ncRNA ID |
ath_circ_029080 |
Species |
Arabidopsis thaliana |
Class |
circRNA |
Genome position |
5:22681836-22687045[+/+] |
Reference genome |
TAIR10 |
Source |
PlantcircBase
|
Method |
find_circ/NA |
Type |
exonic |
Splice junction sequence |
GCTTTGGACAAGATTAGGTTTGAGTCCTTGACAGACAAGAGCAAGCTCGATGGTCAGCCAGAGCTCTTCATTCACATCATTCCCGACAAGACTAACAACATTTCCAAGCTGAGATCAACCAGTTGCTTTCCCTCATCATCAATACCTTTTACTCTAACAAGGAGATCTTCCTCCGTGAACTCATCAGTAACTCTTCTGAT |
Tissues |
leaf/root, leaf, aerial, inflorescences, seed, whole_plant |
Exon boundary |
Yes-Yes |
Splicing signals |
AG-GT |
circRNA sequence |
NA |
Genomic sequence |
GCTTTGGACAAGATTAGGTTTGAGTCCTTGACAGACAAGAGCAAGCTCGATGGTCAGCCAGAGCTCTTCATTCACATCATTCCCGACAAGACTAACAACACCTTGACGATTATCGATAGTGGTATTGGGATGACCAAGGCTGGTACGTAATTGATTTCAGTCAAAAGCAATTTGTATTGGTTTTCGTTGATTATTTATGTGTTTGGTGTGTTGGCTAATACGTTTTTGTTTTATTTTTCAGATCTGGTGAACAACCTTGGAACAATTGCAAGATCTGGAACCAAAGAATTCATGGAGGCGTTGGCTGCTGGAGCTGATGTTAGCATGATTGGACAGTTTGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTTGCTGACAAGGTTGTTGTTACTACCAAGCACAATGACGATGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCCGGTGGATCTTTCACCGTCACCAGAGACACCTCTGGTGAGGCTCTTGGTAGAGGAACTAAGATGGTCCTTTACCTCAAGGAAGACCAGATGGAGTACATTGAGGAGCGAAGGCTTAAGGATTTGGTGAAGAAGCACTCTGAGTTCATCAGCTACCCAATCTCTCTCTGGATTGAGAAGACCATTGAGAAGGAGATCTCTGATGATGAAGAGGAGGAAGAGAAGAAGGATGAGGAAGGCAAGGTTGAGGAAGTTGATGAGGAGAAAGAAAAGGAGGAGAAGAAAAAGAAGAAGATTAAGGAGGTTTCTCATGAGTGGGATTTGGTGAACAAGCAGAAACCGATTTGGATGAGGAAGCCAGAGGAGATCAACAAGGAGGAGTACGCTGCTTTCTACAAGAGTTTGAGCAATGACTGGGAAGAGCATTTGGCTGTGAAGCATTTCTCAGTTGAAGGACAGCTTGAGTTCAAAGCTATCCTCTTTGTTCCCAAGAGAGCTCCTTTTGATCTCTTTGACACTAAGAAGAAGCCCAACAACATCAAGCTCTATGTCCGTCGTGTCTTCATCATGGACAACTGTGAAGACATCATTCCTGAGTACCTTGGGTTTGTCAAGGGTATTGTTGACTCTGAAGATCTTCCTCTCAACATCTCAAGAGAAACATTGCAGCAGAACAAGATCCTCAAGGTCATCCGCAAGAACCTTGTGAAGAAGTGTCTTGAGCTCTTCTTTGAGATTGCTGAGAACAAGGAGGACTACAACAAGTTCTATGAGGCTTTCTCTAAGAACCTGAAGCTCGGTATCCATGAGGACTCCCAAAACAGAACCAAGATTGCTGAGTTGCTCCGTTACCACTCAACCAAGAGCGGTGATGAATTGACCAGTCTCAAGGACTACGTGACAAGGATGAAGGAAGGTCAGAACGATATCTTCTATATCACTGGTGAGAGCAAGAAGGCTGTTGAGAACTCTCCATTCCTTGAGAAGCTCAAGAAGAAGGGTATTGAAGTTCTCTACATGGTTGACGCTATCGATGAGTATGCTATTGGTCAGCTCAAGGAATTCGAAGGAAAGAAGCTTGTCTCTGCAACCAAGGAAGGTCTGAAACTGGATGAGACTGAAGACGAGAAGAAGAAGAAAGAAGAGCTCAAGGAGAAGTTTGAGGGACTCTGCAAAGTGATCAAGGACGTTTTGGGAGACAAGGTTGAGAAGGTTATCGTCTCTGACCGTGTTGTGGACTCACCCTGCTGTCTTGTAACAGGCGAGTATGGCTGGACTGCAAACATGGAGAGGATCATGAAAGCTCAAGCCTTGAGAGACAGCAGCATGGGTGGCTACATGTCGAGCAAGAAGACAATGGAGATTAACCCAGAGAACTCCATCATGGATGAGCTGAGAAAGAGAGCTGATGCAGACAAGAACGACAAGTCTGTGAAGGACCTTGTACTTCTTCTCTTTGAGACCGCTCTTCTCACTTCTGGTTTCAGCCTCGATGAGCCCAACACTTTCGGGAGCAGGATTCACAGGATGTTGAAGCTTGGATTGAGCATTGATGACGATGATGTTGTTGAAGCCGATGCTGACATGCCTCCACTTGAAGATGATGCCGATGCTGAAGGTAGCAAGATGGAGGAAGTTGACTAAATTATCACACACAGTCGACTTAATCATTAGGGGTGTTGAGACATTGGTTATCTTTTTATCTTTTTTTTTTATGTTTTCGTTTGAACTAATATTTTGGAACTATTTTCTGGAGTTTATTTCTTCTATCGCTTGTTTTCGTGAAGATTTTTTCTCTGAATTCGGTTTGATGACAAAGGTTCTCTTATGCACAATCTTGCAAATCCAAGCTTATTTTGGTTATGTAGCCTATAACTAAGTTATTAGTATGACTAATATGGCTAATAAAATACATGAAGCAGCTCCAAATCATATTGTTAAGCATCTCAGACAACACAGCTTACATATTCTTTACAATAATAAATAATTTATTGTTCGACATAATACTGTTGTTACTGTTTGACTTAGCGTTAATTTTCTGCACAAATGTTGTTACTACTTTGATTAAAAAGGATAATTTGTGTAACAATTTTTTGGTCAGTTTTAAAGGTTATTATTATTTTTTTAAATAACTTTTACGATTAGAATATGAGTAGTGCAACGCAAAATAACACTGCCGTTTAAGACGACGGTCCCTTGACAGAATCTTCATCAACGCTCGATTTGACGTCTGCCGATTTCCTTAGCTCCGACGTAAACCACTGATCGTCGGTATTCAGCTATATTTTGATTTCTCAGCTCCAAAAATTCCCAACGAAATGGAGAAAATGGCCAAAGGATGGTTTCCGATGAGCGGCACTAGTAGCAGCGGAGATCAGCAGCAGCAACCGCTGCAAACAGGAGGAACGTCTCTGCTAGCTGATTGGAATTCTTACGCAGCATCGAGAGATTTTGAAGAAGACACCGGAACTTTAGGCTTCGATATCGAATCCGCCGTTAGATCTGCCAACGACACTGTTTCCGGCACCTTTAATGTGTAATCCATCCATCTCTTTCTCTTAATCTTTAGGGGTTTAACGATTGATCGTGACCGTATCTGAGAAATTAGGCGTTTTCGCCTGCTATTGAGGATTGGATTGGTGTAAATTAAATCTGGAATCTGAGAAATTGTGATTAACCATATAGTTTAAGCTTTGCCAGATTCGTTGATCAGATTTACAAATTCTCAGGGTTTGAAGCTATTGTTAGTGAATGATTTTGATTAGTGTCTTCTCTCAATGACTTAGAATTGATTAAGAGTCTTAAGCATATCTTTTTCTTGAAGTGTTACTAACTTTTTGATTTTGAATTTTGTTGTACTCAAATCTGGATTGTTAACAGTGTTTCGAAAGGAGTTAGAGATAACCTGCAGTCTGCAACAAGTAGTATGCCTTCAGGAAAAGCTTTGATGTATTTCGGTTTACTTCTAGCAAGTGGTGTATTCTTCATCTTCATTGCCTTCACCATGTTTCTTCCAGTCATGGTGCTTATGCCACAGAAGTTTGCAATTTGTTTTACCCTTGGATGTGGATTTATCATCGGATCTTTCTTCGCTCTTCGTGGCCCGCAAAATCAACTCGCTCACATGTCATCGGCAGAGGTAATAACTAATAACAAAACCTTGTGTTGTGCAGCTTCTTATATCTGCTGTATTTCGTTTACATTTTTCTCTTTGGAATTTTAATTTCTTGTTTGCTGGCTTCTCCAGAGGCTTCCACTAACTTTAGGTTTCATTGCCACCATGGTTGGCACCATATATGTCTCGATGGTGCTCCATAGCTACATTCTCTCTGTGATTTTCTCTGCATTACAGGTACTTAAATTTCATCTTCCTTCCCGACTCTTGTTGGTGTTTATATCCTCTGTTTTTCATATGTTAAAATTTTCCTCTTCCCCATTTCACAAATCTTACCTATGAAGTTCTTTTTTACCCTGCATGTTTCATCTAGTAAGCTCTTGCCTCGTCGAAACATAATGTGTTTAGTAAAAAACATGTAGACTTTCTTATTGCTGTTTTAAAATACAAGTTGGGTTAGTATGAATTATGAAGAAGCCTTGAACGCCATATCTTTGGTTGGTCTCTTGGCTTGTTTTTGCAAATGCACTTACTTGCGACAGAAACAGCTTTGATATATTATTACTCACCCGTTATCGATATGGAATATATACTTTAAGAACTCACTAAATCATATCCTTCATGTCGGTTTAAAGATTAGTCACGTATCTGCACATTCTGTAAGTATAGTAATCTCATAAAAAACCTGGTCTCTGTTCTCTGTGAATCCATAGGTTATTGCACTGGCGTACTACTGTATATCATATTTCCCTGGTGGATCATCGGGAATGAAGTTCCTCAGTTCTACTCTTACCTCCTCTGTCTTCCGAATGTTTGGGAGATGAGCTTTCGCTTTGACCTATGCAAAGAAAATAACTTGATTCTCTCGTGTATAAAGAAAGATGAAAGATCTTCAACAGTGGTTAAATGACAAATCTGGTAAAATATGTTGGTCCAATGGCTCAAAGACAGTTTTGTTATAAATTTCCTATATTGATACTTTCTGCTAAATTGGTTCAAAACTTCAAATCACTAGCCACTGGATGAGGTATGGAACTTGAAGAGTTGCTTGGTGGATACATTCTCTAATCTAGGGTAAGTCGTTAGCTTCAATGTCTTACTGTGAATTATTACATCAGAATTAAGAAAGTTATTACACGTATGTTTTCACTGAGTTTACTACACTGGCAATGTGGCATACATCTCTTACTGCAAATTGCAGACAAGTGGTCAATCAAATCTTTTTTAGTTGGGCCCAAAATGTCTGTTATTGGATACGTTGGGCCTTAAAATGGCCCCCATCAGTCAAAAACATCACTGCTTGGAGAAGGATCTAGAAAAACTTGCAAGTTAGTTCAAACAAAATAAAGGAAAAAGAACGATCTAGAAGAAAGAAAAAAAAAGGAAAAGAAACCCTTATGGAGGTTCCCACACCACTCTATATATAATAACATCCTTCTCCTAAATCCCGCAT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