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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_033108
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position C:55557-73745[+/+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CAAAGATGATGAGAATGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCTATTTATAAATCACAGGCTGAAACAGGTTTGGGTGAGATTTTTGAATTAGATCGTGCGACTTTGAAATCTGATGGTGTTTTTCGTAGCAGCCCAAGAGGTTGGTTTACGTTTGGACATGCTTCGTTTG
Tissues leaf
Exon boundary No-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CAAAGATGATGAGAATGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCTATTTATAAATCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTATTTGAATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATCAAAAGAGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGTTTGTCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCACGCTGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTCTATCTGGTGGAGATCATATTCACGCGGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGAAGGAGACAGGGAGTCAACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTATGTTGAAAAAGATCGAAGCCGCGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCACTACCTGGTGTTCTGCCTGTGGCTTCAGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCTGTACTACAATTCGGTGGAGGAACTTTAGGCCACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCCGTAGCCAACCGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCAGTCGAGGGTAATGAAATTATCCGTGAAGCTTGCAAATGGAGTCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAAGTATGGAAAGAGATCACATTTAACTTCCCAACCATCGATAAATTAGATGGCCAAGAGTAGATGAATTAGATTTAGTAATTCACGTTTGTTTTATTAGTTTAATTGCACTCGGCTCAATCTTTTTTTTACTAAAAAAGATTGAGCCGAGGTTATCTGTTGTATATACTATTTTTTTTGATAGATACATACTTAAATTTAGATAGAAAAAAAACTCTTCAATAAAAAAAAGAAGATTAAACACAACTACAATTTTGTTATTGTAGTGTTGTGTCCACAAGAAATCCTATACGAAACATGGATTCTTAATTCTTAGGAGTGTTATATTCTTTCGTGTCAGGGCTTGAACCAAGTATCCCCGCTTCTTCTACCCCATCCTGCATGTTGTCCTTTTCTTTTCATTCCGTATTGGAATAAAAAAAGTTTTTTTTTATATTAGTATACGAGATTTTACTAAAAAAGTTCTTAATATTCTTATATTCATAAGCGAAGAACAAATATTTCTTTTTTTTTTATGAGAATTTTACACAATATAAGAAAATCCTTCTTTTCATTTAGAATTAAAATTGATTCATTTCAATTACTTTACTTAATAATCTTAGCAATTGCATCGATATGTTTTGCTTACTCTGAATAGAAAATGAACTATTCAAAAAAATTTTGCATTTTTCAATTTTTTCATTGAATGACTATTCATCTATTGTTATTGTATTTTCATTTAAATAGAGGCCAGAAGCTCTATGGAAAAATCGTGGTTCAATTTTATGTTTTCTAAGGGAGAATTGGAATACAGAGGTGAGCTAAGTAAAGCAATGGATAGTTTTGCTCCTGGTGAAAAGACTACTATAAGTCAAGACCGTTTTATATATGATATGGATAAAAACTTTTATGGTTGGGATGAGCGTTCTAGTTATTCTTCTAGTTATTCCAATAATGTTGATCTTTTAGTTAGCTCCAAGGACATTCGCAATTTCATATCGGATGACACCTTTTTTGTTAGGGATAGTAATAAGAATAGTTATTCTATATTTTTTGATAAAAAAAAAAAAATTTTTGAGATTGACAATGATTTTAGTGACCTAGAAAAATTTTTTTATAGTTATTGTAGTTCTAGTTATCTAAATAATAGATCTAAAGGTGACAACGATCTGCACTATGATCCTTACATTAAGGATACTAAATATAATTGTACTAATCACATTAATAGTTGCATTGATTCTTATTTTCGTTCTTACATCTGTATTGATAATAACTTTTTAATCGATAGTAATAATTTTAATGAAAGTTACATTTATAATTTCATTTGTAGTGAAAGCGGAAAGATTCGTGAAAGTAAAAATTACAAGATAAGAACTAATAGGAATCGTAGTAATTTAATAAGTTCTAAGGATTTCGATATAACTCAAAACTACAATCAATTGTGGATTCAATGCGACAATTGTTATGGATTAATGTATAAGAAAGTCAAAATGAATGTTTGTGAACAATGTGGACATTATTTGAAAATGAGTAGTTCAGAAAGAATCGAGCTTTCGATTGATCCGGGTACTTGGAATCCTATGGATGAAGACATGGTCTCTGCGGATCCCATTAAATTTCATTCGAAGGAGGAACCTTATAAAAACCGTATTGACTCTGCGCAAAAAACTACAGGATTGACTGACGCTGTTCAAACAGGTACAGGTCAACTAAACGGTATTCCGGTAGCCCTTGGGGTTATGGATTTTCGGTTTATGGGGGGTAGTATGGGATCCGTAGTAGGCGAAAAAATAACTCGTTTGATCGAGTATGCTACCAATCAATGTTTACCTCTTATTTTAGTGTGTTCTTCCGGAGGAGCACGAATGCAAGAAGGAAGTTTAAGTTTGATGCAAATGGCTAAAATTTCTTCGGTTTTATGTGATTATCAATCAAGTAAAAAGTTATTCTATATATCAATTCTTACATCTCCTACTACCGGTGGAGTGACAGCTAGTTTTGGTATGTTGGGGGATATCATTATTGCCGAACCCTATGCCTATATTGCATTTGCGGGTAAAAGAGTAATTGAACAAACATTGAAAAAAGCCGTGCCTGAAGGTTCACAAGCGGCTGAATCTTTATTACGTAAGGGCTTATTGGATGCAATTGTACCACGTAATCTTTTAAAAGGTGTTCTGAGCGAGTTATTTCAGCTCCATGCTTTTTTTCCTTTGAACACAAATTAAATAAAATAGAACGGTTAGTTTATCAGAATTAAACGAAAACCCAGAAAAATGCATTTTTCTTTCAAATCATTTTTTTTTATCGATATTCTTGTTTACTACTCAGTAAACCTCTATCAACAAGCTAAAAAGTGAATTTTTTTGGGGGGGAAGTTCAAATTAGACTAGACAAACAAAAAAAAGTTCATTTTCCTCCCTTGCTTGCATATGTATAGATAATTCAAATATAGATAGATGCAGATCTATAGAGAGTCTTCCATCTTTTTGCATTTCCCGAAAATTCCCTGTTGTTAGATCAGATTCTAATTTCTAATCAATTTTGTAGAAATTTGTAATGGAAGAAAAATTTTTCTTTATTAATGACTATTAACTATTATAAGATATTAAGACAAAAAGAATAATAAATCTAACAAGGGGATTATGATACATCTAGTTGTAGTTGATTTTGAAAGATGAATAAGTCCATTTATTTAGTTTGGCTTTTTTTGTACCTATTTTTTTATTCTATTTCTATTTCTATTCGGTTCTATTCTATATATTTCTATTAGGTTGTATATTAATATTAGATATATATTTACTTAAAGATACTTAGTATAATTATATAATAGATATAATAGAAATAATAAAAATACAAGATATTCTAAGATATCTTTAGAATTCAGAATATAACAATAACAGGTACAAATATTAAATTGAGGTACCCATTTTATGACAACTTTCAATAACTTACCCTCTATTTTTGTGCCTTTAGTAGGCCTAGTCTTTCCGGCAATTGCAATGGCTTCTTTATTTCTTCATATTCAAAAAAATAAGATTTTTTAGATCGGCTGAGACCGAATCATATCACCTTTTTTTTTTTATTTTAAAAACTTCGATTCGATAAGACCCATTTGGTAGAATGTTGTATAACACATAGATTCCTACAAACATAAATAAAAAAAACTCTTATGCATGTGTAAACGTAAAAAAATTTGCGCTCTTTTGAAAAATGGATCATCGTCGGGCCGATGTCTGAAATTCCAGTCAATCTATTTATTTGTATGTATATAACTATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTTATTTTTTTAGATATAAACAATTCTATGAATTACTCCTAAGGTAAAGGTTCACAACAAAATAGTTTATATTATAAGAGTTACTTTGAAAACAAAAAAAAGGAAAGTCATATTTTCTCAATTCCAAAAAATTGTATAACTGGATCTAATATATATGAGTTGGCGATCAGAATCTATATGGATAGAATTTATAACGGGGTCTCGAAAAACAAGTAATTTCTGCTGGGCCTTTATCCTATTTTTAGGTTCATTAGGATTCTTATTGGTTGGAACTTCCAGTTATCTTGGTAGAAATGTTATATCGTTATTTCCGTCCCAGCAAATCATTTTTTTTCCACAAGGGATTGTGATGTCTTTCTATGGGATCGCAGGTCTCTTTATTAGTTGCTATTTGTGGTGCACTATTTTGTGGAATGTGGGTAGTGGTTATGATCTTTTCGACCGAAAAGAAGGAATAGTGCGTATTTTTCGTTGGGGATTTCCTGGAAAAAGTCGTCGCATCTTTTTACGATTCTTTATGAAAGATATTCAGTCCATCAGAATAGAAGTTAAAGAGGGTGTTTCTGCCCGGCGTGTCCTTTATATGGAAATTCGAGGTCAAGGGGCTATTCCTTTAATTCGTACTGATGAGAATTTTACTACACGAGAAATTGAGCAAAAAGCTGCTGAATTGGCTTACTTCTTGCGTGTACCAATTGAAGTATTTTGAAATGAATTAATTAAATGCTTTGGCAGTAGGAAGAAAAAACGAAAGAATTTCTTTCTTTTTTTTTTCAATTGAATATTCATCTCTTCTTTTATGCTCGTTTTTTTGATATATTTGATAGAAAAGAAAAGGAGTTTATTTGTCTCGAAATTAGTATTGATCGAAAAAGGGGGGAATAACATCCCGGAAACCCCATTTTTTCTTGATTCAAGTTGGAAGTGTATTCTGAGTCT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