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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_033438
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position C:56413-75719[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence TAATTCACGTTTGTTTTATTAGTTTAATTGCACTCGGCTCAATCTTTTTTTTACTAAAAAAGATTGAGCCGAGGTTATCTGTTGTATATACTATTTTTTTGGGGGAGTAACCTTGGTTTACCTATCTCAATAAAGTTTATGATTGGTTCGAAGAACGTCTTGAGATTCAGGCGATTGCAGATGATATAACTAGTAAATAT
Tissues leaf
Exon boundary No-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TAATTCACGTTTGTTTTATTAGTTTAATTGCACTCGGCTCAATCTTTTTTTTACTAAAAAAGATTGAGCCGAGGTTATCTGTTGTATATACTATTTTTTTTGATAGATACATACTTAAATTTAGATAGAAAAAAAACTCTTCAATAAAAAAAAGAAGATTAAACACAACTACAATTTTGTTATTGTAGTGTTGTGTCCACAAGAAATCCTATACGAAACATGGATTCTTAATTCTTAGGAGTGTTATATTCTTTCGTGTCAGGGCTTGAACCAAGTATCCCCGCTTCTTCTACCCCATCCTGCATGTTGTCCTTTTCTTTTCATTCCGTATTGGAATAAAAAAAGTTTTTTTTTATATTAGTATACGAGATTTTACTAAAAAAGTTCTTAATATTCTTATATTCATAAGCGAAGAACAAATATTTCTTTTTTTTTTATGAGAATTTTACACAATATAAGAAAATCCTTCTTTTCATTTAGAATTAAAATTGATTCATTTCAATTACTTTACTTAATAATCTTAGCAATTGCATCGATATGTTTTGCTTACTCTGAATAGAAAATGAACTATTCAAAAAAATTTTGCATTTTTCAATTTTTTCATTGAATGACTATTCATCTATTGTTATTGTATTTTCATTTAAATAGAGGCCAGAAGCTCTATGGAAAAATCGTGGTTCAATTTTATGTTTTCTAAGGGAGAATTGGAATACAGAGGTGAGCTAAGTAAAGCAATGGATAGTTTTGCTCCTGGTGAAAAGACTACTATAAGTCAAGACCGTTTTATATATGATATGGATAAAAACTTTTATGGTTGGGATGAGCGTTCTAGTTATTCTTCTAGTTATTCCAATAATGTTGATCTTTTAGTTAGCTCCAAGGACATTCGCAATTTCATATCGGATGACACCTTTTTTGTTAGGGATAGTAATAAGAATAGTTATTCTATATTTTTTGATAAAAAAAAAAAAATTTTTGAGATTGACAATGATTTTAGTGACCTAGAAAAATTTTTTTATAGTTATTGTAGTTCTAGTTATCTAAATAATAGATCTAAAGGTGACAACGATCTGCACTATGATCCTTACATTAAGGATACTAAATATAATTGTACTAATCACATTAATAGTTGCATTGATTCTTATTTTCGTTCTTACATCTGTATTGATAATAACTTTTTAATCGATAGTAATAATTTTAATGAAAGTTACATTTATAATTTCATTTGTAGTGAAAGCGGAAAGATTCGTGAAAGTAAAAATTACAAGATAAGAACTAATAGGAATCGTAGTAATTTAATAAGTTCTAAGGATTTCGATATAACTCAAAACTACAATCAATTGTGGATTCAATGCGACAATTGTTATGGATTAATGTATAAGAAAGTCAAAATGAATGTTTGTGAACAATGTGGACATTATTTGAAAATGAGTAGTTCAGAAAGAATCGAGCTTTCGATTGATCCGGGTACTTGGAATCCTATGGATGAAGACATGGTCTCTGCGGATCCCATTAAATTTCATTCGAAGGAGGAACCTTATAAAAACCGTATTGACTCTGCGCAAAAAACTACAGGATTGACTGACGCTGTTCAAACAGGTACAGGTCAACTAAACGGTATTCCGGTAGCCCTTGGGGTTATGGATTTTCGGTTTATGGGGGGTAGTATGGGATCCGTAGTAGGCGAAAAAATAACTCGTTTGATCGAGTATGCTACCAATCAATGTTTACCTCTTATTTTAGTGTGTTCTTCCGGAGGAGCACGAATGCAAGAAGGAAGTTTAAGTTTGATGCAAATGGCTAAAATTTCTTCGGTTTTATGTGATTATCAATCAAGTAAAAAGTTATTCTATATATCAATTCTTACATCTCCTACTACCGGTGGAGTGACAGCTAGTTTTGGTATGTTGGGGGATATCATTATTGCCGAACCCTATGCCTATATTGCATTTGCGGGTAAAAGAGTAATTGAACAAACATTGAAAAAAGCCGTGCCTGAAGGTTCACAAGCGGCTGAATCTTTATTACGTAAGGGCTTATTGGATGCAATTGTACCACGTAATCTTTTAAAAGGTGTTCTGAGCGAGTTATTTCAGCTCCATGCTTTTTTTCCTTTGAACACAAATTAAATAAAATAGAACGGTTAGTTTATCAGAATTAAACGAAAACCCAGAAAAATGCATTTTTCTTTCAAATCATTTTTTTTTATCGATATTCTTGTTTACTACTCAGTAAACCTCTATCAACAAGCTAAAAAGTGAATTTTTTTGGGGGGGAAGTTCAAATTAGACTAGACAAACAAAAAAAAGTTCATTTTCCTCCCTTGCTTGCATATGTATAGATAATTCAAATATAGATAGATGCAGATCTATAGAGAGTCTTCCATCTTTTTGCATTTCCCGAAAATTCCCTGTTGTTAGATCAGATTCTAATTTCTAATCAATTTTGTAGAAATTTGTAATGGAAGAAAAATTTTTCTTTATTAATGACTATTAACTATTATAAGATATTAAGACAAAAAGAATAATAAATCTAACAAGGGGATTATGATACATCTAGTTGTAGTTGATTTTGAAAGATGAATAAGTCCATTTATTTAGTTTGGCTTTTTTTGTACCTATTTTTTTATTCTATTTCTATTTCTATTCGGTTCTATTCTATATATTTCTATTAGGTTGTATATTAATATTAGATATATATTTACTTAAAGATACTTAGTATAATTATATAATAGATATAATAGAAATAATAAAAATACAAGATATTCTAAGATATCTTTAGAATTCAGAATATAACAATAACAGGTACAAATATTAAATTGAGGTACCCATTTTATGACAACTTTCAATAACTTACCCTCTATTTTTGTGCCTTTAGTAGGCCTAGTCTTTCCGGCAATTGCAATGGCTTCTTTATTTCTTCATATTCAAAAAAATAAGATTTTTTAGATCGGCTGAGACCGAATCATATCACCTTTTTTTTTTTATTTTAAAAACTTCGATTCGATAAGACCCATTTGGTAGAATGTTGTATAACACATAGATTCCTACAAACATAAATAAAAAAAACTCTTATGCATGTGTAAACGTAAAAAAATTTGCGCTCTTTTGAAAAATGGATCATCGTCGGGCCGATGTCTGAAATTCCAGTCAATCTATTTATTTGTATGTATATAACTATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTTATTTTTTTAGATATAAACAATTCTATGAATTACTCCTAAGGTAAAGGTTCACAACAAAATAGTTTATATTATAAGAGTTACTTTGAAAACAAAAAAAAGGAAAGTCATATTTTCTCAATTCCAAAAAATTGTATAACTGGATCTAATATATATGAGTTGGCGATCAGAATCTATATGGATAGAATTTATAACGGGGTCTCGAAAAACAAGTAATTTCTGCTGGGCCTTTATCCTATTTTTAGGTTCATTAGGATTCTTATTGGTTGGAACTTCCAGTTATCTTGGTAGAAATGTTATATCGTTATTTCCGTCCCAGCAAATCATTTTTTTTCCACAAGGGATTGTGATGTCTTTCTATGGGATCGCAGGTCTCTTTATTAGTTGCTATTTGTGGTGCACTATTTTGTGGAATGTGGGTAGTGGTTATGATCTTTTCGACCGAAAAGAAGGAATAGTGCGTATTTTTCGTTGGGGATTTCCTGGAAAAAGTCGTCGCATCTTTTTACGATTCTTTATGAAAGATATTCAGTCCATCAGAATAGAAGTTAAAGAGGGTGTTTCTGCCCGGCGTGTCCTTTATATGGAAATTCGAGGTCAAGGGGCTATTCCTTTAATTCGTACTGATGAGAATTTTACTACACGAGAAATTGAGCAAAAAGCTGCTGAATTGGCTTACTTCTTGCGTGTACCAATTGAAGTATTTTGAAATGAATTAATTAAATGCTTTGGCAGTAGGAAGAAAAAACGAAAGAATTTCTTTCTTTTTTTTTTCAATTGAATATTCATCTCTTCTTTTATGCTCGTTTTTTTGATATATTTGATAGAAAAGAAAAGGAGTTTATTTGTCTCGAAATTAGTATTGATCGAAAAAGGGGGGAATAACATCCCGGAAACCCCATTTTTTCTTGATTCAAGTTGGAAGTGTATTCTGAGTCTGTTTCTGTATTCTTTCTAGATTCAAAGCAAAGACTCAGTATTGAATCAACAGCAAAAGATAAAATGGATTCATAGGCTCACTATATTCTATTCGAATTAGAATAGAAACACATGCTCGATAGAAATATTAGATCTAATAGAATCAACAAATGAGGTAGGTTCATTAACAACTCACAGATTCAAAATGGCAAAAAAGAAAGCATTCATTCCTTTTTTTTATTTTCTATCTATAGTCTTTTTGCCCTGGTTGATCTCTCTCTGCTGTAATAAAAGTTTGAAAACTTGGATTACTAATTGGTGGAATACTAGACAATGCGAAACTTTTTTGAATGATATTCAAGAAAAAAGTTTTCTAGAAAAATTCATACAATTAGAGGAACTATTCCAGCTCGATGAAATGATAAAGGAATACCCAGAAACCAATTTACAACAATTTCGTCTAGGAATCCACAAAGAAACGATCCAATTCATCAAGATACACAATGAGTATAATATCCATACAATCTTGCACTTCTCGACAAATCTAATATCTTTCGTTATTCTAAGTGGTTATTCCTTTTGGGGTAAGGAAAAGCTTTTTATTCTGAATTCTTGGGTTCAAGAATTCCTATATAATTTAAGTGATACAATTAAAGCTTTTTCGATTCTTTTATTAACTGATTTATGTATCGGATTCCATTCGCCTCACGGTTGGGAACTAATGATTGGTTATATTTACAAAGATTTTGGGTTTGCTCATTATGAGCAAATTTTATCTGGTCTAGTTTCTACCTTTCCAGTAATTCTTGATACAATTTTTAAATATTGGATTTTTCGTTATTTAAATCGTGTATCTCCGTCACTTGTAGTGATTTAT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