Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR980
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr8:105566579-105566688 [-]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029588
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - ACUGGACUAAGAUCCGAAGGCAUU - 24
Stem-loop(if miRNA) --      - UG   G     U   A  G AAA   AA   AA      UAUG    G
  UGCCUU G  UCU AGUCC AGU AU G   CGA  UAA  AUGUGU    AUUU U
  |||||| |  ||| ||||| ||| || |   |||  |||  ||||||    ||||
  ACGGAA C  AGA UCAGG UCA UA U   GCU  AUU  UACGCG    UAGA G
UU      G CU   A     -   A  G -AG   -C   AG      --UA    G
Stem-loop sequence UGCCUUGUGUCUGAGUCCUAGUAAUGGAAACGAAAUAAAAAUGUGUUAUGAUUUGUGGAGAUAUGCGCAUGAUUACUCGGAUGAUAACUGGACUAAGAUCCGAAGGCAUU