Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_029387
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:23670828-23671602[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type intronic
Splice junction sequence GTTTTCGATCATTCAATTCACTTAATTAAATTATACACGCGTCGATTTGTTGAATAACGTTTTTGGAATGTTGCTCGATTCTGCAATTTCTGGTTAAAGCAGAACCCATTGAATTTATAAGATCCACAGGCTGTCTGATGTAGGACTGACTCCACTTTCATGGTTTTATTGAATGAGGCATTGGTTTAACATCTGTGGTT
Tissues root
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AG-GA
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTTTTCGATCATTCAATTCACTTAATTAAATTATACACGCGTCGATTTGTTGAATAACGTTTTTGGAATGTTGCTCGATTCTGCAATTTCTGGTTAAAGCAACTTTGGATTCAGAGTAATGGTAGTAGTAAGCTTTATCGAGTAATGGATGGCATTAATGGCGAGGATAATAAATCTTATTAGTTCAAGAAATTATAGAATGTGAATGGATACCTATTTTGGGGTGGAAGAACACTGCGATAAACAATGGGAAAGTAACCCCATATCTGGTAAATTAGTGGGAAAATTGCTCAGAACCCAATTTGGGGATGAAATTTTTTTGAAATTCGTGCGGTATAATCACAATCTCATCGTAACTTGAAGATTCAACCATATTTATGATATATATGAATTTTGTAGGTTTAAATGTTGCACAATTTCTTTGCTATACTTTGAAGGATTATTTCTTCGTATGAGTCAGTCTATACACATATTGGACATGGCTTGTTTTTTTTTCCTTTCTCTTATGTGTTTCTCCGCAGTGACTTGTTTTTCTTCAAGTAATTTGGTTAGGAGTAGAGGAATTATCTATGATTAGCAAAAATTCTATTAAACATTTTTGGTTTGGGAATACCTGTATGGCTTCAGCTACTTGATTTTGTTTCTCTGACCTTATCGTGATTAAGATATCATCTCAGAACCCATTGAATTTATAAGATCCACAGGCTGTCTGATGTAGGACTGACTCCACTTTCATGGTTTTATTGAATGAGGCATTGGTTTAACATCTGTGGTT