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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_029756
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:25182042-25184894[+/+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method SMALT and Segemehl/find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence GGTTCCAGGTTTGTCACTCGTTGGGAGGAGGAACTGGATCTGGTATGGGAACATTGTTGATCTCTAAGATCCGTGAAGAGTACCCAGATCGCATGATGCTAACAACTGGGCCAAGGGACACTACACTGAAGGAGCTGAACTAATCGATTCCGTTCTCGATGTTGTTCGTAAGGAAGCTGAGAACTGTGACTGCCTCCAAG
Tissues siliques and seeds/leaf/root, leaf, aerial, inflorescences, seed
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GGTTCCAGGTTTGTCACTCGTTGGGAGGAGGAACTGGATCTGGTATGGGAACATTGTTGATCTCTAAGATCCGTGAAGAGTACCCAGATCGCATGATGCTTACCTTCTCGGTGTTCCCTTCACCAAAGGTTTCTGATACTGTGGTTGAGCCTTACAACGCTACTCTGTCTGTCCATCAGCTTGTTGAGAATGCTGATGAGTGCATGGTTCTTGATAATGAGGCCTTGTACGATATTTGCTTCAGGACTCTCAAACTCACTACCCCCAGCTGTAAGATTTCATTTCCCAATTATGCTCTCCACCAATGTTAAGATGAGTTAAACTATGCTTGAAATGCTTGGTCTACATGGTGTTTATGTTAATAATTGGTATCAAGTTCAGATCTGCAAGCATCTATGTAAAGCTTATAGTATTGTTACTGTTTCCATTGGTTTGCTCTTTGACTATGTCACTGTTTTATATCAGAATTCTGATTTGCAAGTCTCTGTGCAGAACTTATACTTTTGTTACTGTTTCCAGTCGTTTTGTACATATCTTTAGCCTCTTGTTTTGTGTGATATTGCTTCTGTTTACCTATTTTGATCTCATCACCGAAGTAGGTCCTTAAACTACTCTTATTGGAACAATACTTTCTGGTTAAGTTGCAAGTAGAAATCTGATACTTGATGATCATCAGTTTGTTGAGTTTACTGTCTGCTTTGATTCTTTTCTCATCGTACTGTTTGGATATGTCTAAAGCTTACACATACTTGGATTTTCTTCTGTGTGCAGTTGGTGATTTGAACCACTTGATTTCTGCTACTATGTCTGGTGTGACTTGCTGTCTGAGGTTCCCTGGTCAACTCAACTCTGACCTCCGAAAGCTTGCTGTGAATCTCATCCCATTCCCCCGTCTTCACTTCTTCATGGTGGGTTTTGCTCCTCTCACCTCAAGAGGTTCTCAGCAGTACCGTTCCCTCACAGTCCCTGAGCTCACCCAGCAAATGTGGGACTCCAAGAACATGATGTGTGCTGCAGACCCAAGGCACGGACGCTACCTCACAGCCTCTGCCATGTTCCGTGGCAAGATGAGCACAAAGGAAGTTGACGAGCAGATGCTGAATGTGCAGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTGGAGTGGATCCCCAACAACGTGAAATCGACAGTCTGTGACATCCCACCTACTGGTCTGAAGATGGCATCAACTTTCATTGGAAACTCAACATCAATCCAAGAGATGTTCAGGCGAGTGAGTGAGCAGTTCACAGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACAGGTGAGGGAATGGACGAGATGGAATTCACAGAAGCGGAGAGCAACATGAACGATCTTGTGTCAGAGTACCAGCAATACCAAGATGCAACTGCGGATGAAGAAGGTGACTACGAGGATGAGGAAGAAGGTGAATATCAACAGGAGGAAGAGTACTGAGAATAATTTAGTTATAACTGCTTTAAAAACAAAAACAATTTAGTCGTTTGCTACTTTTCTTTTTTTTAAAAGGAACACCTCAACTACCAGTTGTAGTTTTTTTCTCTGCTTGTATTTGACATATCTGGTTGATGTTTCTGTACTTTTGTTCTTAATCTTGTTATTGCCTGTGATGTTTCTATTAATATTTTCCAGTTGTACTGTCTTCAATCTTTGGTCTTCTATCCTCATCTTTCTGCTACCTGACTACCTCAGTACCTACTTAAGGACTTTAGGTTTGATCTGTTTGGAAAATAGATTAAGGTTCGGGATTTGTGACCTCAGGGCAAGTGCAGCTCCATATTAGACCCCAAAACAAATTTATCACTGTTCTGAAATACAAATTCCCCAACATGCCTAGCTTTGAGGATTGATTGTTTCTAAGCTATTTATTTTCTTTACCAATTCACATAAATACTTTAGGATAAAGTGGAAATTGTCAATATTCAAACACGTTCTCTTCCCTTTGTTAACAAGCAAAATATGAAAATAACATGTGCTCTTCCATTATTTCATTTTTTGCAACCCTTATGAATGGGCCCAAAGCCTGCCACAAACATGTGCACAATATTAGAAAAGAAACTCTAAAAACAAAAACAAAATGAACATTCTTTTTTTTGCAATTTGTATTATAATATCAAAATAATATTTTAAAACTCAATTTAATATTGGAAAATAAAATAAAATTTGGAAACTAAACAGTTACCATAGAGAAAGAAACGGACCATTTTTAAATTTTGAATTTCGAGAAAAACAAAATCGGCGCCTCTTATTAGAGATAATTGGGGGAAAAAAACAAAAAACAAACACAGAGAGAGCAATAATAAAAACTCACTCACTCTCACTTTTTTCATTTCTTCAACAAAAAAAACCTAAAGCTCTCTTTTCTCTCCAGATTTCGATTCCCGAGGCTCGAGAGAAAACCGTAAATCTCTTCTCCGTTCACTCAATCAACCAAAGATGCGTGAGATTCTTCACATCCAGGGTGGTCAATGCGGTAACCAGATCGGAGCCAAGTTCTGGGAAGTGGTTTGCGCCGAGCACGGCATCGATCCAACCGGAAGGTACACCGGAGACTCAGATCTGCAACTTGAGCGCATCAACGTTTACTACAATGAAGCGAGTTGCGGTAGATTCGTTCCTCGTGCAGTGCTCATGGATTTGGAGCCTGGGACTATGGATAGTCTCAGATCTGGACCGTACGGTCAGACCTTTCGACCTGATAACTTCGTCTTTGGTCAATCCGGTGCGGGTAACAACTGGGCCAAGGGACACTACACTGAAGGAGCTGAACTAATCGATTCCGTTCTCGATGTTGTTCGTAAGGAAGCTGAGAACTGTGACTGCCTCCAAG