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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_029093
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:22683708-22689229[+/+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type exonic
Splice junction sequence CTTGTACTTCTTCTCTTTGAGACCGCTCTTCTCACTTCTGGTTTCAGCCTCGATGAGCCCAACACTTTCGGGAGCAGGATTCACAGGATGTTGAAGCTTGGTCGAGTAAGAAGACAATGGAGATTAATCCAGAGAACTCCATCATGGATGAGTTGAGAAAGCGAGCTGACGCAGACAAGAACGACAAGTCTGTGAAGGAC
Tissues leaf
Exon boundary No-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTTGTACTTCTTCTCTTTGAGACCGCTCTTCTCACTTCTGGTTTCAGCCTCGATGAGCCCAACACTTTCGGGAGCAGGATTCACAGGATGTTGAAGCTTGGATTGAGCATTGATGACGATGATGTTGTTGAAGCCGATGCTGACATGCCTCCACTTGAAGATGATGCCGATGCTGAAGGTAGCAAGATGGAGGAAGTTGACTAAATTATCACACACAGTCGACTTAATCATTAGGGGTGTTGAGACATTGGTTATCTTTTTATCTTTTTTTTTTATGTTTTCGTTTGAACTAATATTTTGGAACTATTTTCTGGAGTTTATTTCTTCTATCGCTTGTTTTCGTGAAGATTTTTTCTCTGAATTCGGTTTGATGACAAAGGTTCTCTTATGCACAATCTTGCAAATCCAAGCTTATTTTGGTTATGTAGCCTATAACTAAGTTATTAGTATGACTAATATGGCTAATAAAATACATGAAGCAGCTCCAAATCATATTGTTAAGCATCTCAGACAACACAGCTTACATATTCTTTACAATAATAAATAATTTATTGTTCGACATAATACTGTTGTTACTGTTTGACTTAGCGTTAATTTTCTGCACAAATGTTGTTACTACTTTGATTAAAAAGGATAATTTGTGTAACAATTTTTTGGTCAGTTTTAAAGGTTATTATTATTTTTTTAAATAACTTTTACGATTAGAATATGAGTAGTGCAACGCAAAATAACACTGCCGTTTAAGACGACGGTCCCTTGACAGAATCTTCATCAACGCTCGATTTGACGTCTGCCGATTTCCTTAGCTCCGACGTAAACCACTGATCGTCGGTATTCAGCTATATTTTGATTTCTCAGCTCCAAAAATTCCCAACGAAATGGAGAAAATGGCCAAAGGATGGTTTCCGATGAGCGGCACTAGTAGCAGCGGAGATCAGCAGCAGCAACCGCTGCAAACAGGAGGAACGTCTCTGCTAGCTGATTGGAATTCTTACGCAGCATCGAGAGATTTTGAAGAAGACACCGGAACTTTAGGCTTCGATATCGAATCCGCCGTTAGATCTGCCAACGACACTGTTTCCGGCACCTTTAATGTGTAATCCATCCATCTCTTTCTCTTAATCTTTAGGGGTTTAACGATTGATCGTGACCGTATCTGAGAAATTAGGCGTTTTCGCCTGCTATTGAGGATTGGATTGGTGTAAATTAAATCTGGAATCTGAGAAATTGTGATTAACCATATAGTTTAAGCTTTGCCAGATTCGTTGATCAGATTTACAAATTCTCAGGGTTTGAAGCTATTGTTAGTGAATGATTTTGATTAGTGTCTTCTCTCAATGACTTAGAATTGATTAAGAGTCTTAAGCATATCTTTTTCTTGAAGTGTTACTAACTTTTTGATTTTGAATTTTGTTGTACTCAAATCTGGATTGTTAACAGTGTTTCGAAAGGAGTTAGAGATAACCTGCAGTCTGCAACAAGTAGTATGCCTTCAGGAAAAGCTTTGATGTATTTCGGTTTACTTCTAGCAAGTGGTGTATTCTTCATCTTCATTGCCTTCACCATGTTTCTTCCAGTCATGGTGCTTATGCCACAGAAGTTTGCAATTTGTTTTACCCTTGGATGTGGATTTATCATCGGATCTTTCTTCGCTCTTCGTGGCCCGCAAAATCAACTCGCTCACATGTCATCGGCAGAGGTAATAACTAATAACAAAACCTTGTGTTGTGCAGCTTCTTATATCTGCTGTATTTCGTTTACATTTTTCTCTTTGGAATTTTAATTTCTTGTTTGCTGGCTTCTCCAGAGGCTTCCACTAACTTTAGGTTTCATTGCCACCATGGTTGGCACCATATATGTCTCGATGGTGCTCCATAGCTACATTCTCTCTGTGATTTTCTCTGCATTACAGGTACTTAAATTTCATCTTCCTTCCCGACTCTTGTTGGTGTTTATATCCTCTGTTTTTCATATGTTAAAATTTTCCTCTTCCCCATTTCACAAATCTTACCTATGAAGTTCTTTTTTACCCTGCATGTTTCATCTAGTAAGCTCTTGCCTCGTCGAAACATAATGTGTTTAGTAAAAAACATGTAGACTTTCTTATTGCTGTTTTAAAATACAAGTTGGGTTAGTATGAATTATGAAGAAGCCTTGAACGCCATATCTTTGGTTGGTCTCTTGGCTTGTTTTTGCAAATGCACTTACTTGCGACAGAAACAGCTTTGATATATTATTACTCACCCGTTATCGATATGGAATATATACTTTAAGAACTCACTAAATCATATCCTTCATGTCGGTTTAAAGATTAGTCACGTATCTGCACATTCTGTAAGTATAGTAATCTCATAAAAAACCTGGTCTCTGTTCTCTGTGAATCCATAGGTTATTGCACTGGCGTACTACTGTATATCATATTTCCCTGGTGGATCATCGGGAATGAAGTTCCTCAGTTCTACTCTTACCTCCTCTGTCTTCCGAATGTTTGGGAGATGAGCTTTCGCTTTGACCTATGCAAAGAAAATAACTTGATTCTCTCGTGTATAAAGAAAGATGAAAGATCTTCAACAGTGGTTAAATGACAAATCTGGTAAAATATGTTGGTCCAATGGCTCAAAGACAGTTTTGTTATAAATTTCCTATATTGATACTTTCTGCTAAATTGGTTCAAAACTTCAAATCACTAGCCACTGGATGAGGTATGGAACTTGAAGAGTTGCTTGGTGGATACATTCTCTAATCTAGGGTAAGTCGTTAGCTTCAATGTCTTACTGTGAATTATTACATCAGAATTAAGAAAGTTATTACACGTATGTTTTCACTGAGTTTACTACACTGGCAATGTGGCATACATCTCTTACTGCAAATTGCAGACAAGTGGTCAATCAAATCTTTTTTAGTTGGGCCCAAAATGTCTGTTATTGGATACGTTGGGCCTTAAAATGGCCCCCATCAGTCAAAAACATCACTGCTTGGAGAAGGATCTAGAAAAACTTGCAAGTTAGTTCAAACAAAATAAAGGAAAAAGAACGATCTAGAAGAAAGAAAAAAAAAGGAAAAGAAACCCTTATGGAGGTTCCCACACCACTCTATATATAATAACATCCTTCTCCTAAATCCCGCATCAGTACTTCTCTCTGCTCTCAAGATAATTTTGTTCTCTCAATTTCATTCTTAAACCCTAGTTCTTCGATTTTTTCCGATCTACGACAATGGCGGACGCTGAAACCTTTGCTTTCCAAGCTGAGATCAACCAGTTGCTTTCCCTCATCATCAATACCTTTTACTCTAACAAGGAGATCTTCCTCCGTGAACTCATCAGTAACTCTTCTGATGTACGATCTCTATCTCTCTCTACCTTATTGTATACTTGTGTATCTCGTTTGATTGATTTGGCGGATGGATCTGTAGATTTAGGTTTGGTTAGGGTTTAGTGTTCTTTCCGTTGGGAGAATTTTGGTTACTTACTGAAGTTGCGAAGCTTTTTGTGTACAAATCTATTGTTTAGGTTTAGTGTTGATACCAAGGATTTAAGTAGTTTCTTGTTAGATTACCAAGTTTTCGATTGCTTATAGTTGATTTGCATACATATTATGTGTATTGTTTGCTTACGATTGTGATTCTATTCTGGTGAAAACAGGCTTTGGACAAGATTAGATTCGAGTCCTTGACGGACAAGAGCAAGCTCGATGGTCAGCCTGAGCTCTTCATTCACATCATTCCCGACAAGACTAACAACACCTTGACCATTATTGATAGTGGTATTGGCATGACCAAGGCTGGTACGTAATTGATTTCATCCTAAATCAATTTGTTTCGATTTTGTTGTTGTTTGTTAGTCTTGCATCTGTGTTTGTTTTGTTGGCTAATTCGTGCTTCTTCTATTAGATTTGGTCAACAACCTTGGAACAATTGCAAGATCTGGAACCAAGGAATTCATGGAAGCACTGGCTGCTGGAGCTGATGTTAGCATGATTGGTCAGTTTGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTTGCTGACAAGGTTGTTGTTACTACCAAGCACAATGACGATGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCCGGGGGATCTTTCACTGTGACCAGAGACACCTCTGGGGAGACTCTTGGTAGAGGAACAAAGATGGTTCTTTACCTCAAGGAAGACCAGTTGGAGTACCTTGAGGAGCGAAGGCTTAAGGATTTGGTGAAGAAGCACTCTGAGTTCATCAGCTACCCAATCTCTCTCTGGATTGAGAAGACCATTGAGAAGGAGATCTCTGATGATGAAGAGGAGGAAGAGAAGAAGGATGAGGAAGGCAAGGTTGAGGAAGTTGATGAGGAGAAAGAAAAGGAGGAGAAGAAAAAGAAGAAGATTAAGGAGGTTTCTCATGAGTGGGATTTGGTGAACAAGCAGAAGCCTATCTGGATGAGGAAGCCAGAGGAGATCAACAAGGAGGAGTACGCTGCTTTCTACAAGAGTCTCAGCAATGATTGGGAGGAGCATTTGGCTGTGAAGCATTTCTCTGTTGAAGGACAGCTTGAGTTCAAAGCTATCCTCTTTGTTCCCAAGAGAGCTCCTTTTGATCTCTTTGACACTAAGAAGAAGCCCAACAACATCAAGCTCTATGTCCGTCGTGTCTTCATCATGGACAACTGTGAAGACATCATCCCTGAGTACCTCGGATTTGTGAAAGGTATTGTCGACTCTGAAGATCTTCCTCTCAACATCTCGAGAGAGACATTGCAGCAGAACAAGATCCTCAAGGTCATCCGCAAGAACCTTGTGAAGAAGTGCCTTGAGCTCTTCTTTGAGATTGCTGAGAACAAGGAAGACTACAACAAGTTCTACGAGGCTTTCTCTAAGAACCTGAAGCTCGGTATCCATGAGGACTCCCAAAACAGAACCAAGATTGCTGAGTTGCTCCGTTACCACTCAACCAAGAGCGGTGATGAATTGACTAGTCTCAAGGACTACGTGACAAGGATGAAGGAAGGT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