Search result

BaseInfo

ncRNA ID	ath_circ_032412
Species	Arabidopsis thaliana
Class	circRNA
Genome position	C:47120-56071[+]
Reference genome	TAIR10
Source	PlantcircBase
Method	NA
Type	exonic
Splice junction sequence	CTTGTGTTCATAAAGGAATCCTTCGATCGAAACTTCAAATCAAAAAGGATGAAGGATAAAAACCTATATTGTATAAATTTAGGTAACACAAAACGATCTCAGGGAGTCAACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTATGTTGAAAAAGATCGAAGCCGCGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCACTAC
Tissues	whole_plant
Exon boundary	No-No
Splicing signals	AC-CT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	CTTGTGTTCATAAAGGAATCCTTCGATCGAAACTTCAAATCAAAAAGGATGAAGGATAAAAACCTATATTGTATAAATTTAGGTAACACAAAACGATCTCAAAAATGACGACCTGAATCTCGATTTCTATTTTTTTATAAACAAAATCAAAATGTTGTGAATCAATTCGAAGTTTAAGAAATAATATTTCTTGATTAAAATAAAATTATTCACTTCATAGTCTGATAGATCCTTGATGGAACTTAATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTTTACATGTCAATACTGACAACAATGAAATTTATAGTAAGATGAAAATCCGTTGACTTTTAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAGCTCTACTCCCCGAAAAGGTTGACACCTTACCTTTTTTTCGTTATTATTTATTTGAATTATTTATAATCTATATCATTTTTCATTTTCAAACTTAGAAAGTCTTCTTTTATTTATAAAATCCAAGAAATTCCCGGTCCACAACTTTTTGAATTTACTACTTTTGAGTTTCTTTTCATTGACATAGACCTAAGTCATATATTAAAATGATACTGATACTTCAGTAGATTATACTTCGGTAATGGTACACATAGCTTAATTGCGGGGGACTGAAAATCCTTGTGTCACCATTAGTAAAAGCAAGATGATCCTTCGGTAATGGTCGACATAGCTTAGTTGCAGAGGACTGAAAATCCTTATGTCACCATTAGTAGAGGACTGAAAATCCTTATGTCACCATTAGTAAAAGCAAGATGATACTTCAGTAGATGATACCTCAGTAATGGTCGGCATAGCTTAATTGCGGGGGACTTAAAATCCCTGTGTCACATGATAATGATCCTTCAGTAAAGGTAGACATAGCTTTTTTGCAGAGGACTCGAAATCCTCGTGTCACCATTAGGAAAACGAGCATGATACTTCAGTAGATGATACTTGATACTTCAGTAGACTAATGGTGGACATAGCTTTTTTCCGGGGGACTTGAAATCGTTGTGCCACCATTCGTAAAACGAGGATGATCCTTCGCCGGGATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGTGTCACCAGTTCAAATCTGGTTCTTGGCAGAGGATTTATTAATTTTGATAAGTTTTTATTCTTCAAATTAAACGTATCTTTAGTAAAAAAAGTGCAATTATGCTTTATCCCCTCTCTTTTTTTTGTTCATGTTGTGAATCCAGCCGTTCAAAAAGAATGTATAATACTTGATACATAATACATATCCGAAAGGAAAGGTTAAATGAGTTCCGTTGAATCAAACAAGTAAAAAAAGGTCTATATGTATAGTATACTATAGTTGAAGGGCAAAAATACCCCAAGGTTCATTAGATACAATAGAAATAGAATTGTATCCCCCCCTTCATTTATTGCTTTCCGATCTTATTTATTCATTCCCAGTTATGTGACTAAAGTTGACTAAGTTATGTGCGCGATACAAAGTTCATAATGCAGAACTCTTTTTTTTTAGTTCATCCTATTGGCTCATTTTTTATCATTCAATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCACCCTATCCAACTCTCGGGCATTAGGATCCGTTTCAGTCGTGGATGGCTATCATAAGTGATTCCTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAAAATCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACGGATGGAATTCTAGGATTACTCCTGTGAGTAAATACTTTTATGCAGACTTCTTCCGCTTGATTAACACCATATTCTATTCTCGTAAGATGATACACGCTGGCTAAGAGGCCACCTGGTGCCACATCATAGGCACATTGCGAACGTAAATAATTGTAACCATATACATATAAAATTACAGCAATAGAATGCCAATCTTCGGGCTTTATTTGTAAAGTCTCTATTCCTTGATAATCGAAGCCCAACGATCTATGAACCAGCCCGCGTTTGGCTAGCCAAACGGACAAAGTGCCCTGCATCTTTTTTATTTCCCCCACACCTTTTTTATATAAAATTAAGTATTTCACATTTACCGTTAATTCTAATTTATGAAGATTTTTTTCTGATTCTCTAAAAGCCTCCCTAATTCACTAATTCGTGGGACGATACTGGACTTTTGTATTTAAAAAATGTTTCAGTAGAGATCTCTGAAGTAGATGATGGTGGATAGAGTAGTTCTTGATCATAATTTCCAATATGCGGACTGCGTACAACAAAAAACTTGTGATTGGTAGTAAAACACCGATTACCCTGTTGAGGTCTAATTCGATCCTTATAGATTTCTCTAGCTATTTTCTTACGAAGCTTTGTTATAGCGTCTATAACAGCCTCTGGTTTAGGTGGACAACCCGGCAAATAGACATCTACAGGAATTAGCTTATCAACTCCTCGAACAGTACTATAAGAATCGGTACTGAACATCCCCCCTGTAATTGTACAGGCTCCCATAGCAATAACATACTTCGGTTCAGGCATTTGTTCATATAATCGCACTAAAGAAGGAGCCATTTTCATTGTTACTGTACCTGCTGTTAAAATAAGGTCCGCCTGTCTAGGACTCGATCTTGGTACTAACCCATAACGATCAAAGTCAAATCGGGAGCCTATTAATGAGGCAAATTCAATGAAACAACAACTGGTACCATAAAGAAGCGGCCATAGGCTGGAAAGTCTTGACCAATTTGAAAGATCATTTAACGTAGTTGAAATAACGGAATTTTTTGTTGTTCGATCAAGTATGGGAAACTTAATGGAATTCATAATTGTTTCAATGGTTTTTTTTACTTTTTTTTTTTTTATTATTGTATCAAGTATTCGGTAAACGAACTAAGACCATTCCAATGCTCCTTTTCGCCATGCATAAACTAAACCAAGAATTAGGATAAGCACGAAAATGAAAGCTTCTATAAAAGCAGATACCCCCAGTACATCGAAACTCATTGCCCACGGATACAGAAAAACAGTTTCAACATCAAAAACAACAAAAACTAGAGCAAACATATAATAACGGATTCTAAATTGTAACCAAGCATCCCCGATCGGTTCTATACCTGATTCATAACTAGAAAGTTTCTCCGGCCCCTTCCTAATTGGAGATAAAACTCCGGAAATTAGAAATGCCAAAACAGGAATAGCACTTGATATTAGTAAAAATGCCCAGAAAATATCATATTCGTAAAGCAGAAACATAGACGAACTCCTATGAATGTGGAAAAAATACCCGCTTAGTCAATTCCAATCGGAGTGGATTGGGCAAGGGATATAGAACTCTTGAGTCAAAACAAAAATTCAGGTTAATCGAATCATTTTTTTTCGTTTGGTTGTTGTGGTAGACGTCTCGTTTTAAGATTTATTGATTTCTTATTTTCAGTACACTTATTACTTAATAGTTCCATGTTTCTATTACTAATAGTTTCTAATATAATAATATAATATTAATCTGATTAATAACTAGTAATTTTTTTTATTTCTGTTTATGTTTAAAAAAATTTTTCGAAAAATCTCTTCGTTTTTTAAATGATGACGTATCAAAAAATCCAGTAAGACTTTACCATACTCATCTTACTTAGTATTAGATAGATTGAATTTTGGTTGAATTTAATTAGATTTCTTTTTTTATTTTTAAACAAGGCCGTGTGATAAAAAAAGTAACCAAGATTGAGTGGGGATACAAAAAAAAAAAGAAAGTATTATGAACTTTTTGATTGTAGCTAGTGAACGAGGAAAATTCATATAAAAAAATTACAACTATGAAAATTAATGAAGAAAAAGGTTTATTCTAAATTATAAATTAAGTATCTATCTCGATATATCGATAGATAGTGATTGGCTCCATTGAAATAAAATGAAATTTTCCGTTTTATTCTGAACGATCCCCAGGACTTATGGTTTATGATATGGAAATTTTTTTTATGAACCGAGCAATTAAAAGTAACCTGTTAGAAATAAAGAATACAAAAAAAAGTAAAAAAATTTATCCAATTATTTTGATTTTAATGTGATTTTTTAGAATAAATTTCTTAGTTAGGGCTATACGGACTCGAACCGTAGACCTGCTCGGTAAAAGAGTTCGAACTTATTATTATCAAAATGATTCGAACTCTTTCAAAGACCCAACATGCATTTTTTTTTGCATTGGGCTCTTTCATTAACTGATCGAAAGATCAGTTAGTCTACCATATTTTTTCTTAAAAAAAAGATAAGAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTTGAATTCTAATACAATACAGAAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTCTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAACATCCTGATTAAAAAATCAAACATGAAACTTGATACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAAGATCATTTTTGAGTTCCTTATACTCATTCTACCTAGCATTGAGTAGACTGGGTATTCACCCTATCAATATCTCAAATCAATGATGGGTTCTATTCATTCCCTACCTAACGGGGTACTTTAATAGGACCTAATGTCAGGCTGTTGTTCTCCTCTTTTTTCCTAAAAAAAAGTCATGGAGTAAGACATCGATTTCTTAATAAGATCAATCAATTAGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTGAAAAACTTTGGCGCACGTGTAAACGAGGTGCTCTACCTAACTGAGCTATAGCCCTTGTGTTTGTGATACACATTTTATCTTATCATGTAGATAATTTCTTGTCAAGATTAATATTACATGATCGAACATTATATCTCTTTGATCTCATTGTTTATTGGTATTGCTTAGAAATAATATTGGATTTATAATCCTATCGATGTGATAGGTATCCCCTTTCCTTCTCTTTACAATGATAAATAACCTACTTAACTCAGTGGTTAGAGTATTGCTTTCATACGGCAGGAGTCATTGGTTCAAATCCAATAGTAGGTATAACTTATTAGACACCATGATCAATGGTGTCTAATAAGTTTTTGTAACCAGCTTTTTTTATTTTATTGTTTTTATCGTCTTTCGATCCTATTTTTTTTATACATTCTTTTTTTTTACACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCGTATTGAGAGCCTCGACTCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTAGCCTCAATTGTCTGTCTCTTACCTTCAGCTTTTCTCAAGTTAGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGGATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTGATTTCATTATTGCCTATTCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATCGTTAACCATTGGTTAGCAAGGCGTATTTTCAAAATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGGTTTGCTAATACACCAATTTGTCCACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCGGGAAGAGAATCAAATTCTCCGGAAAGGATCAAATTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAGGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATTTTTCGTGCTCTTGCTACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCATCCAACCCCAGGATAGCTATAATGTCCTGAAGCTCCTTGTAACGTTGTAAAGTTTGTTTTACTTGTTGCGCAGTTTCATAATGTTCCTCGCCAACGATTCGAGGTTGTAGCATAGTTGACGTTGAATCTAAAGGATCTACCGCTGGATAGATACCTTTGGCAGCTAATCCTCTTGATAGTACGGTAGTCGCATCTAAATGTGCAAATGTGGTGGCAGGTGCGGGGTCAGTCAAATCATCTGCAGGTACATAAACTGCTTGAATAGAGGTTATGGACCCCTTTTTCGTAGAAGTAATTCTTTCTTGTAAAGTACCCATTTCGGTACTAAGGGTGGGTTGATAACCCACAGCAGAAGGCATTCTACCCAATAAGGCGGATACCTCGGATCCTGCTTGTACGAAACGGAAGATATTGTCGATAAATAGAAGTACGTCTTGCTCATTAACATCTCGGAAATATTCTGCCATAGTTAAGGCAGTCAGACCAACTCTCATACGAGCTCCTGGCGGTTCATTCATCTGACCATAAACTAGGGCCACTTTGGATTCCGCAAGATTTTGTTCATTAATGACTCCAGATTCTTTCATTTCCATGTAAAGATCATTTCCTTCACGAGTCCGTTCGCCTACTCCACCAAATACGGATACACCACCATGAGCTTTAGCAATGTTGTTGATCAATTCCATAATTAGTACTGTTTTACCCACGCCAGCCCCACCGAATAGTCCAATTTTTCCCCCACGACGATAAGGGGCCAAAAGATCTACTACTTTAATTCCTGTTTCAAAAATCGATAATTTTGTATCTAATTCTATAAAAGCAGGCGCGGATTTATGGATAGGAGATGTTGTGCGAGTATCGACAGGACCTAAATTATCAACGGGTTCCCCAAGCACGTTGAAAATTCGTCCTAGAGTCGCTCCGCCGACTGGAACACTTAGAGGATTTCCCATATCAACCACGTCCATTCCTCTCTTTAAACCCTCTGTCGCACTCATAGCTACAGCTCTAACTCGATTATTTCCTAATAATTGCTGTACTTCACAAGTCACATTAATTTCTTGACCAAGAGTATCTCGACCCTTAACCACCAGAGCATTGTAAATATTAGGCATTTTGCCCGGGGGGAAGGCTACATCCAGTACCGGACCAATGATTTGGGCGATACGTCCCAGGTTTTTTTTTTCACGTATCGAAACCTCTGGATTTGAAGTAGTAGGATTTGTTCTCATAATAAAAAAAATATGTTAAATTTTGTTACGAATTTTTTCGAATACAGAAAAAATCTTCGATAGCAAATTAATCGGTTAATTCAATAAAAAGTGGGAGTAAGCACTCGATTTCGTTGGTCCCACCCAAGCGGATGTGGAATTCAATTTTTTATTCATTCAATGAAGGAATAGTCATTTTCAAGCTCAACTAACTGAAACCTAGTTTTAAAATAAAAAATATATGAATAAAAAAATTTTTTGCGGAAAGTCTTTTATTTTTTTATCATAATAGGAATAGGCAAGCCTTTGTTTTATCTAGCGAATTCGAAACGGAACTTTAGTTATGATTCATTATTTCGATCTCATTAGCCTTTTTTTTCGTATTTTCATTTTAGCATATCCGGTTATGCGTCCCATTTATTCATCCCTTTAGCAACCCCCCCTTGTTTTTCATTTTCATGGATGAATTCCGCATATTGTCATATCTAGGATTTACATATACAACAGATATTACTGTCAAGAGTGATTTTATTAATATTTTAATTTTAATATTAAATATTTGGATTTATAAAAAGTCAAAGATTCAAAACTTGAAAAAGAAGTATTAGGTTGCGCTATACATATGAAAGAATATACAATAATGATGTATTTGGCGAATCAAATATCATGGTCTAATAAAGAATAATTCTGATTAGTTGATAATTTTGTGAAAGATTCCTGTGAAAAAGGTTAATTAAATCTATTCCTAATTTATGTCGAGTAGACCTTGTTGTTTTGTTTTATTGCAAGAATTCTAAATTCATGACTTGTAGGGAGGGACTTATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGGTTCAAAGCTGGTGTTAAAGAGTATAAATTGACTTACTATACTCCTGAATATGAAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCTGCGGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTTATTGCGTATGTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCGGTTACTAACATGTTTACCTCGATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCGAATCCCTCCTGCTTATACTAAAACTTTCCAAGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGGTTATCCGCGAAAAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAGAATGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCTATTTATAAATCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTATTTGAATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATCAAAAGAGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGTTTGTCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCACGCTGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTCTATCTGGTGGAGATCATATTCACGCGGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGAAGGAGACAGGGAGTCAACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTATGTTGAAAAAGATCGAAGCCGCGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCACTAC