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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_032208
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position C:37724-53894[-/-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CATCCCATCAAATAAGTGGAAGATTCATTAAACTGTGAAACGTTACCCTGCCATAATGTGATGTGTTTCCAATGCCAATAAAAAGTAACCCATCCAATAGAAATTATCAACGGGTTCCCCAAGCACGTTGAAAATTCGTCCTAGAGTCGCTCCGCCGACTGGAACACTTAGAGGATTTCCCATATCAACCACGTCCATTC
Tissues leaf
Exon boundary No-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CATCCCATCAAATAAGTGGAAGATTCATTAAACTGTGAAACGTTACCCTGCCATAATGTGATGTGTTTCCAATGCCAATAAAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAGAAAACTGCCAAATAAAATGCGTCCCAAGCCGAAATATCACAAGTACCACCTCGTCCCGGACCATCGCAAGGAAAACTATACCCGAAATCCTTTTTATCTGGCATTAACTTGGAACCACGTGCATCTAAAGCACCTTTTACTAAGATCAATGTAGTTGTATGTAAACCTAAAGCAATAGCATGATGAACCAAGAAATCTCCAGGACCTATTGTTAAGAATAATGAATTACTATTCTCATTAATAGCATTTAACCAGCCAGGCAACCATATGCTGCGACCCGCATTAAATGCTGGGCCACTTGTCGAAGATAAAAGTACATCAAATCCATATGAAGTTTTCCCATGAGCAGATTGTATCCATTGGGCAAATATAGGTTCGATCAAGATTTGTTTTTCGGGAGTACCAAAAGCAAGCATGACGTCGTTATGAACATAAAGTCCCAAAGTATGGAACCCTAGAAAGAGGCTGGCCCAACTTAAATGGGATATGATAGCTTCTTTATGGTCTAACATTCTTGCTAATACGTTATCCTCATTCTGTTCTGGATTGTAATCTCTAATAAAAAAGATAGCTCCATGAGCAAAAGCTCCTGTCATGATGAATCCTGCAATATATTGGTGATGGGTATATAACGCAGCTTGAGTCGTAAAATCTTGCGCTATGAACGCATAAGCAGGTAAAGAGTACATGTGTTGAGCTACCAAGGAAGTAATAACTCCTAAGGAGGCTAGAGCAAGGCCTAATTGAAAATGAATCGAATTATTGATTGTGTCATAAAGACCCTTATGCCCACGCCCCAATCGTCCTCCCGGAGGAATATGTGCTTCTAAAAGATCTTTTATACTGTGTCCGATTCCAAAGTTCGTTCTATACATATGACCCGCAATGAGGAAAAGAATTGCGATAGCTAAATGATGATGTGCCATATCGGTTAGCCATAAACTTTGCGTTTGTGGATGGAATCCCCCAAGAAGGGTTAGAATGGCAGTTCCGGATCCTTGGGAGGTACCAAATAAATGACTACTCGAGTCGGGGTTTTGAGCATAAAGATTCCACTGACCCGTAAAAAGTGGGCCTAACCCTTGGGGATGCGGTAATACATTTAAGAAATTATTCCATCGAACATATTCCCCCCTGGATGCAGGAATAGCGACATGGACTAAATGACCTGTCCAAGCCAATGAGCTTACCCCGAATAGTCCTGACAAATGATGATTCAGACGAGATTCAGCATTTTTGAACCACGAAACTCTTGGTTTCCATTTTGGTTGTAGGTGTAACCAACCCCCTATTAAGGATAGGGCAGAAAGAAATAATAGAAAAAGAGCTCCAGTATAAAGATCTTCATTAGTACGTAAACCGATTGTATACCACCACTGATAAACACCAGAATAAGCTATATTCACCGGGCCAAGAGCACCTCCTCGAGTAAACGCTTCCACAGCCGGTTGACCAAAATGAGGATCCCAAATAGCATGAGCAATCGGTCTTACATGTAAAGGGTCTTGTACCCATGTCTCAAAATTTCCTTGCCAAGCTACATGAAACAAATTTCCGGAAGTCCACAGAAAAATTATTGCTAATTGCCCGAAATGAGAAGCAAAAATATTCTGATAAAGACGTTCTTCAGTAATATCATCATGACTCTCGAAGTCATGTGCGGTAGCAATACCAAACCAAATACGACGAGTAGTGGGGTCCTGAGCTAAGCCTTGGCTAAACCTTGGAAATCTTAATGCCATAATGCCTTTCAAATCCTCCTAGCCATTATCCTACTGCAATAATTCTTGCTAAGAAGAACGCCCATGTTGTGGCAATTCCACCCAGAAGGTAATGGGTTACTCCTACAGCACGTCCTTGTATAATGCTCAAGGCTCTAGGCTGAGTAGCAGGAGCAACTTTTAATTTATTATGAGCCCAAACAATGGATTCAATAAGTTCTTGCCAATAACCACGCCCGCTGAATAGAAACATTAAACTGAAAGCCCATACAAAATGAGCACCTAGGAAAAAAAGACCATATGCAGATAACGAAGAACCATAAGACTGAATTACCTGAGATGCTTGTGCCCATAAGAAATCGCGGAGCCACCCATTAATAGTAATGGAACTCTGTGCAAAGTTTCCTCCAGTAATATGAGTTACCACCCCTTGATCACTTATACTACCCCAAACATCTGACTGCATTTTCCAACTGAAATGGAATATTACTACGGAAATAGCATTGTACATCCAGAATAGTCCTAAGAAGACATGATCCCAAGCAGATACTTGACATGTTCCTCCTCTTCCCGGCCCATCACAAGGGAAACGAAAACCAAGATTTGCTTTATCTGGTATTAAACGCGAGCTACGAGCAAATAGAACACCTTTCAACAGTATCAATACCGTCACATGAATTGTAAATGCATGAATATGATGTACCAAAAAATCTGCCGTTCCTAATGGAATAGGTAACAAAGCTACTTTGCCACCCACTGCTACTAACTCACCGCCCCCCCAAGTCAAACTGGTGCTCGCTGTTTCACCAGGGGCTGTTACACCAGGTGCTAAAGCATGGGTATTTTGTATCCATTGAGCAAAGACTGGTTGTAATTGTATAGCAGTATCTGAAAACATATCTTGTGGACGCCCTAAAGCACTCATGGTATCATTATGAATATACAAACCAAAACTGTGGAAGCCTAGAAATATACATACCCAGTTGAGATGTGATATGATTGCATCGCGATGCCTCAGGACACGATCTAATAAATCGTTATATCGATTAGTTGGATCATAGTCTCTTACCATAAAAATGGCTGCATGCGCAGCAGCACCAACTATGAGAAATCCACCAATCCACATGTGATGTGTGAACAATGACAGTTGTGTAGCATAGTCAGTAGCTAGATATGGATAAGGGGGCATGGAATACATATGGTGAGCTACAATAATGGTTAAAGAGCCTAACATAGCTAGGTTAAGAGATAATTGAGCATGCCATGATGTTGTTAGAATTTCATATAGGCCTTTATGGCCTTGGCCTGTAAATGGACCTTTATGAGCCTCTAAAATATCTTTTATACCATGACCAATACCCCAGTTGGTCCTATACATATGACCCGCGATTAGAAAAAGAATTGCGATAGCTAAATGATGATGTGCTATATCGGTTAACCATAGACCCCCAGTCACTGGATCTAATCCGCCACGAAAAGTAAGAAATTCCGAGTATTTTGACCAATTTAAGGTAAAAAAGGGAGTTGCTCCTTCAGCAAAACTTGGATAAAGTTGAGCCAAAAGATCCCGATTCAAGATAAATTCATGAGGAAGCGGTATTTCTTTAGGATCTACTCCAGCGTTTAGAAATTGGTTAATCGGTAAAGATACATGTACTTGATGTCCTGCCCAAGAAAGGGACCCAAGTCCTAGTAGCCCTGCTAAATGGTGATTCAACATAGATTCTACATCTTGGAACCAAGCCAATTTTGGAGCTGCTTTGTGATAATGGAACCAACCAGCAAAAAGCATTAAGGCTGCGAAGACCAATGCGCCAATTGCGGTACAATAAAGTTGTAATTCACTAGTTATTCCGGATGCTCGCCAAATCTGAAAAAAGCCTGAGGTTATTTGTATTCCTCGGAAGCCTCCGCCCACATCTCCATTCAGGATTTCTTGGCCCACTATTGGCCAAACCACCTGAGCACTAGGTCCAATGTGAGTAGGATCACTCAGCCATGCTTCATAATTGGAAAAACGAGCACCATGGAAATACATGCCACTCAGCCAAAGAAAGATGATAGAGAGTTGGCCGAAATGGGCACTAAATACTTTTCGAGAGATTTCCTCCAAATCACTGGTATGACTATCAAAATCGTGAGCATCAGCATGTAGGTTCCAGATCCAAGTGGTAGTATCAGGTCCCTTAGCTATTGTTCTTGAGAAATGACCGGGTTTAGCCCATTCCTCGAAAGAAGTTTTTATGGGATCCCTATCTACCAAAATTTTGACTTCTGGTTCCGGCGAACGAATAATCATTGAGTCCTCCTCTTTCCGGACAACACATACAAAGAAACCCGCCAACAGTCACTCAAGTAATTAGTGAACCGATGATAGATACTTAGAATTTTTTTTTCTTTCTCTTCTATCTTCCATCTATTCATCTATTTTCTTTAGTTATTCACTAGAGCAATTATGATCTGGAAGTCGATCTGGGGCAAGTGTTCGGATCTATTATGACATATCCATAGGGTGCTCAACGGACCCTTTTTTATAATTAAAAAAAGTTTTAGCGCCTTTACATTGGTACACAAAGAGCTTTTTTTATAACCTAATCGAGTGTATTCATATTTCAATTATTAAGTTCCGAAATGTAGCCTATTTTTTTTATAGATAATATTATCCTATTTCAATAAATGCTTATTAGTCATTACTAAGAAAAAGTCTAGTATTGATATTTAGTCATTTTGAAATATCTTTTATTGGTTTTAGTTTTAATAGTAGAAAATAACAAATAGAAAAAACTAAATATATAGATATTCTCATATTCATGTACTACTTACCCCTAGAGACTACCAGATAAAATAGAACGATTTGAGAAAAGGATATAATGAAATTTTTGTCTTTTATTGGTTCTTCTAATAGAAACAAGGATCTGTTTTATTTGACCGAGAGGACCAAGAAACCAAAAAACAATTAATTATAAAAACAAATAGCAAATATTATAGAATAGAATAAAAAAAAAAAGAAACAAAGGGAAAGTTCTTATTCGAAGCGCCTCGTGATCGTCAACCAATTCTGTGCTTCAATATAATTACCAGGAGTAAGCGTTATAGCCTGTTTCCAATACTCAGCGGCTTGAGCGAACCAAGCCTCCGCCATTTCAGAATCTCCTTGTTGAATGG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