ncRNA ID | novel_gar_miR1095 |
Species | Gossypium arboreum |
Class | miRNA |
Genome position | Chr1:14016604-14016723 [+] |
Reference genome | Gossypium_arboreum_v1.0 |
Source | SRR1029588 |
Length | 20 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - CAGGGGAUUUAGCCUGGACA - 20 |
Stem-loop(if miRNA) |
--   GG     AGCC    CA   A   C    -A    A    --  -     - GA    G   CAG  GAUUU    UGGA  GGU AUU UACC  UAAG UAUA  AG GAUCG C  GAGU U   |||  |||||    ||||  ||| ||| ||||  |||| ||||  || ||||| |  ||||   GUC  UUAGA    ACCU  UCG UAA AUGG  GUUC GUAU  UC CUAGU G  CUCA G GA   UU     -GCU    -A   G   -    CA    A    CU  A     A AG    U |
Stem-loop sequence | CAGGGGAUUUAGCCUGGACAGGUAAUUCUACCAUAAGAUAUAAGGAUCGCGAGAGUGUGUACUCGAGAUGAUCACUUCUAUGACUUGACGGUAAAUGGCUAUCCAUCGAGAUUUUCUGAG |