Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_033191
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position C:55742-64044[+/-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type exonic
Splice junction sequence TTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGTTTGTCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTCGTTGGATGAACTGCATTGCTGATATTGACCCCAAAAAAGAAACGGTAGGTACAGCTAGTCCATGAACAGCCAACCAGCGCACTGTAAAAATTGGATAG
Tissues leaf
Exon boundary No-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGTTTGTCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCACGCTGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTCTATCTGGTGGAGATCATATTCACGCGGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGAAGGAGACAGGGAGTCAACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTATGTTGAAAAAGATCGAAGCCGCGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCACTACCTGGTGTTCTGCCTGTGGCTTCAGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCTGTACTACAATTCGGTGGAGGAACTTTAGGCCACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCCGTAGCCAACCGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCAGTCGAGGGTAATGAAATTATCCGTGAAGCTTGCAAATGGAGTCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAAGTATGGAAAGAGATCACATTTAACTTCCCAACCATCGATAAATTAGATGGCCAAGAGTAGATGAATTAGATTTAGTAATTCACGTTTGTTTTATTAGTTTAATTGCACTCGGCTCAATCTTTTTTTTACTAAAAAAGATTGAGCCGAGGTTATCTGTTGTATATACTATTTTTTTTGATAGATACATACTTAAATTTAGATAGAAAAAAAACTCTTCAATAAAAAAAAGAAGATTAAACACAACTACAATTTTGTTATTGTAGTGTTGTGTCCACAAGAAATCCTATACGAAACATGGATTCTTAATTCTTAGGAGTGTTATATTCTTTCGTGTCAGGGCTTGAACCAAGTATCCCCGCTTCTTCTACCCCATCCTGCATGTTGTCCTTTTCTTTTCATTCCGTATTGGAATAAAAAAAGTTTTTTTTTATATTAGTATACGAGATTTTACTAAAAAAGTTCTTAATATTCTTATATTCATAAGCGAAGAACAAATATTTCTTTTTTTTTTATGAGAATTTTACACAATATAAGAAAATCCTTCTTTTCATTTAGAATTAAAATTGATTCATTTCAATTACTTTACTTAATAATCTTAGCAATTGCATCGATATGTTTTGCTTACTCTGAATAGAAAATGAACTATTCAAAAAAATTTTGCATTTTTCAATTTTTTCATTGAATGACTATTCATCTATTGTTATTGTATTTTCATTTAAATAGAGGCCAGAAGCTCTATGGAAAAATCGTGGTTCAATTTTATGTTTTCTAAGGGAGAATTGGAATACAGAGGTGAGCTAAGTAAAGCAATGGATAGTTTTGCTCCTGGTGAAAAGACTACTATAAGTCAAGACCGTTTTATATATGATATGGATAAAAACTTTTATGGTTGGGATGAGCGTTCTAGTTATTCTTCTAGTTATTCCAATAATGTTGATCTTTTAGTTAGCTCCAAGGACATTCGCAATTTCATATCGGATGACACCTTTTTTGTTAGGGATAGTAATAAGAATAGTTATTCTATATTTTTTGATAAAAAAAAAAAAATTTTTGAGATTGACAATGATTTTAGTGACCTAGAAAAATTTTTTTATAGTTATTGTAGTTCTAGTTATCTAAATAATAGATCTAAAGGTGACAACGATCTGCACTATGATCCTTACATTAAGGATACTAAATATAATTGTACTAATCACATTAATAGTTGCATTGATTCTTATTTTCGTTCTTACATCTGTATTGATAATAACTTTTTAATCGATAGTAATAATTTTAATGAAAGTTACATTTATAATTTCATTTGTAGTGAAAGCGGAAAGATTCGTGAAAGTAAAAATTACAAGATAAGAACTAATAGGAATCGTAGTAATTTAATAAGTTCTAAGGATTTCGATATAACTCAAAACTACAATCAATTGTGGATTCAATGCGACAATTGTTATGGATTAATGTATAAGAAAGTCAAAATGAATGTTTGTGAACAATGTGGACATTATTTGAAAATGAGTAGTTCAGAAAGAATCGAGCTTTCGATTGATCCGGGTACTTGGAATCCTATGGATGAAGACATGGTCTCTGCGGATCCCATTAAATTTCATTCGAAGGAGGAACCTTATAAAAACCGTATTGACTCTGCGCAAAAAACTACAGGATTGACTGACGCTGTTCAAACAGGTACAGGTCAACTAAACGGTATTCCGGTAGCCCTTGGGGTTATGGATTTTCGGTTTATGGGGGGTAGTATGGGATCCGTAGTAGGCGAAAAAATAACTCGTTTGATCGAGTATGCTACCAATCAATGTTTACCTCTTATTTTAGTGTGTTCTTCCGGAGGAGCACGAATGCAAGAAGGAAGTTTAAGTTTGATGCAAATGGCTAAAATTTCTTCGGTTTTATGTGATTATCAATCAAGTAAAAAGTTATTCTATATATCAATTCTTACATCTCCTACTACCGGTGGAGTGACAGCTAGTTTTGGTATGTTGGGGGATATCATTATTGCCGAACCCTATGCCTATATTGCATTTGCGGGTAAAAGAGTAATTGAACAAACATTGAAAAAAGCCGTGCCTGAAGGTTCACAAGCGGCTGAATCTTTATTACGTAAGGGCTTATTGGATGCAATTGTACCACGTAATCTTTTAAAAGGTGTTCTGAGCGAGTTATTTCAGCTCCATGCTTTTTTTCCTTTGAACACAAATTAAATAAAATAGAACGGTTAGTTTATCAGAATTAAACGAAAACCCAGAAAAATGCATTTTTCTTTCAAATCATTTTTTTTTATCGATATTCTTGTTTACTACTCAGTAAACCTCTATCAACAAGCTAAAAAGTGAATTTTTTTGGGGGGGAAGTTCAAATTAGACTAGACAAACAAAAAAAAGTTCATTTTCCTCCCTTGCTTGCATATGTATAGATAATTCAAATATAGATAGATGCAGATCTATAGAGAGTCTTCCATCTTTTTGCATTTCCCGAAAATTCCCTGTTGTTAGATCAGATTCTAATTTCTAATCAATTTTGTAGAAATTTGTAATGGAAGAAAAATTTTTCTTTATTAATGACTATTAACTATTATAAGATATTAAGACAAAAAGAATAATAAATCTAACAAGGGGATTATGATACATCTAGTTGTAGTTGATTTTGAAAGATGAATAAGTCCATTTATTTAGTTTGGCTTTTTTTGTACCTATTTTTTTATTCTATTTCTATTTCTATTCGGTTCTATTCTATATATTTCTATTAGGTTGTATATTAATATTAGATATATATTTACTTAAAGATACTTAGTATAATTATATAATAGATATAATAGAAATAATAAAAATACAAGATATTCTAAGATATCTTTAGAATTCAGAATATAACAATAACAGGTACAAATATTAAATTGAGGTACCCATTTTATGACAACTTTCAATAACTTACCCTCTATTTTTGTGCCTTTAGTAGGCCTAGTCTTTCCGGCAATTGCAATGGCTTCTTTATTTCTTCATATTCAAAAAAATAAGATTTTTTAGATCGGCTGAGACCGAATCATATCACCTTTTTTTTTTTATTTTAAAAACTTCGATTCGATAAGACCCATTTGGTAGAATGTTGTATAACACATAGATTCCTACAAACATAAATAAAAAAAACTCTTATGCATGTGTAAACGTAAAAAAATTTGCGCTCTTTTGAAAAATGGATCATCGTCGGGCCGATGTCTGAAATTCCAGTCAATCTATTTATTTGTATGTATATAACTATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTTATTTTTTTAGATATAAACAATTCTATGAATTACTCCTAAGGTAAAGGTTCACAACAAAATAGTTTATATTATAAGAGTTACTTTGAAAACAAAAAAAAGGAAAGTCATATTTTCTCAATTCCAAAAAATTGTATAACTGGATCTAATATATATGAGTTGGCGATCAGAATCTATATGGATAGAATTTATAACGGGGTCTCGAAAAACAAGTAATTTCTGCTGGGCCTTTATCCTATTTTTAGGTTCATTAGGATTCTTATTGGTTGGAACTTCCAGTTATCTTGGTAGAAATGTTATATCGTTATTTCCGTCCCAGCAAATCATTTTTTTTCCACAAGGGATTGTGATGTCTTTCTATGGGATCGCAGGTCTCTTTATTAGTTGCTATTTGTGGTGCACTATTTTGTGGAATGTGGGTAGTGGTTATGATCTTTTCGACCGAAAAGAAGGAATAGTGCGTATTTTTCGTTGGGGATTTCCTGGAAAAAGTCGTCGCATCTTTTTACGATTCTTTATGAAAGATATTCAGTCCATCAGAATAGAAGTTAAAGAGGGTGTTTCTGCCCGGCGTGTCCTTTATATGGAAATTCGAGGTCAAGGGGCTATTCCTTTAATTCGTACTGATGAGAATTTTACTACACGAGAAATTGAGCAAAAAGCTGCTGAATTGGCTTACTTCTTGCGTGTACCAATTGAAGTATTTTGAAATGAATTAATTAAATGCTTTGGCAGTAGGAAGAAAAAACGAAAGAATTTCTTTCTTTTTTTTTTCAATTGAATATTCATCTCTTCTTTTATGCTCGTTTTTTTGATATATTTGATAGAAAAGAAAAGGAGTTTATTTGTCTCGAAATTAGTATTGATCGAAAAAGGGGGGAATAACATCCCGGAAACCCCATTTTTTCTTGATTCAAGTTGGAAGTGTATTCTGAGTCTGTTTCTGTATTCTTTCTAGATTCAAAGCAAAGACTCAGTATTGAATCAACAGCAAAAGATAAAATGGATTCATAGGCTCACTATATTCTATTCGAATTAGAATAGAAACACATGCTCGATAGAAATATTAGATCTAATAGAATCAACAAATGAGGTAGGTTCATTAACAACTCACAGATTCAAAATGGCAAAAAAGAAAGCATTCATTCCTTTTTTTTATTTTCTATCTATAGTCTTTTTGCCCTGGTTGATCTCTCTCTGCTGTAATAAAAGTTTGAAAACTTGGATTACTAATTGGTGGAATACTAGACAATGCGAAACTTTTTTGAATGATATTCAAGAAAAAAGTTTTCTAGAAAAATTCATACAATTAGAGGAACTATTCCAGCTCGATGAAATGATAAAGGAATACCCAGAAACCAATTTACAACAATTTCGTCTAGGAATCCACAAAGAAACGATCCAATTCATCAAGATACACAATGAGTATAATATCCATACAATCTTGCACTTCTCGACAAATCTAATATCTTTCGTTATTCTAAGTGGTTATTCCTTTTGGGGTAAGGAAAAGCTTTTTATTCTGAATTCTTGGGTTCAAGAATTCCTATATAATTTAAGTGATACAATTAAAGCTTTTTCGATTCTTTTATTAACTGATTTATGTATCGGATTCCATTCGCCTCACGGTTGGGAACTAATGATTGGTTATATTTACAAAGATTTTGGGTTTGCTCATTATGAGCAAATTTTATCTGGTCTAGTTTCTACCTTTCCAGTAATTCTTGATACAATTTTTAAATATTGGATTTTTCGTTATTTAAATCGTGTATCTCCGTCACTTGTAGTGATTTATCATGCAATAAACGACTAAAAAAAGATTCACTGATCCAATTTTAATCTTTCGTACCTTATACATCATAACCAAATCAAAGTCGTATTTACTTTACTTTTTTTACCCATGAGGGATTCCTTGTATATTTCAACAAAAAAAATTTGATTTTTTTCAGTAAATGTAAATAGCAGAATTGTGGCTAGGGAAGTATATTATCGACCTAGCTAACTTTATTGTAGAAATTTTCGGGATAAATGATTGGACCATGCAAACTAGAAATACCTTTTCTTGGATAAGGGAAGAGATTACTCGCTCCATATCTGTCTCACTCATAATATATATAATAACTTGGGCATCCATTTCAAGTGCATATCCGATTTTTGCCCAGCAGAATTATGAAAATCCACGAGAGGCGACTGGGCGTATTGTATGTGCCAATTGCCATTTAGCTAATAAGCCCGTGGATATTGAGGTTCCACAAACGGTACTTCCTGATACTGTATTTGAAGCAGTTGTTAAAATTCCTTATGATATGCAACTAAAACAAGTTCTAGCTAATGGTAAAAAAGGGGCTTTGAATGTGGGAGCTGTTCTTATTTTACCGGAGGGTTTTGAATTAGCCCCCCCCGATCGTATTTCACCCGAGATGAAAGAAAAGATAGGAAATCTTTCTTTTCAGAATTATCGTCCCAATAAAAAAAATATTCTTGTGATAGGTCCTGTTCCTGGTCAAAAATATAGTGAAATAACCTTTCCTATTCTTGCTCCAGACCCTGCTACTAATAAAGATGTTCACTTCTTAAAATATCCTATATATGTAGGTGGAAACAGGGGAAGGGGTCAGATTTATCCTGATGGTAGCAAAAGTAACAATACAGTTTATAATGCTACGGCAGGAGGGATAATAAGTAAAATTTTACGAAAAGAAAAGGGGGGATACGAAATAACCATAGTGGATGCATCGAATGGACGCGAAGTTATTGATATTATCCCTCGAGGCCTAGAACTTCTTGTTTCAGAGGGCGAATCCATTAAACTCGATCAACCATTAACGAGTAATCCTAATGTGGGTGGATTTGGTCAGGGGGATGCGGAAATAGTACTTCAAGATCCATTACGTGTCCAAGGTCTTTTGTTCTTCTTAGGATCGGTTGTTTTGGCACAAATCTTTTTGGTTCTTAAAAAGAAACAGTTTGAGAAGGTTCAATTATCCGAAATGAATTTTTAGATCTGTCTATTTAGCTTTATCAAATTCGTAAAAAAGAACAAAAAATTATGAAAACCTTTTGCCTCTCTTTAGATTTGCTATTCCTTTTCGACTAGATGTCAGGAATTACTTATATCATAGTCCTAATACTAGTATGTATATTGAGAAGAATTCACTTTACCCCCCTTTATTTATTTTTCAATAAAAATTTGAAAAATGAGAAGGGGTGTGATGTAACTCTGTCGTTATTGACCAATTGAAATTGATAGAATGTATCAATAATCAAGAGTTTTTTTCTAGTCAAATGGCAAAATTTGACTAGATACTAAAATAAGATAAGGAACACACGCGCCGAAAAAAAGGGGAACCATAAATCGGCGAAACAACAAGTTTTAGGGACTATAGGGAGTATTTTTTGTCTTGCTAGTCTTCGACACAAGAAAAGGAATTTTAGACATCCTTTTCTTGTGTCGATCTTGTCCTTCTTGATTCAATTCGTTAAAAACTCCTATTCTTAGTTTACATATATATATATATATTATAGTAGTTACTTTTTGTAGTTTTCTTTTTTTTTTTTTCAATTTTGATGAAATACTAAATAAATAAAATCAGAAAAAACTTCTATTTCGATTCTATTATAGTATAGACCAAATTTTAAATTTTAATGATAGATCTAATGATAAAAACTATTGTGTCAGCCGGGGAAGCAGGAAAAGGGAATGAAGTGATTCCCCTTTTTTATTCTATCTTTGAAAGATTAAAAAATACTATATGTTCATAATATACTAATTTAGTTAAGTTCATTTTTCAAAAACACGATAAAAAATTGTTCTGATTATTAGCAGTTCAACGGGACCCCCTCGAATCAGACAAAGAAGGAAGAGTTGGGCCCCGTTGAGTTCTTATGTTTTCACGTCTATAACTCAGCTCATCCAATTTCTACAGGGATGAACCTAATCCTGAATATGAACCATAAAAGAAAATACCTATTAAACCGATCACAAGAATACCAGCTACAGTACCTATTACCCAAAGAGGAATCCTTCCAGTAGTATCAGCCATTTATCCCGCTTCCCTCCACATTTAATCGAGTGGTCATGCTAGAAACATAAACAGTCAGAGATAATTATTATATATAATCCATCCGAATGGGATAATAAAATTACTACTCTTTATTTTTTATTTTATTATTCTACGCTCTTTTCTTAATTGAAGAAATAATTCGAAAATAAAACAGCAAGTACAAAAATGAGTAATAACCCCCAATAGAGACTGGTACGATTTAATTCAACACTTTGTTCGTTCGGATTTGATTGTGTCATAGCTCTATAATTGAATTAGGTTTATCGTTGGATGAACTGCATTGCTGATATTGACCCCAAAAAAGAAACGGTAGGTACAGCTAGTCCATGAACAGCCAACCAGCGCACTGTAAAAATTGGATAG