCCGAAACTAAAGCTCTTATTCTCTGTTGAGTCATAGTTCGTGTAAGCCGTGAATGAGCCCCTCGAAAGCTTGATGCAAATAAACGAAGTTTTGTTCTACGCCTCCGAGCTATATATCCGCGTTTAATTCTAGTCATTGAATAAATCAAACTTTGATGAATAACTAATTCTTTTTTTAGTTATTCTTTTCCCCTTTACTAGTCTATTAATAACCAAACGAATTATTCCAATGTATAAAAAAAATTCCAATGGCTTTTGCTACTCTAACCTTCCCCACCACTATTTTTTGCTAGGTATTTTCCTTTACTTTGAAAGGCCTTGATATAAAAAAATAGAATAACTACAAAACGTAGTAAATAGAATTGGATAAATAGTGGGTTCCATCGTTTCTATGGTTACTTCTAAAACGGTGAGGTCCTCTCTATACACCGGAGCTCCTTCTTTTAATTAATCAATACTATTGGTAACTTGTACAATTCACATTCTTTGGCTCTACCCCATGAATATTCCAGTAATAGGTCTTTCACAATGAGATCCCCTTTATACAGTAACGGTATTTCATTTTGAAAATTGATTAGGTCATTTACCCTGTTAGTCCGTTCTTTTCTTTCAAGAGTGAAATCTTTTTTCTAAAAAATGGAATTTCCCCCGCTTAATGGATACTCATTTGTTATCATTGGGGGTTTTCTAAAAAATGGAGTTGATTGGATTTGCACCAATGTAAACCATAAGTTTCAGACACAATAGAGTATATGAACGATCTATATTTTGTAAATAATGAATCGAGTTCGTCCATTCTATTTTATTCATAGGTACTGATCCGTGATATTTCAAAAAGAATTTCCTTTTTATGTCTCAGTCTATGATCTAAACGAGTCGCACATACACCCGAGTACATGTTCCTCGTCGCTGAGGGCATCCCCGAAGCGCTGGGGATTTCGTGACGTTTCGGATTGGCTGTCTTGTATTTCTAATAAGTTGTTTAATGGTTGGCATACGGAATCATATAAATAATGGGCTGGTTTAGATTAGTTCTAACCGGCTAATTCTGAATTACTTCTCTTCAAGATTCTCTTCAATATTTTTTTATTTTTATATTGAAGAGAATATTAAACTAAACCTTTAATCTAAAAAGATATAAAATTCTAAATTGTAGATTTGCATGAAATCGCTCCTATTTTTTATTGAACCGCTACAAGATCAACAATTCCATGAGCTTGGGCTTCTGTTGCTGACATAAAAACATCCCGTTCCATGTCTTCGGATATAACCCATATAGGTTTGCCCGTTCTTTGTACATAAACCCTTGTGATGGTTTCGCGAAGTTTAAGTAATTCTTCCGCTTCCAAGATAAATTCTCCCGTTTGTGCCTCATAAAACGAACTAGCGG