Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_030236
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:26654064-26654925[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence ACCGATACGAGATCCTCTTATACGATAGTGGATCACACTTATGATGCGGTTGTGGTGGGAGCTGGTGGTGCTGGTCTTAGGGCGGCGATTGGGTTATCGGGGTCATGCTCTGTTGCATACTCTCTATGGACAAGCTATGAAGCATAACACACAGTTCTTTGTTGAATACTTCGCCTTGGATCTGCTCATGGCTAGTGATG
Tissues inflorescences
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence ACCGATACGAGATCCTCTTATACGATAGTGGATCACACTTATGATGCGGTTGTGGTGGGAGCTGGTGGTGCTGGTCTTAGGGCGGCGATTGGGTTATCGGAGCATGGCTTTAACACCGCTTGCATTACTAAGCTTTTCCCCACAAGGTCACATACTGTTGCTGCTCAGGTATTTTTCGTTACTAATCTCCTTATACTGTCGATTTTTAAATATAGTTTTGTTTCTTTTTGATTGAGATTATGTTGTCGAAAAAACTGTCAAGGGTGGTATTAATGCTGCACTGGGAAATATGTCCGAAGATGACTGGAGATGGCACATGTATGACACTGTCAAAGGAAGTGACTGGCTAGGTAATCTTAGTCTTCCTTTTGTTTCTTCTCTTTTTTTAGTGAAATGTTTTTTTTTGCTTTTTGTAGCTCTTATGTGATGTGGTTTAGTGAATTGATTAGTGAGTTCTTTCTTGTTTATTTCTTTGTGTAGGTGATCAAGATGCTATCCAGTACATGTGTAGAGAGGCACCAAAAGCAGTCATTGAACTTGAGAATTATGGGCTGCCTTTCTCTCGTACTGAAGAAGGGAAAATTTACCAGCGTGCATTTGGTGGTCAGAGTCTTGACTTTGGAAAAGGTGAGTTGTCTGATGTCTTGCTATTATTGATATTCCTATTTACTTTGTTTTTTAATAGGTCTCTCATATTGGCTTTCCTATTTTTCTGCTTCAGGTGGTCAGGCCTATCGTTGTGCTTGTGCTGCGGATAGGACTGGTCATGCTCTGTTGCATACTCTCTATGGACAAGCTATGAAGCATAACACACAGTTCTTTGTTGAATACTTCGCCTTGGATCTGCTCATGGCTAGTGATG