Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR1095
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr1:14016604-14016723 [+]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029588
Length 20
Mature sequence(if miRNA) 1 - CAGGGGAUUUAGCCUGGACA - 20
Stem-loop(if miRNA) --   GG     AGCC    CA   A   C    -A    A    --  -     - GA    G
  CAG  GAUUU    UGGA  GGU AUU UACC  UAAG UAUA  AG GAUCG C  GAGU U
  |||  |||||    ||||  ||| ||| ||||  |||| ||||  || ||||| |  ||||
  GUC  UUAGA    ACCU  UCG UAA AUGG  GUUC GUAU  UC CUAGU G  CUCA G
GA   UU     -GCU    -A   G   -    CA    A    CU  A     A AG    U
Stem-loop sequence CAGGGGAUUUAGCCUGGACAGGUAAUUCUACCAUAAGAUAUAAGGAUCGCGAGAGUGUGUACUCGAGAUGAUCACUUCUAUGACUUGACGGUAAAUGGCUAUCCAUCGAGAUUUUCUGAG