Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR873
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr5:51635989-51636098 [-]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029588
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - ACUGGACUAAGAUCCGAAGGCAUU - 24
Stem-loop(if miRNA) --      - UG   G   U     A  G AAA    A   AG   UG -    AUU
  UGCCUU G  UCU AGU CUAGU AU A   CGAA UAA  AUG  U UAUG   U
  |||||| |  ||| ||| ||||| || |   |||| |||  |||  | ||||   G
  ACGGAA C  AGA UCA GGUCA UA U   GCUU AUU  UAC  G AUAC   U
UU      G CU   A   -     A  G -AG    -   AG   GU U    AGG
Stem-loop sequence UGCCUUGUGUCUGAGUUCUAGUAAUGAAAACGAAAUAAAGAUGUGUUAUGAUUUGUGGACAUAUGUGCAUGAUUAUUCGGAUGAUAACUGGACUAAGAUCCGAAGGCAUU