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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_030223
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:26591937-26595530[+/+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence GACAGTTAACGAGATGGTGACAAACTCCAGCCTCCAGGAAACCCTGAAAGAGATTCTTCGCCAGAGGTAAAGACGATCCCAGATTCAAAGTTTTGAATTTGAGTCTCAGACATACGCCACTGCTGATACTACTGCAGATGCAGCATCAGCTTCTTCTTCTTCTTCCCGCACTCCTCCAGCTGCTAGTGCCTCAAAGAAAG
Tissues leaf/whole_plant
Exon boundary No-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GACAGTTAACGAGATGGTGACAAACTCCAGCCTCCAGGAAACCCTGAAAGAGATTCTTCGCCAGAGGTAAAGACGATCCCAGATTCAAAGTTTTGAATTTGCCATACAAGACACGTCGACACATACATACATACCATATACACATATATATATATATATATATATATATATAGATTCAGAACAATGTTTTCAAGCTATCACCAAGTACCCTTTTTTTCTTGTCCGGCGTTTCCTTCTTTGGTGTGTTTTTGATTTTGGGAATGCTGCTTCTTTGTTTTTGTTGTGTGTAAACCCTTTTTCATCTTAATCCCGTAAAGTTGGAAACCTTTGGAGGATTCTGCGTTCAGCAAATGTATCTTCGTTCGGATTAAACTCCTTAGTGAAACTATTTCTTGCGTTGCTAATTATTCGTTACAGGTCCGTTATAAATCATTCCCCAGGGAAATAGTTTTATGCATTTTTGTTCAACATTTTAGAGACCACCATGAACTACATATTAAATTACTCTAATAAAATGATATATCCTGTTGCAAAATCATTTATTATCTGGGTGTTAATTATTTTTGTTTCCCTTTTTACGCAATTGCCAAGGCAAGAACGAAGGTATTTTCTACAAGTAAAGTAGTAAACAAATACAGGCCCCACGGAGAGGCAGTGGTACGTACGTACGTTGTTCTTTTTTGTTTTACACGCGTTTTACTATCGACAATCAGTTGACCATTTCGGTTCTAGTTTCTCTCTCGCTCAATTTGTGAGAGCTCTTGAAGAAGGAAAAACAATACCATGCCGATCTCGGATGTCGCTTCTTTGGTTGGAGGTGCTGCTTTGGGAGCTCCACTTTCTGAGATATTTAAACTGGTAATTGAAGAGGCCAAGAAAGTGAAGGACTTTAAACCATTATCCCAGGATCTCGCTTCGACGATGGAGAGATTGGTTCCGATTTTCAACGAGATCGACATGATGCAACAAGGATCGAACCGAGGTACGAGTGAGCTAAAGGTTCTGACCGAAACGATGGAACGAGCTGGGGAAATGGTTCATAAGTGTTCACGCATCCAGTGGTACAGTATCGCCAAGAAAGCTTTATATACCAGAGAAATAAAAGCAATCAATCAGGATTTTCTCAAGTTCTGTCAGATTGAGTTACAGCTTATTCAGCATAGGAACCAGTTGCAATATATGCGTTCCATGGGCATGGCAAGCGTGAGTACGAAAGCCGACCTACTGAGTGATATTGGGAATGAATTTTCCAAGCTTTGTCTAGTGGCTCAGCCCGAAGTAGTTACTAAATTTTGGTTGAAGAGGCCATTAATGGAGTTAAAGAAGATGCTTTTTGAAGACGGAGTGGTTACCGTCGTGGTCTCTGCTCCTTATGCCCTCGGGAAGACCACGTTGGTTACAAAGCTTTGCCATGATGCAGATGTTAAGGGTATTACCGTATACCCAAAATCTTGGTTTCCCCTTTTTTTATTGGAATAAGAGCATGTTTCTCATGTCGTCTACTTTTGGCAGAAAAATTCAAGCAGATCTTCTTTATCTCTGTGTCAAAATTCCCTAACGTGAGGCTCATCGGACACAAGTTACTCGAGCACATTGGTTGTAAAGCAAATGAATATGAGAATGACTTAGATGCAATGCTCTACATTCAACAACTGCTGAAGCAACTTGGACGAAATGGGTCTATATTGTTGGTTTTAGATGATGTTTGGGCTGAGGAAGAGTCCTTGCTACAAAAGTTTCTGATTCAGCTACCTGATTACAAGATTTTGGTGACTTCTCGGTTTGAGTTCACAAGTTTTGGTCCCACTTTTCATTTGAAACCCTTGATAGATGACGAGGTCGAATGCAGAGATGAGATAGAAGAAAATGAAAAGCTTCCAGAGGTGAATCCTCCTCTTAGGTAAGCTTATGCGTCTATTGCTAATTTTCTTGCATTCTTTATCTCAATTCTTAAGTATGCCCACACTTGGTTAAAGTATCTTTTGACTTGTAGCATGTGTGGTGGTTGCAACTCTGCGGTTAAACATGAAGAATCTGTGAATATTTTGGGTGTTCTTTGGCATCCTGGATGCTTCTGCTGTCGTTCTTGTGACAAACCAATTGCTATTCATGAGCTCGAGAACCATGTACGGAAATGTTCTTCTTTTGACAATTGTTTGGTATATTAATTTACTCCTTGACATGTTATTTTTTTTTTGTTTGATCCAAAACCTAAATTCTTGATAACTCTCTTAGGTTTCAAACTCAAGAGGCAAGTTTCACAAATCCTGCTATGAACGGTACTGCTATGTCTGCAAAGAGAAGAAGGTATACCATTTTAGGATTCTCAGTAGTAAGTTGTCACGGTGTCGATGAATGTAACTGTAACTGTATTCTTTCAGATGAAAACGTACAATATTCATCCGTTTTGGGAGGAAAGATACTGCCCTGTTCATGAAGCTGATGGAACTCCCAAATGCTGCAGTTGCGAAAGGTTAGAGGTGAGTTTACCTTTCAAACAACAAAACACGGGAAAGGGGAATGATATGAGATGAATAATCAGCCACCATATCGTTAAAACTTAAAAGAAGGAAACTAGCTAGATAATCCCACTGGTTTGAGTTCTTATGATCTTGGCTAATTTTCTTTGCAGCCTAGGGGAACAAAGTATGGAAAGCTTAGTGATGGTCGATGGCTATGCCTAGAATGTGGGAAATCCGCTATGGATTCTGATGAATGCCAGCCTTTGTACTTTGACATGCGTGATTTCTTCGAAAGCTTAAACATGAAGATTGAGAAAGAATTTCCTTTAATTTTGGTGCGGAAAGAACTGCTCAATAAAAAGGAAGAGAAAATTGTGTGTACAGTTCCAAGCTAAAACTTCCATATATATATATCTCTCTCTCTCTCCACTAATCGTTTCGTAAGTGTTTTACACAAGCAGGACAATCATTATGAGGTGTTAATCAGAGCTTATTGCATGTCTGAACAGAAGATCATGACATATGTAAGAAGCTATATTTTACCCCCTTAAGATTCTAATACTAGATTGGAATGCATGACTTCAACACTGGTCCACATATACAGGTCTCAGAGGAGCCAAGGACGGGTCAGAACAAGCAGCTTATAGACATGGATACGGAACCTCAAGGGGTTGTTCATGAGTGCAAGGTCACTGCAATTCTCATCCTATATGGACTTCCTAGGTAATGTAACATCTCCTTCCAACTCATCTCCCCCTTCTAAGTACTCTCCTGCGCCGATAGACTAAATAAAATCTGAGTTCAAACACAGATTGCTAACAGGATATATCTTGGCTCACGAGATGATGCATGCTTGGCTTAGACTCAATGGTACGTAATTGGTCAAATATCCAACATTTGTAACGATGATGATCATGACCAAGAAACGTGAGGGAGAGGTCTCTAAGCGTTTTTGGTTTGATTACAGGACATATGAACCTGAACAACATTTTGGAAGAAGGAATATGCCAAGTGCTAGGTCACCTGTGGTTGGAGTCTCAGACATACGCCACTGCTGATACTACTGCAGATGCAGCATCAGCTTCTTCTTCTTCTTCCCGCACTCCTCCAGCTGCTAGTGCCTCAAAGAAAG