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BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR748
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr3:1946055-1946238 [+]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029588
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - CAGUCGACUUGGGAACCGAUUGGC - 24
Stem-loop(if miRNA) -- A    AC               CGUA UG U     GA  GGUAAAA        GAU  GC      AUA   AC     G     AG   AAAA
  C GUCG  UUGGGAACCGAUUGG    U  A CUAGU  GA       AAUUGAUU   CU  GAAUUU   UGG  UAGUU GACUG  CUA    A
  | ||||  |||||||||||||||    |  | |||||  ||       ||||||||   ||  ||||||   |||  ||||| |||||  |||    U
  G UAGC  GAUCCUUGGUUAACC    A  U GAUCA  CU       UUAGCUAA   GA  UUUAAA   AUC  GUCAA UUGAU  GGU    C
UA C    AA               ---- GU U     AA  -------        AUU  --      --A   GA     G     CA   AUAU
Stem-loop sequence CAGUCGACUUGGGAACCGAUUGGCGUAUUGAUCUAGUGAGAGGUAAAAAAUUGAUUGAUCUGCGAAUUUAUAUGGACUAGUUGGACUGAGCUAAAAAAUCUAUAUGGACUAGUUGAACUGAGCUAAAAAUUUAGUUAAAUCGAUUUCAAACUAGUUUGACCAAUUGGUUCCUAGAACGAUCGAU