ncRNA ID | novel_gar_miR873 |
Species | Gossypium arboreum |
Class | miRNA |
Genome position | Chr5:51635989-51636098 [-] |
Reference genome | Gossypium_arboreum_v1.0 |
Source | SRR1029588 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - ACUGGACUAAGAUCCGAAGGCAUU - 24 |
Stem-loop(if miRNA) |
--      - UG   G   U     A  G AAA    A   AG   UG -    AUU   UGCCUU G  UCU AGU CUAGU AU A   CGAA UAA  AUG  U UAUG   U   |||||| |  ||| ||| ||||| || |   |||| |||  |||  | ||||   G   ACGGAA C  AGA UCA GGUCA UA U   GCUU AUU  UAC  G AUAC   U UU      G CU   A   -     A  G -AG    -   AG   GU U    AGG |
Stem-loop sequence | UGCCUUGUGUCUGAGUUCUAGUAAUGAAAACGAAAUAAAGAUGUGUUAUGAUUUGUGGACAUAUGUGCAUGAUUAUUCGGAUGAUAACUGGACUAAGAUCCGAAGGCAUU |