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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_032478
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position C:47898-56278[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CAAGATGATACTTCAGTAGATGATACCTCAGTAATGGTCGGCATAGCTTAATTGCGGGGGACTTAAAATCCCTGTGTCACATGATAATGATCCTTCAGTAGGCCACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCCGTAGCCAACCGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCAGTCGAGG
Tissues leaf
Exon boundary No-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CAAGATGATACTTCAGTAGATGATACCTCAGTAATGGTCGGCATAGCTTAATTGCGGGGGACTTAAAATCCCTGTGTCACATGATAATGATCCTTCAGTAAAGGTAGACATAGCTTTTTTGCAGAGGACTCGAAATCCTCGTGTCACCATTAGGAAAACGAGCATGATACTTCAGTAGATGATACTTGATACTTCAGTAGACTAATGGTGGACATAGCTTTTTTCCGGGGGACTTGAAATCGTTGTGCCACCATTCGTAAAACGAGGATGATCCTTCGCCGGGATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGTGTCACCAGTTCAAATCTGGTTCTTGGCAGAGGATTTATTAATTTTGATAAGTTTTTATTCTTCAAATTAAACGTATCTTTAGTAAAAAAAGTGCAATTATGCTTTATCCCCTCTCTTTTTTTTGTTCATGTTGTGAATCCAGCCGTTCAAAAAGAATGTATAATACTTGATACATAATACATATCCGAAAGGAAAGGTTAAATGAGTTCCGTTGAATCAAACAAGTAAAAAAAGGTCTATATGTATAGTATACTATAGTTGAAGGGCAAAAATACCCCAAGGTTCATTAGATACAATAGAAATAGAATTGTATCCCCCCCTTCATTTATTGCTTTCCGATCTTATTTATTCATTCCCAGTTATGTGACTAAAGTTGACTAAGTTATGTGCGCGATACAAAGTTCATAATGCAGAACTCTTTTTTTTTAGTTCATCCTATTGGCTCATTTTTTATCATTCAATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCACCCTATCCAACTCTCGGGCATTAGGATCCGTTTCAGTCGTGGATGGCTATCATAAGTGATTCCTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAAAATCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACGGATGGAATTCTAGGATTACTCCTGTGAGTAAATACTTTTATGCAGACTTCTTCCGCTTGATTAACACCATATTCTATTCTCGTAAGATGATACACGCTGGCTAAGAGGCCACCTGGTGCCACATCATAGGCACATTGCGAACGTAAATAATTGTAACCATATACATATAAAATTACAGCAATAGAATGCCAATCTTCGGGCTTTATTTGTAAAGTCTCTATTCCTTGATAATCGAAGCCCAACGATCTATGAACCAGCCCGCGTTTGGCTAGCCAAACGGACAAAGTGCCCTGCATCTTTTTTATTTCCCCCACACCTTTTTTATATAAAATTAAGTATTTCACATTTACCGTTAATTCTAATTTATGAAGATTTTTTTCTGATTCTCTAAAAGCCTCCCTAATTCACTAATTCGTGGGACGATACTGGACTTTTGTATTTAAAAAATGTTTCAGTAGAGATCTCTGAAGTAGATGATGGTGGATAGAGTAGTTCTTGATCATAATTTCCAATATGCGGACTGCGTACAACAAAAAACTTGTGATTGGTAGTAAAACACCGATTACCCTGTTGAGGTCTAATTCGATCCTTATAGATTTCTCTAGCTATTTTCTTACGAAGCTTTGTTATAGCGTCTATAACAGCCTCTGGTTTAGGTGGACAACCCGGCAAATAGACATCTACAGGAATTAGCTTATCAACTCCTCGAACAGTACTATAAGAATCGGTACTGAACATCCCCCCTGTAATTGTACAGGCTCCCATAGCAATAACATACTTCGGTTCAGGCATTTGTTCATATAATCGCACTAAAGAAGGAGCCATTTTCATTGTTACTGTACCTGCTGTTAAAATAAGGTCCGCCTGTCTAGGACTCGATCTTGGTACTAACCCATAACGATCAAAGTCAAATCGGGAGCCTATTAATGAGGCAAATTCAATGAAACAACAACTGGTACCATAAAGAAGCGGCCATAGGCTGGAAAGTCTTGACCAATTTGAAAGATCATTTAACGTAGTTGAAATAACGGAATTTTTTGTTGTTCGATCAAGTATGGGAAACTTAATGGAATTCATAATTGTTTCAATGGTTTTTTTTACTTTTTTTTTTTTTATTATTGTATCAAGTATTCGGTAAACGAACTAAGACCATTCCAATGCTCCTTTTCGCCATGCATAAACTAAACCAAGAATTAGGATAAGCACGAAAATGAAAGCTTCTATAAAAGCAGATACCCCCAGTACATCGAAACTCATTGCCCACGGATACAGAAAAACAGTTTCAACATCAAAAACAACAAAAACTAGAGCAAACATATAATAACGGATTCTAAATTGTAACCAAGCATCCCCGATCGGTTCTATACCTGATTCATAACTAGAAAGTTTCTCCGGCCCCTTCCTAATTGGAGATAAAACTCCGGAAATTAGAAATGCCAAAACAGGAATAGCACTTGATATTAGTAAAAATGCCCAGAAAATATCATATTCGTAAAGCAGAAACATAGACGAACTCCTATGAATGTGGAAAAAATACCCGCTTAGTCAATTCCAATCGGAGTGGATTGGGCAAGGGATATAGAACTCTTGAGTCAAAACAAAAATTCAGGTTAATCGAATCATTTTTTTTCGTTTGGTTGTTGTGGTAGACGTCTCGTTTTAAGATTTATTGATTTCTTATTTTCAGTACACTTATTACTTAATAGTTCCATGTTTCTATTACTAATAGTTTCTAATATAATAATATAATATTAATCTGATTAATAACTAGTAATTTTTTTTATTTCTGTTTATGTTTAAAAAAATTTTTCGAAAAATCTCTTCGTTTTTTAAATGATGACGTATCAAAAAATCCAGTAAGACTTTACCATACTCATCTTACTTAGTATTAGATAGATTGAATTTTGGTTGAATTTAATTAGATTTCTTTTTTTATTTTTAAACAAGGCCGTGTGATAAAAAAAGTAACCAAGATTGAGTGGGGATACAAAAAAAAAAAGAAAGTATTATGAACTTTTTGATTGTAGCTAGTGAACGAGGAAAATTCATATAAAAAAATTACAACTATGAAAATTAATGAAGAAAAAGGTTTATTCTAAATTATAAATTAAGTATCTATCTCGATATATCGATAGATAGTGATTGGCTCCATTGAAATAAAATGAAATTTTCCGTTTTATTCTGAACGATCCCCAGGACTTATGGTTTATGATATGGAAATTTTTTTTATGAACCGAGCAATTAAAAGTAACCTGTTAGAAATAAAGAATACAAAAAAAAGTAAAAAAATTTATCCAATTATTTTGATTTTAATGTGATTTTTTAGAATAAATTTCTTAGTTAGGGCTATACGGACTCGAACCGTAGACCTGCTCGGTAAAAGAGTTCGAACTTATTATTATCAAAATGATTCGAACTCTTTCAAAGACCCAACATGCATTTTTTTTTGCATTGGGCTCTTTCATTAACTGATCGAAAGATCAGTTAGTCTACCATATTTTTTCTTAAAAAAAAGATAAGAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTTGAATTCTAATACAATACAGAAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTCTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAACATCCTGATTAAAAAATCAAACATGAAACTTGATACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAAGATCATTTTTGAGTTCCTTATACTCATTCTACCTAGCATTGAGTAGACTGGGTATTCACCCTATCAATATCTCAAATCAATGATGGGTTCTATTCATTCCCTACCTAACGGGGTACTTTAATAGGACCTAATGTCAGGCTGTTGTTCTCCTCTTTTTTCCTAAAAAAAAGTCATGGAGTAAGACATCGATTTCTTAATAAGATCAATCAATTAGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTGAAAAACTTTGGCGCACGTGTAAACGAGGTGCTCTACCTAACTGAGCTATAGCCCTTGTGTTTGTGATACACATTTTATCTTATCATGTAGATAATTTCTTGTCAAGATTAATATTACATGATCGAACATTATATCTCTTTGATCTCATTGTTTATTGGTATTGCTTAGAAATAATATTGGATTTATAATCCTATCGATGTGATAGGTATCCCCTTTCCTTCTCTTTACAATGATAAATAACCTACTTAACTCAGTGGTTAGAGTATTGCTTTCATACGGCAGGAGTCATTGGTTCAAATCCAATAGTAGGTATAACTTATTAGACACCATGATCAATGGTGTCTAATAAGTTTTTGTAACCAGCTTTTTTTATTTTATTGTTTTTATCGTCTTTCGATCCTATTTTTTTTATACATTCTTTTTTTTTACACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCGTATTGAGAGCCTCGACTCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTAGCCTCAATTGTCTGTCTCTTACCTTCAGCTTTTCTCAAGTTAGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGGATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTGATTTCATTATTGCCTATTCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATCGTTAACCATTGGTTAGCAAGGCGTATTTTCAAAATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGGTTTGCTAATACACCAATTTGTCCACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCGGGAAGAGAATCAAATTCTCCGGAAAGGATCAAATTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAGGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATTTTTCGTGCTCTTGCTACG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