Search result

BaseInfo

ncRNA ID	ath_circ_032828
Species	Arabidopsis thaliana
Class	circRNA
Genome position	C:55015-63015[+]
Reference genome	TAIR10
Source	PlantcircBase
Method	NA
Type	exonic
Splice junction sequence	TATAAATTGACTTACTATACTCCTGAATATGAAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGACTAGATACTAAAATAAGATAAGGAACACACGCGCCGAAAAAAAGGGGAACCATAAATCGGCGAAACAACAAGTTTTAGGGACTATAGGGAGTATTTTTT
Tissues	leaf
Exon boundary	No-No
Splicing signals	AG-GT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	TATAAATTGACTTACTATACTCCTGAATATGAAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCTGCGGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTTATTGCGTATGTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCGGTTACTAACATGTTTACCTCGATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCGAATCCCTCCTGCTTATACTAAAACTTTCCAAGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGGTTATCCGCGAAAAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAGAATGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCTATTTATAAATCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTATTTGAATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATCAAAAGAGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGTTTGTCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCACGCTGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTCTATCTGGTGGAGATCATATTCACGCGGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGAAGGAGACAGGGAGTCAACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTATGTTGAAAAAGATCGAAGCCGCGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCACTACCTGGTGTTCTGCCTGTGGCTTCAGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCTGTACTACAATTCGGTGGAGGAACTTTAGGCCACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCCGTAGCCAACCGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCAGTCGAGGGTAATGAAATTATCCGTGAAGCTTGCAAATGGAGTCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAAGTATGGAAAGAGATCACATTTAACTTCCCAACCATCGATAAATTAGATGGCCAAGAGTAGATGAATTAGATTTAGTAATTCACGTTTGTTTTATTAGTTTAATTGCACTCGGCTCAATCTTTTTTTTACTAAAAAAGATTGAGCCGAGGTTATCTGTTGTATATACTATTTTTTTTGATAGATACATACTTAAATTTAGATAGAAAAAAAACTCTTCAATAAAAAAAAGAAGATTAAACACAACTACAATTTTGTTATTGTAGTGTTGTGTCCACAAGAAATCCTATACGAAACATGGATTCTTAATTCTTAGGAGTGTTATATTCTTTCGTGTCAGGGCTTGAACCAAGTATCCCCGCTTCTTCTACCCCATCCTGCATGTTGTCCTTTTCTTTTCATTCCGTATTGGAATAAAAAAAGTTTTTTTTTATATTAGTATACGAGATTTTACTAAAAAAGTTCTTAATATTCTTATATTCATAAGCGAAGAACAAATATTTCTTTTTTTTTTATGAGAATTTTACACAATATAAGAAAATCCTTCTTTTCATTTAGAATTAAAATTGATTCATTTCAATTACTTTACTTAATAATCTTAGCAATTGCATCGATATGTTTTGCTTACTCTGAATAGAAAATGAACTATTCAAAAAAATTTTGCATTTTTCAATTTTTTCATTGAATGACTATTCATCTATTGTTATTGTATTTTCATTTAAATAGAGGCCAGAAGCTCTATGGAAAAATCGTGGTTCAATTTTATGTTTTCTAAGGGAGAATTGGAATACAGAGGTGAGCTAAGTAAAGCAATGGATAGTTTTGCTCCTGGTGAAAAGACTACTATAAGTCAAGACCGTTTTATATATGATATGGATAAAAACTTTTATGGTTGGGATGAGCGTTCTAGTTATTCTTCTAGTTATTCCAATAATGTTGATCTTTTAGTTAGCTCCAAGGACATTCGCAATTTCATATCGGATGACACCTTTTTTGTTAGGGATAGTAATAAGAATAGTTATTCTATATTTTTTGATAAAAAAAAAAAAATTTTTGAGATTGACAATGATTTTAGTGACCTAGAAAAATTTTTTTATAGTTATTGTAGTTCTAGTTATCTAAATAATAGATCTAAAGGTGACAACGATCTGCACTATGATCCTTACATTAAGGATACTAAATATAATTGTACTAATCACATTAATAGTTGCATTGATTCTTATTTTCGTTCTTACATCTGTATTGATAATAACTTTTTAATCGATAGTAATAATTTTAATGAAAGTTACATTTATAATTTCATTTGTAGTGAAAGCGGAAAGATTCGTGAAAGTAAAAATTACAAGATAAGAACTAATAGGAATCGTAGTAATTTAATAAGTTCTAAGGATTTCGATATAACTCAAAACTACAATCAATTGTGGATTCAATGCGACAATTGTTATGGATTAATGTATAAGAAAGTCAAAATGAATGTTTGTGAACAATGTGGACATTATTTGAAAATGAGTAGTTCAGAAAGAATCGAGCTTTCGATTGATCCGGGTACTTGGAATCCTATGGATGAAGACATGGTCTCTGCGGATCCCATTAAATTTCATTCGAAGGAGGAACCTTATAAAAACCGTATTGACTCTGCGCAAAAAACTACAGGATTGACTGACGCTGTTCAAACAGGTACAGGTCAACTAAACGGTATTCCGGTAGCCCTTGGGGTTATGGATTTTCGGTTTATGGGGGGTAGTATGGGATCCGTAGTAGGCGAAAAAATAACTCGTTTGATCGAGTATGCTACCAATCAATGTTTACCTCTTATTTTAGTGTGTTCTTCCGGAGGAGCACGAATGCAAGAAGGAAGTTTAAGTTTGATGCAAATGGCTAAAATTTCTTCGGTTTTATGTGATTATCAATCAAGTAAAAAGTTATTCTATATATCAATTCTTACATCTCCTACTACCGGTGGAGTGACAGCTAGTTTTGGTATGTTGGGGGATATCATTATTGCCGAACCCTATGCCTATATTGCATTTGCGGGTAAAAGAGTAATTGAACAAACATTGAAAAAAGCCGTGCCTGAAGGTTCACAAGCGGCTGAATCTTTATTACGTAAGGGCTTATTGGATGCAATTGTACCACGTAATCTTTTAAAAGGTGTTCTGAGCGAGTTATTTCAGCTCCATGCTTTTTTTCCTTTGAACACAAATTAAATAAAATAGAACGGTTAGTTTATCAGAATTAAACGAAAACCCAGAAAAATGCATTTTTCTTTCAAATCATTTTTTTTTATCGATATTCTTGTTTACTACTCAGTAAACCTCTATCAACAAGCTAAAAAGTGAATTTTTTTGGGGGGGAAGTTCAAATTAGACTAGACAAACAAAAAAAAGTTCATTTTCCTCCCTTGCTTGCATATGTATAGATAATTCAAATATAGATAGATGCAGATCTATAGAGAGTCTTCCATCTTTTTGCATTTCCCGAAAATTCCCTGTTGTTAGATCAGATTCTAATTTCTAATCAATTTTGTAGAAATTTGTAATGGAAGAAAAATTTTTCTTTATTAATGACTATTAACTATTATAAGATATTAAGACAAAAAGAATAATAAATCTAACAAGGGGATTATGATACATCTAGTTGTAGTTGATTTTGAAAGATGAATAAGTCCATTTATTTAGTTTGGCTTTTTTTGTACCTATTTTTTTATTCTATTTCTATTTCTATTCGGTTCTATTCTATATATTTCTATTAGGTTGTATATTAATATTAGATATATATTTACTTAAAGATACTTAGTATAATTATATAATAGATATAATAGAAATAATAAAAATACAAGATATTCTAAGATATCTTTAGAATTCAGAATATAACAATAACAGGTACAAATATTAAATTGAGGTACCCATTTTATGACAACTTTCAATAACTTACCCTCTATTTTTGTGCCTTTAGTAGGCCTAGTCTTTCCGGCAATTGCAATGGCTTCTTTATTTCTTCATATTCAAAAAAATAAGATTTTTTAGATCGGCTGAGACCGAATCATATCACCTTTTTTTTTTTATTTTAAAAACTTCGATTCGATAAGACCCATTTGGTAGAATGTTGTATAACACATAGATTCCTACAAACATAAATAAAAAAAACTCTTATGCATGTGTAAACGTAAAAAAATTTGCGCTCTTTTGAAAAATGGATCATCGTCGGGCCGATGTCTGAAATTCCAGTCAATCTATTTATTTGTATGTATATAACTATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTTATTTTTTTAGATATAAACAATTCTATGAATTACTCCTAAGGTAAAGGTTCACAACAAAATAGTTTATATTATAAGAGTTACTTTGAAAACAAAAAAAAGGAAAGTCATATTTTCTCAATTCCAAAAAATTGTATAACTGGATCTAATATATATGAGTTGGCGATCAGAATCTATATGGATAGAATTTATAACGGGGTCTCGAAAAACAAGTAATTTCTGCTGGGCCTTTATCCTATTTTTAGGTTCATTAGGATTCTTATTGGTTGGAACTTCCAGTTATCTTGGTAGAAATGTTATATCGTTATTTCCGTCCCAGCAAATCATTTTTTTTCCACAAGGGATTGTGATGTCTTTCTATGGGATCGCAGGTCTCTTTATTAGTTGCTATTTGTGGTGCACTATTTTGTGGAATGTGGGTAGTGGTTATGATCTTTTCGACCGAAAAGAAGGAATAGTGCGTATTTTTCGTTGGGGATTTCCTGGAAAAAGTCGTCGCATCTTTTTACGATTCTTTATGAAAGATATTCAGTCCATCAGAATAGAAGTTAAAGAGGGTGTTTCTGCCCGGCGTGTCCTTTATATGGAAATTCGAGGTCAAGGGGCTATTCCTTTAATTCGTACTGATGAGAATTTTACTACACGAGAAATTGAGCAAAAAGCTGCTGAATTGGCTTACTTCTTGCGTGTACCAATTGAAGTATTTTGAAATGAATTAATTAAATGCTTTGGCAGTAGGAAGAAAAAACGAAAGAATTTCTTTCTTTTTTTTTTCAATTGAATATTCATCTCTTCTTTTATGCTCGTTTTTTTGATATATTTGATAGAAAAGAAAAGGAGTTTATTTGTCTCGAAATTAGTATTGATCGAAAAAGGGGGGAATAACATCCCGGAAACCCCATTTTTTCTTGATTCAAGTTGGAAGTGTATTCTGAGTCTGTTTCTGTATTCTTTCTAGATTCAAAGCAAAGACTCAGTATTGAATCAACAGCAAAAGATAAAATGGATTCATAGGCTCACTATATTCTATTCGAATTAGAATAGAAACACATGCTCGATAGAAATATTAGATCTAATAGAATCAACAAATGAGGTAGGTTCATTAACAACTCACAGATTCAAAATGGCAAAAAAGAAAGCATTCATTCCTTTTTTTTATTTTCTATCTATAGTCTTTTTGCCCTGGTTGATCTCTCTCTGCTGTAATAAAAGTTTGAAAACTTGGATTACTAATTGGTGGAATACTAGACAATGCGAAACTTTTTTGAATGATATTCAAGAAAAAAGTTTTCTAGAAAAATTCATACAATTAGAGGAACTATTCCAGCTCGATGAAATGATAAAGGAATACCCAGAAACCAATTTACAACAATTTCGTCTAGGAATCCACAAAGAAACGATCCAATTCATCAAGATACACAATGAGTATAATATCCATACAATCTTGCACTTCTCGACAAATCTAATATCTTTCGTTATTCTAAGTGGTTATTCCTTTTGGGGTAAGGAAAAGCTTTTTATTCTGAATTCTTGGGTTCAAGAATTCCTATATAATTTAAGTGATACAATTAAAGCTTTTTCGATTCTTTTATTAACTGATTTATGTATCGGATTCCATTCGCCTCACGGTTGGGAACTAATGATTGGTTATATTTACAAAGATTTTGGGTTTGCTCATTATGAGCAAATTTTATCTGGTCTAGTTTCTACCTTTCCAGTAATTCTTGATACAATTTTTAAATATTGGATTTTTCGTTATTTAAATCGTGTATCTCCGTCACTTGTAGTGATTTATCATGCAATAAACGACTAAAAAAAGATTCACTGATCCAATTTTAATCTTTCGTACCTTATACATCATAACCAAATCAAAGTCGTATTTACTTTACTTTTTTTACCCATGAGGGATTCCTTGTATATTTCAACAAAAAAAATTTGATTTTTTTCAGTAAATGTAAATAGCAGAATTGTGGCTAGGGAAGTATATTATCGACCTAGCTAACTTTATTGTAGAAATTTTCGGGATAAATGATTGGACCATGCAAACTAGAAATACCTTTTCTTGGATAAGGGAAGAGATTACTCGCTCCATATCTGTCTCACTCATAATATATATAATAACTTGGGCATCCATTTCAAGTGCATATCCGATTTTTGCCCAGCAGAATTATGAAAATCCACGAGAGGCGACTGGGCGTATTGTATGTGCCAATTGCCATTTAGCTAATAAGCCCGTGGATATTGAGGTTCCACAAACGGTACTTCCTGATACTGTATTTGAAGCAGTTGTTAAAATTCCTTATGATATGCAACTAAAACAAGTTCTAGCTAATGGTAAAAAAGGGGCTTTGAATGTGGGAGCTGTTCTTATTTTACCGGAGGGTTTTGAATTAGCCCCCCCCGATCGTATTTCACCCGAGATGAAAGAAAAGATAGGAAATCTTTCTTTTCAGAATTATCGTCCCAATAAAAAAAATATTCTTGTGATAGGTCCTGTTCCTGGTCAAAAATATAGTGAAATAACCTTTCCTATTCTTGCTCCAGACCCTGCTACTAATAAAGATGTTCACTTCTTAAAATATCCTATATATGTAGGTGGAAACAGGGGAAGGGGTCAGATTTATCCTGATGGTAGCAAAAGTAACAATACAGTTTATAATGCTACGGCAGGAGGGATAATAAGTAAAATTTTACGAAAAGAAAAGGGGGGATACGAAATAACCATAGTGGATGCATCGAATGGACGCGAAGTTATTGATATTATCCCTCGAGGCCTAGAACTTCTTGTTTCAGAGGGCGAATCCATTAAACTCGATCAACCATTAACGAGTAATCCTAATGTGGGTGGATTTGGTCAGGGGGATGCGGAAATAGTACTTCAAGATCCATTACGTGTCCAAGGTCTTTTGTTCTTCTTAGGATCGGTTGTTTTGGCACAAATCTTTTTGGTTCTTAAAAAGAAACAGTTTGAGAAGGTTCAATTATCCGAAATGAATTTTTAGATCTGTCTATTTAGCTTTATCAAATTCGTAAAAAAGAACAAAAAATTATGAAAACCTTTTGCCTCTCTTTAGATTTGCTATTCCTTTTCGACTAGATGTCAGGAATTACTTATATCATAGTCCTAATACTAGTATGTATATTGAGAAGAATTCACTTTACCCCCCTTTATTTATTTTTCAATAAAAATTTGAAAAATGAGAAGGGGTGTGATGTAACTCTGTCGTTATTGACCAATTGAAATTGATAGAATGTATCAATAATCAAGAGTTTTTTTCTAGTCAAATGGCAAAATTTGACTAGATACTAAAATAAGATAAGGAACACACGCGCCGAAAAAAAGGGGAACCATAAATCGGCGAAACAACAAGTTTTAGGGACTATAGGGAGTATTTTTT