Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR1088
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr1:121312895-121313004 [+]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029588
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 87 - ACUGGACUAAGAUCCGAAGGCAUU - 110
Stem-loop(if miRNA) --      - UG   G   U     ---A  GAA     -A  A  G        UGA
  UGUCUU G  UUU AGU CUAGU    AU   AAUAA  AU UA AUGUGUUA   U
  |||||| |  ||| ||| |||||    ||   |||||  || || ||||||||
  ACGGAA C  AGA UCA GGUCA    UA   UUAUU  UA GU UAUAUAGU   U
UU      G CU   A   -     AUAG  AGC     AG  C  G        UAU
Stem-loop sequence UGUCUUGUGUUUGAGUUCUAGUAAUGAAAAUAAAAUAUAGAUGUGUUAUGAUUUAUUGAUAUAUGUGCAUGAUUAUUCGAAUGAUAACUGGACUAAGAUCCGAAGGCAUU