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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_032911
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position C:55146-67059[+/+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence TGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAACACCGGTACTAAGTACTCTATGGTTCGGTTCGTTAGCAGGTTTATTAATAGAGATTAATCGTTTATTTCCAGATGCATTAACATTTCCCTTTTTTTCATT
Tissues leaf
Exon boundary No-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTTATTGCGTATGTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCGGTTACTAACATGTTTACCTCGATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCGAATCCCTCCTGCTTATACTAAAACTTTCCAAGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGGTTATCCGCGAAAAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAGAATGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCTATTTATAAATCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTATTTGAATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATCAAAAGAGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGTTTGTCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCACGCTGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTCTATCTGGTGGAGATCATATTCACGCGGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGAAGGAGACAGGGAGTCAACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTATGTTGAAAAAGATCGAAGCCGCGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCACTACCTGGTGTTCTGCCTGTGGCTTCAGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCTGTACTACAATTCGGTGGAGGAACTTTAGGCCACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCCGTAGCCAACCGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCAGTCGAGGGTAATGAAATTATCCGTGAAGCTTGCAAATGGAGTCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAAGTATGGAAAGAGATCACATTTAACTTCCCAACCATCGATAAATTAGATGGCCAAGAGTAGATGAATTAGATTTAGTAATTCACGTTTGTTTTATTAGTTTAATTGCACTCGGCTCAATCTTTTTTTTACTAAAAAAGATTGAGCCGAGGTTATCTGTTGTATATACTATTTTTTTTGATAGATACATACTTAAATTTAGATAGAAAAAAAACTCTTCAATAAAAAAAAGAAGATTAAACACAACTACAATTTTGTTATTGTAGTGTTGTGTCCACAAGAAATCCTATACGAAACATGGATTCTTAATTCTTAGGAGTGTTATATTCTTTCGTGTCAGGGCTTGAACCAAGTATCCCCGCTTCTTCTACCCCATCCTGCATGTTGTCCTTTTCTTTTCATTCCGTATTGGAATAAAAAAAGTTTTTTTTTATATTAGTATACGAGATTTTACTAAAAAAGTTCTTAATATTCTTATATTCATAAGCGAAGAACAAATATTTCTTTTTTTTTTATGAGAATTTTACACAATATAAGAAAATCCTTCTTTTCATTTAGAATTAAAATTGATTCATTTCAATTACTTTACTTAATAATCTTAGCAATTGCATCGATATGTTTTGCTTACTCTGAATAGAAAATGAACTATTCAAAAAAATTTTGCATTTTTCAATTTTTTCATTGAATGACTATTCATCTATTGTTATTGTATTTTCATTTAAATAGAGGCCAGAAGCTCTATGGAAAAATCGTGGTTCAATTTTATGTTTTCTAAGGGAGAATTGGAATACAGAGGTGAGCTAAGTAAAGCAATGGATAGTTTTGCTCCTGGTGAAAAGACTACTATAAGTCAAGACCGTTTTATATATGATATGGATAAAAACTTTTATGGTTGGGATGAGCGTTCTAGTTATTCTTCTAGTTATTCCAATAATGTTGATCTTTTAGTTAGCTCCAAGGACATTCGCAATTTCATATCGGATGACACCTTTTTTGTTAGGGATAGTAATAAGAATAGTTATTCTATATTTTTTGATAAAAAAAAAAAAATTTTTGAGATTGACAATGATTTTAGTGACCTAGAAAAATTTTTTTATAGTTATTGTAGTTCTAGTTATCTAAATAATAGATCTAAAGGTGACAACGATCTGCACTATGATCCTTACATTAAGGATACTAAATATAATTGTACTAATCACATTAATAGTTGCATTGATTCTTATTTTCGTTCTTACATCTGTATTGATAATAACTTTTTAATCGATAGTAATAATTTTAATGAAAGTTACATTTATAATTTCATTTGTAGTGAAAGCGGAAAGATTCGTGAAAGTAAAAATTACAAGATAAGAACTAATAGGAATCGTAGTAATTTAATAAGTTCTAAGGATTTCGATATAACTCAAAACTACAATCAATTGTGGATTCAATGCGACAATTGTTATGGATTAATGTATAAGAAAGTCAAAATGAATGTTTGTGAACAATGTGGACATTATTTGAAAATGAGTAGTTCAGAAAGAATCGAGCTTTCGATTGATCCGGGTACTTGGAATCCTATGGATGAAGACATGGTCTCTGCGGATCCCATTAAATTTCATTCGAAGGAGGAACCTTATAAAAACCGTATTGACTCTGCGCAAAAAACTACAGGATTGACTGACGCTGTTCAAACAGGTACAGGTCAACTAAACGGTATTCCGGTAGCCCTTGGGGTTATGGATTTTCGGTTTATGGGGGGTAGTATGGGATCCGTAGTAGGCGAAAAAATAACTCGTTTGATCGAGTATGCTACCAATCAATGTTTACCTCTTATTTTAGTGTGTTCTTCCGGAGGAGCACGAATGCAAGAAGGAAGTTTAAGTTTGATGCAAATGGCTAAAATTTCTTCGGTTTTATGTGATTATCAATCAAGTAAAAAGTTATTCTATATATCAATTCTTACATCTCCTACTACCGGTGGAGTGACAGCTAGTTTTGGTATGTTGGGGGATATCATTATTGCCGAACCCTATGCCTATATTGCATTTGCGGGTAAAAGAGTAATTGAACAAACATTGAAAAAAGCCGTGCCTGAAGGTTCACAAGCGGCTGAATCTTTATTACGTAAGGGCTTATTGGATGCAATTGTACCACGTAATCTTTTAAAAGGTGTTCTGAGCGAGTTATTTCAGCTCCATGCTTTTTTTCCTTTGAACACAAATTAAATAAAATAGAACGGTTAGTTTATCAGAATTAAACGAAAACCCAGAAAAATGCATTTTTCTTTCAAATCATTTTTTTTTATCGATATTCTTGTTTACTACTCAGTAAACCTCTATCAACAAGCTAAAAAGTGAATTTTTTTGGGGGGGAAGTTCAAATTAGACTAGACAAACAAAAAAAAGTTCATTTTCCTCCCTTGCTTGCATATGTATAGATAATTCAAATATAGATAGATGCAGATCTATAGAGAGTCTTCCATCTTTTTGCATTTCCCGAAAATTCCCTGTTGTTAGATCAGATTCTAATTTCTAATCAATTTTGTAGAAATTTGTAATGGAAGAAAAATTTTTCTTTATTAATGACTATTAACTATTATAAGATATTAAGACAAAAAGAATAATAAATCTAACAAGGGGATTATGATACATCTAGTTGTAGTTGATTTTGAAAGATGAATAAGTCCATTTATTTAGTTTGGCTTTTTTTGTACCTATTTTTTTATTCTATTTCTATTTCTATTCGGTTCTATTCTATATATTTCTATTAGGTTGTATATTAATATTAGATATATATTTACTTAAAGATACTTAGTATAATTATATAATAGATATAATAGAAATAATAAAAATACAAGATATTCTAAGATATCTTTAGAATTCAGAATATAACAATAACAGGTACAAATATTAAATTGAGGTACCCATTTTATGACAACTTTCAATAACTTACCCTCTATTTTTGTGCCTTTAGTAGGCCTAGTCTTTCCGGCAATTGCAATGGCTTCTTTATTTCTTCATATTCAAAAAAATAAGATTTTTTAGATCGGCTGAGACCGAATCATATCACCTTTTTTTTTTTATTTTAAAAACTTCGATTCGATAAGACCCATTTGGTAGAATGTTGTATAACACATAGATTCCTACAAACATAAATAAAAAAAACTCTTATGCATGTGTAAACGTAAAAAAATTTGCGCTCTTTTGAAAAATGGATCATCGTCGGGCCGATGTCTGAAATTCCAGTCAATCTATTTATTTGTATGTATATAACTATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTTATTTTTTTAGATATAAACAATTCTATGAATTACTCCTAAGGTAAAGGTTCACAACAAAATAGTTTATATTATAAGAGTTACTTTGAAAACAAAAAAAAGGAAAGTCATATTTTCTCAATTCCAAAAAATTGTATAACTGGATCTAATATATATGAGTTGGCGATCAGAATCTATATGGATAGAATTTATAACGGGGTCTCGAAAAACAAGTAATTTCTGCTGGGCCTTTATCCTATTTTTAGGTTCATTAGGATTCTTATTGGTTGGAACTTCCAGTTATCTTGGTAGAAATGTTATATCGTTATTTCCGTCCCAGCAAATCATTTTTTTTCCACAAGGGATTGTGATGTCTTTCTATGGGATCGCAGGTCTCTTTATTAGTTGCTATTTGTGGTGCACTATTTTGTGGAATGTGGGTAGTGGTTATGATCTTTTCGACCGAAAAGAAGGAATAGTGCGTATTTTTCGTTGGGGATTTCCTGGAAAAAGTCGTCGCATCTTTTTACGATTCTTTATGAAAGATAT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