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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_029085
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:22682571-22688092[+/+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence GTTTCTCATGAGTGGGATTTGGTGAACAAGCAGAAACCGATTTGGATGAGGAAGCCAGAGGAGATCAACAAGGAGGAGTACGCTGCTTTCTACAAGAGTTTGATGAAGAGGAGGAAGAGAAGAAGGATGAGGAAGGCAAGGTTGAGGAAGTTGATGAGGAGAAAGAAAAGGAGGAGAAGAAAAAGAAGAAGATTAAGGAG
Tissues aerial
Exon boundary No-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTTTCTCATGAGTGGGATTTGGTGAACAAGCAGAAACCGATTTGGATGAGGAAGCCAGAGGAGATCAACAAGGAGGAGTACGCTGCTTTCTACAAGAGTTTGAGCAATGACTGGGAAGAGCATTTGGCTGTGAAGCATTTCTCAGTTGAAGGACAGCTTGAGTTCAAAGCTATCCTCTTTGTTCCCAAGAGAGCTCCTTTTGATCTCTTTGACACTAAGAAGAAGCCCAACAACATCAAGCTCTATGTCCGTCGTGTCTTCATCATGGACAACTGTGAAGACATCATTCCTGAGTACCTTGGGTTTGTCAAGGGTATTGTTGACTCTGAAGATCTTCCTCTCAACATCTCAAGAGAAACATTGCAGCAGAACAAGATCCTCAAGGTCATCCGCAAGAACCTTGTGAAGAAGTGTCTTGAGCTCTTCTTTGAGATTGCTGAGAACAAGGAGGACTACAACAAGTTCTATGAGGCTTTCTCTAAGAACCTGAAGCTCGGTATCCATGAGGACTCCCAAAACAGAACCAAGATTGCTGAGTTGCTCCGTTACCACTCAACCAAGAGCGGTGATGAATTGACCAGTCTCAAGGACTACGTGACAAGGATGAAGGAAGGTCAGAACGATATCTTCTATATCACTGGTGAGAGCAAGAAGGCTGTTGAGAACTCTCCATTCCTTGAGAAGCTCAAGAAGAAGGGTATTGAAGTTCTCTACATGGTTGACGCTATCGATGAGTATGCTATTGGTCAGCTCAAGGAATTCGAAGGAAAGAAGCTTGTCTCTGCAACCAAGGAAGGTCTGAAACTGGATGAGACTGAAGACGAGAAGAAGAAGAAAGAAGAGCTCAAGGAGAAGTTTGAGGGACTCTGCAAAGTGATCAAGGACGTTTTGGGAGACAAGGTTGAGAAGGTTATCGTCTCTGACCGTGTTGTGGACTCACCCTGCTGTCTTGTAACAGGCGAGTATGGCTGGACTGCAAACATGGAGAGGATCATGAAAGCTCAAGCCTTGAGAGACAGCAGCATGGGTGGCTACATGTCGAGCAAGAAGACAATGGAGATTAACCCAGAGAACTCCATCATGGATGAGCTGAGAAAGAGAGCTGATGCAGACAAGAACGACAAGTCTGTGAAGGACCTTGTACTTCTTCTCTTTGAGACCGCTCTTCTCACTTCTGGTTTCAGCCTCGATGAGCCCAACACTTTCGGGAGCAGGATTCACAGGATGTTGAAGCTTGGATTGAGCATTGATGACGATGATGTTGTTGAAGCCGATGCTGACATGCCTCCACTTGAAGATGATGCCGATGCTGAAGGTAGCAAGATGGAGGAAGTTGACTAAATTATCACACACAGTCGACTTAATCATTAGGGGTGTTGAGACATTGGTTATCTTTTTATCTTTTTTTTTTATGTTTTCGTTTGAACTAATATTTTGGAACTATTTTCTGGAGTTTATTTCTTCTATCGCTTGTTTTCGTGAAGATTTTTTCTCTGAATTCGGTTTGATGACAAAGGTTCTCTTATGCACAATCTTGCAAATCCAAGCTTATTTTGGTTATGTAGCCTATAACTAAGTTATTAGTATGACTAATATGGCTAATAAAATACATGAAGCAGCTCCAAATCATATTGTTAAGCATCTCAGACAACACAGCTTACATATTCTTTACAATAATAAATAATTTATTGTTCGACATAATACTGTTGTTACTGTTTGACTTAGCGTTAATTTTCTGCACAAATGTTGTTACTACTTTGATTAAAAAGGATAATTTGTGTAACAATTTTTTGGTCAGTTTTAAAGGTTATTATTATTTTTTTAAATAACTTTTACGATTAGAATATGAGTAGTGCAACGCAAAATAACACTGCCGTTTAAGACGACGGTCCCTTGACAGAATCTTCATCAACGCTCGATTTGACGTCTGCCGATTTCCTTAGCTCCGACGTAAACCACTGATCGTCGGTATTCAGCTATATTTTGATTTCTCAGCTCCAAAAATTCCCAACGAAATGGAGAAAATGGCCAAAGGATGGTTTCCGATGAGCGGCACTAGTAGCAGCGGAGATCAGCAGCAGCAACCGCTGCAAACAGGAGGAACGTCTCTGCTAGCTGATTGGAATTCTTACGCAGCATCGAGAGATTTTGAAGAAGACACCGGAACTTTAGGCTTCGATATCGAATCCGCCGTTAGATCTGCCAACGACACTGTTTCCGGCACCTTTAATGTGTAATCCATCCATCTCTTTCTCTTAATCTTTAGGGGTTTAACGATTGATCGTGACCGTATCTGAGAAATTAGGCGTTTTCGCCTGCTATTGAGGATTGGATTGGTGTAAATTAAATCTGGAATCTGAGAAATTGTGATTAACCATATAGTTTAAGCTTTGCCAGATTCGTTGATCAGATTTACAAATTCTCAGGGTTTGAAGCTATTGTTAGTGAATGATTTTGATTAGTGTCTTCTCTCAATGACTTAGAATTGATTAAGAGTCTTAAGCATATCTTTTTCTTGAAGTGTTACTAACTTTTTGATTTTGAATTTTGTTGTACTCAAATCTGGATTGTTAACAGTGTTTCGAAAGGAGTTAGAGATAACCTGCAGTCTGCAACAAGTAGTATGCCTTCAGGAAAAGCTTTGATGTATTTCGGTTTACTTCTAGCAAGTGGTGTATTCTTCATCTTCATTGCCTTCACCATGTTTCTTCCAGTCATGGTGCTTATGCCACAGAAGTTTGCAATTTGTTTTACCCTTGGATGTGGATTTATCATCGGATCTTTCTTCGCTCTTCGTGGCCCGCAAAATCAACTCGCTCACATGTCATCGGCAGAGGTAATAACTAATAACAAAACCTTGTGTTGTGCAGCTTCTTATATCTGCTGTATTTCGTTTACATTTTTCTCTTTGGAATTTTAATTTCTTGTTTGCTGGCTTCTCCAGAGGCTTCCACTAACTTTAGGTTTCATTGCCACCATGGTTGGCACCATATATGTCTCGATGGTGCTCCATAGCTACATTCTCTCTGTGATTTTCTCTGCATTACAGGTACTTAAATTTCATCTTCCTTCCCGACTCTTGTTGGTGTTTATATCCTCTGTTTTTCATATGTTAAAATTTTCCTCTTCCCCATTTCACAAATCTTACCTATGAAGTTCTTTTTTACCCTGCATGTTTCATCTAGTAAGCTCTTGCCTCGTCGAAACATAATGTGTTTAGTAAAAAACATGTAGACTTTCTTATTGCTGTTTTAAAATACAAGTTGGGTTAGTATGAATTATGAAGAAGCCTTGAACGCCATATCTTTGGTTGGTCTCTTGGCTTGTTTTTGCAAATGCACTTACTTGCGACAGAAACAGCTTTGATATATTATTACTCACCCGTTATCGATATGGAATATATACTTTAAGAACTCACTAAATCATATCCTTCATGTCGGTTTAAAGATTAGTCACGTATCTGCACATTCTGTAAGTATAGTAATCTCATAAAAAACCTGGTCTCTGTTCTCTGTGAATCCATAGGTTATTGCACTGGCGTACTACTGTATATCATATTTCCCTGGTGGATCATCGGGAATGAAGTTCCTCAGTTCTACTCTTACCTCCTCTGTCTTCCGAATGTTTGGGAGATGAGCTTTCGCTTTGACCTATGCAAAGAAAATAACTTGATTCTCTCGTGTATAAAGAAAGATGAAAGATCTTCAACAGTGGTTAAATGACAAATCTGGTAAAATATGTTGGTCCAATGGCTCAAAGACAGTTTTGTTATAAATTTCCTATATTGATACTTTCTGCTAAATTGGTTCAAAACTTCAAATCACTAGCCACTGGATGAGGTATGGAACTTGAAGAGTTGCTTGGTGGATACATTCTCTAATCTAGGGTAAGTCGTTAGCTTCAATGTCTTACTGTGAATTATTACATCAGAATTAAGAAAGTTATTACACGTATGTTTTCACTGAGTTTACTACACTGGCAATGTGGCATACATCTCTTACTGCAAATTGCAGACAAGTGGTCAATCAAATCTTTTTTAGTTGGGCCCAAAATGTCTGTTATTGGATACGTTGGGCCTTAAAATGGCCCCCATCAGTCAAAAACATCACTGCTTGGAGAAGGATCTAGAAAAACTTGCAAGTTAGTTCAAACAAAATAAAGGAAAAAGAACGATCTAGAAGAAAGAAAAAAAAAGGAAAAGAAACCCTTATGGAGGTTCCCACACCACTCTATATATAATAACATCCTTCTCCTAAATCCCGCATCAGTACTTCTCTCTGCTCTCAAGATAATTTTGTTCTCTCAATTTCATTCTTAAACCCTAGTTCTTCGATTTTTTCCGATCTACGACAATGGCGGACGCTGAAACCTTTGCTTTCCAAGCTGAGATCAACCAGTTGCTTTCCCTCATCATCAATACCTTTTACTCTAACAAGGAGATCTTCCTCCGTGAACTCATCAGTAACTCTTCTGATGTACGATCTCTATCTCTCTCTACCTTATTGTATACTTGTGTATCTCGTTTGATTGATTTGGCGGATGGATCTGTAGATTTAGGTTTGGTTAGGGTTTAGTGTTCTTTCCGTTGGGAGAATTTTGGTTACTTACTGAAGTTGCGAAGCTTTTTGTGTACAAATCTATTGTTTAGGTTTAGTGTTGATACCAAGGATTTAAGTAGTTTCTTGTTAGATTACCAAGTTTTCGATTGCTTATAGTTGATTTGCATACATATTATGTGTATTGTTTGCTTACGATTGTGATTCTATTCTGGTGAAAACAGGCTTTGGACAAGATTAGATTCGAGTCCTTGACGGACAAGAGCAAGCTCGATGGTCAGCCTGAGCTCTTCATTCACATCATTCCCGACAAGACTAACAACACCTTGACCATTATTGATAGTGGTATTGGCATGACCAAGGCTGGTACGTAATTGATTTCATCCTAAATCAATTTGTTTCGATTTTGTTGTTGTTTGTTAGTCTTGCATCTGTGTTTGTTTT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