Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR874
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr5:49636738-49636942 [-]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029588
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 182 - ACAUGACUGGAGACAUGGCCGUGU - 205
Stem-loop(if miRNA) --        -  AG     G      G  -UCAA      GGAGG         A U   C AG     ACC UG         CCUUA    GU GC      - - G
  ACAUGACU GG  ACAUG CCGUGU CC     CCGUGU     ACACGGCCU G ACA G  CGUGU   U  GUCGUGUGC     AAGG  U  UGAUGU C A A
  |||||||| ||  ||||| |||||| ||     ||||||     ||||||||| | ||| |  |||||   |  |||||||||     ||||  |  |||||| | |
  UGUGCUGA CC  UGUAC GGUACA GG     GGCACA     UGUGCCGGA C UGU C  GCACA   A  CGGCACAUG     UUUC  G  ACUGUA G U A
AG        A  -G     G      -  UACUG      GGGGG         A -   A GA     --A GU         -----    UG -A      A A A
Stem-loop sequence ACAUGACUGGAGACAUGGCCGUGUGCCUCAACCGUGUGGAGGACACGGCCUAGUACACGAGCGUGUACCUUGGUCGUGUGCCCUUAAAGGGUUGCUGAUGUCAGAAAUAGAAUGUCAAGGUCUUUGUACACGGCUGAAACACGAGCAUGUCAAGGCCGUGUGGGGGACACGGGUCAUGGACAUGGGCAUGUGCCAAGUCGUGUGA