Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR705
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr3:91266324-91266421 [+]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029588
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 75 - CUGUAUCUGUAUCUGACUGUGCAU - 98
Stem-loop(if miRNA) --      -A     G     -      ---UG     C  AAACU  A  UAU
  GCGUAG  GGAUG GGGUA GGAUUC     CAUAU UA     GA UC   U
  ||||||  ||||| ||||| ||||||     ||||| ||     || ||
  CGUGUC  UCUAU UCUAU UCUAGG     GUAUA AU     CU AG   A
UA      AG     G     G      UCAAA     A  -----  A  UCU
Stem-loop sequence GCGUAGAGGAUGGGGGUAGGAUUCUGCAUAUCUAAAACUGAAUCUAUUAUCUGAAUCUAAAUAUGAAACUGGAUCUGUAUCUGUAUCUGACUGUGCAU