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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_030527
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position C:446-12087[-/-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method CIRI
Type exonic
Splice junction sequence TTCATGCATAACTTCCATACCAAGGTTAGCACGGTTAATAATATCAGCCCAAGTATTAATAACACGTCCTTGACTATCAACTACTGATTGGTTGAAATTGCTTCCCGAACCAAACATGAATCTTTCGATTCATTTGGCTCTCATGCTCACTTATTCCAATCAATTATTTATGAGACTTCCCTTCCCATCTTTTTCATGCA
Tissues NA
Exon boundary No-No
Splicing signals CG-AT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TTCATGCATAACTTCCATACCAAGGTTAGCACGGTTAATAATATCAGCCCAAGTATTAATAACACGTCCTTGACTATCAACTACTGATTGGTTGAAATTGAAACCATTTAGGTTGAAAGCCATAGTACTAATACCTAAAGCAGTAAACCAAATACCTACTACCGGCCAAGCCGCTAAGAAGAAATGTAAAGAACGAGAATTGTTGAAACTAGCATATTGGAAAATCAATCGGCCAAAATAACCGTGAGCAGCTACAATGTTGTAAGTTTCTTCTTCTTGCCCGAATCTGTAACCTTCATTAGCAGATTCATTTTCTGTGGTTTCCCTGATCAAACTAGAAGTTACCAAGGAACCATGCATAGCACTAAAAAGGGAGCCGCCGAATACACCAGCTACACCTAACATGTGAAATGGGTGCATAAGAATGTTGTGCTCAGCCTGGAATACAATCATAAAGTTGAAAGTACCAGAGATTCCTAGAGGCATACCATCAGAAAAACTTCCCTGACCAATTGGATAGATCAAGAAAACAGCAGTCGCAGCTGCAACAGGAGCTGAATATGCAACAGCAATCCAAGGACGCATACCCAGACGGAAACTAAGTTCCCACTCACGACCCATATAACAAGCTACACCAAGTAAAAAGTGTAGAACAATTAGTTCATAAGGACCGCCGTTGTATAGCCATTCATCAACGGATGCAGCTTCCCAGATTGGGTAAAAATGCAATCCAATAGCTGCAGAAGTAGGAATAATGGCACCGGAAATAATATTGTTTCCGTAAAGAAGAGATCCAGAAACAGGTTCACGAATACCATCAATATCTACTGGAGGAGCAGCAATGAATGCGATAATAAAAACAGAAGTTGCGGTCAATAAGGTAGGGATCATCAAAACACCAAACCATCCAATGTAAAGACGGTTTTCAGTGCTAGTTATCCAGTTACAGAAGCGACCCCATAGGCTTTCGCTTTCGCGTCTCTCTAAAATTGCAGTCATGGTAAAATCCTTGGTTTATTTAATAATCAGGGACTCCCAAGCGCACAAATTCTCTAAGTAGATAATTGAGAGCTTGTTATGAAACAGTATAACATGACTTATATAGCCATGTCAACCAATGTAAAATGGATAAGATCCTTTTAGTTTAGATTCATAAAAAATTTTTTGTAATCGATGAAATAAATTAGAAGCGAATCCACATACATAGAAATAGAATTGCTCTAGGAATATTTTTTCCAAATCATATGAATACGATTGAATACGATCCGTAGTGGGTTGCCCGGGACTCGAACCCGGAACTAGTCGGATGGAGTAGATAATCTCCTTGTTAAAATGAAAAAAAAAAGGTAAAAAACCCCTCCCCAAACCGTGCTTGCATTTTTCATTGCACACAGCTTTCTCTATGTATACATAGAAAACTCAATTTCTTTGGTTCCTTATAAATAGGACTCCAAATTCAATACTCAGTAAATTTAATCGTAGTCTTACTGTATGAACATTTAATAATAGAAATAAAGCACTTTTGATAATAAAAAATAATTGATTTTTTTTGTTATCTCTGCATAAATTTTAATAAATTTCGATTTCATTTATGGGGTCTCAGAACCCAATTATTCATGATTGACCAAATCATTAAGATAAAGAATATCCAAATACCAAATTCGCACTCGATATAATCTTTTAGAAGCATAATAACTTCTTGGGAAGATTAAAGAAAGAACTTGGTCTTCCCCCGTAAGGAATTCTTCCAATAAACCAGAGCCCAACCTTTTTAAAAAAGTGCGTACAGTACTTTTGTGTTTACGAGCCAAAGTTTTAACACAACAAAGACGAAGTATATATTTTATTCGATACAAATTCTTTTTTTTTGAAGATCCGCTGTAATAATGAGAAATATTTCTGCATATCCGCACAAATCGGTTGAGAATATCAGAATCTGATGAATCCGTCCAGGTTGCTTTACTAATGGGATGCCCTAATACATTACAAAATTTATCTTTAGCCAACGATCCAATAATAGAAGAAATTGGAATTTTGCTATCCAATTTGATTCTAACATTATCTATTAGAAATGAGTTTTCTAGCATTTGACTACGTACCACTAAAGGGTTTAATCGCAAACTTGACAGATAACCCAGAAACTCTAAATTATCTTTAGATAATTGATTTATATTGACCTTTTGCGATTGAAACCATACCGAAAAATAACATTGCCATAAATTAACAAAATAATATTTCCATTTATTCATCAGAAGCGGCGTATCCTTTGTTGCCAGAATGCATCTTCCGTGATATCTAACATAATGTATGAAAGGATCCTTGAGCAACCCTAGGATTGCCGGAAAATTATTAACAAAAACTTTGAAAAAATGGTGTATTTTTCCATAGAATACAATTCGCTCAAAAAGGACTTCATAAGATGTCGATCGTAAATGCGAAGACCGCTTGCGTAGAAAAAAAAAGATGGATTCGTATTCACATACATGAGAATTATATAAGAACAAGAAAAATCTTGGATTCAAAATTGATTTTTTTTTAATATAAAAATTCTTCCAATTACAATACTCGTATAAACAGAACCGAAAAAAATGCAAAGAAGAGGCATCTTTTACCCGGTAACGTAGGGTTTGAACCAAGATTTCTAGATGGATGGGGTAAGGTATTAGTACATCTAACACATAATTAAAATGTCCTAATTTGTCTTCTAAAAAGGGAAATATTGAATGAATTGATTGTAAATTATAAGATTTTTTTAATTGTTTTCCTTGAAAAGAGGATCCTAATCTTAGGGAAAATGGAATTTCGACAATCACTGCAAATAAAACAGATATCATTTGATAATAGAAAAGACTGGTATGCCCCAAAAAGGAATTTTGGTTCACATCCTTAGTGGGAATAATCAAACGATTCTGTTCATACATTCGCAAAATTAAGCGTTTCGTAATTAGTGAACTATATTTTTTGTCATAATCCGCATTTTCCAAGAAAATATAGCGATTTCTATTTAATCTATTTAAACCATGATCATAAGCAAGTACATAAATATACTCCCGAAAAAAAAGTGGATATAGAAAACTCTGTTGCCGAGCCCCATCGAACTCTAAATATCCTTGAAATTTATCCATTTGGATTGAAATTCGATTTGAACTGAAGGTAAAGTCTTTATTTTCTTGAGTTCTGAAATGACACATAGTGCGATACAGTCAAAATAAGGTATTAGACTACGAAAGCTATAGATATAGATACCTCATAAACAGGTAGACTGCTAACCGGATTCTCTATCTTTAATAGGTTTCTGTTCGTTATATTATAGAATAACAAAACAAGATTATTAGAAATCCTTTATTTTTTTAACCTAATCGCTCTTTTGATTTTGGAAATATATATATTTTTTATCAATATACTGCTTCTTTTACACACTCCAACCTAATCCAAATGGACTAGTTAAAACAATAATTAGGACTCATGAAAAAATTGATAATAACACGCAAGAAAAAAATGCCTTCCCATACCCGTATTAGGCACTAATCTATTTTTAACATTTAATTAGTTGGGGTAATTTTTCAAATTACGAATGGAAGCTCGTTTCTTTTTTTTTCCTGGAATAAGGAAAACTGGTTTTTTTATCCATCCATTTATATTTATTCACTTGACCCAAATTGGAATTCTTTTTTTTTTTTCGACATCAAAATAAGATTGTACCGATCAGGAAAGCAAAAAAAAATGTTATCTGAATTCTCCCTTGATACGACATGCTATTTTTTCCATTCATTCCTTTCAGGATCAGTCGTGGTCTTACAAACTCTACCGCAGATCTGGACGAATCCTTTTCTTCATACAAATGTGTAAAAGATGCTAGTCGCACTTAAAAGCCGAGTACTCTACCGTTGAGTTAGCAACCCCCCCCAAAAAAAAAAGAACGTACTGCAAATATGTAGATACAATCAGAATAAAGAAAAAAATACAGTCGTGTGTGCGTCAGGGATAAATAGATCCATTTATCTATGAGAGAATTATATTTGGTCCATACACTGTTGTCAATATGATTATGAATTTTTCATATAGTCAAAAGAATAGAAAAAATAAATAAATAAAAAAGCTTAACCTCTTGGTTCATTAGTTCATACAATGAATGAAAACTAAGCCAGTTCCAGTTAAGGTAATCTCAAATCTTTTTATACTTTTTAGATCCATTTTTTTTATGGCCTTTAATTTTTTATTTTTTTATGATGAAGAAATTATTCATAATAATATAATATTATTATAATATAATAATATATATATATTTTTTTTTATTCAGAATTATATATTATATTTATATACAGTATTATTCTTTTCTATATAACAATAACAGTAAAATTTTGTATTTATAAAAAAATTCGAATTTATATACTCTAGATCCAAAAAATTTTTCATAAATTTGTGTATGATTATAAAACATAGTAGTTGTTAGCAAGGTATTTTTTAGTATTCGTACCTTAGGAGGAATACTAATAATAAATAGAAATTATAATAAATCAAAATAAATATGATGGAAGTGAAAGAGAAGAGTAGATAAAATTTTATATCACGTTATATACGAGTCTTTCACATCCTCTTTTTTATATTTCATTAATTTCATTTCGTTTTAGTAAGACTTCATTCCGTAAAAATCCCAGCCTTCTTTGAAATATCATGAGCTGTTCTTGTTGGTTGAGCTCCTTTTTTAAGAAAATCGAGAATAGCAGAAAGGTTTAAAAAAGTTTGATTAGTTATGGGATCATAAAAACCCACCTTACTAAGATCTCTTCCTTCTCTTCGGTATCGAACATCAATTGCAAGGATTCGATAAACGGCTCGTTGGGATAGATGTATATGAATAATACCCCCCCTAGAAACGTATAAGAGGTTTTGGCCTCGTACGGCTCGAGAAAAAAAATTCAAATAGTAAATTCAAATATTAAATAGAGAAATAAAAACATTAAATCAATTAGCCAGTATTAAAACCCTAAATATTTTTT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