Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR788
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr4:136910621-136910748 [-]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029588
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 105 - AGACAGAGGUUCGGCAUGGCUCUA - 128
Stem-loop(if miRNA) --A   A      -  -  A   C   AAU     AGCUC     -  UCG   UA   -A    CG
   GAC GAGGUU CG GC UGG UCU   UGGAU     GUAUG GU   UUG  UGC  GUCU  G
   ||| |||||| || || ||| |||   |||||     ||||| ||   |||  |||  ||||  U
   CUG CUCCGA GC CG ACU AGA   GUCUA     CAUGC CG   AAC  AUG  CAGA  U
AUA   G      A  A  -   -   AGC     -CUAU     U  UUA   UC   GA    UC
Stem-loop sequence AGACAGAGGUUCGGCAUGGCUCUAAUUGGAUAGCUCGUAUGGUUCGUUGUAUGCAGUCUCGGUUCUAGACAGGUACUCAAAUUGCUCGUACUAUCAUCUGCGAAGAUCAGCACGAAGCCUCGGUCAUA